RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513246.5

CANX-217, Transcript of calnexin, humanhuman

TSL 5

Gene CANX, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANX-217ENST00000513246 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.4■■■■■ 4.7
CANX-217ENST00000513246 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.59■■■■□ 3.93
CANX-217ENST00000513246 ABCC9O60706 1549 aa39.05■■■■□ 3.84
CANX-217ENST00000513246 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.3■■■■□ 3.56
CANX-217ENST00000513246 NACADO15069 1562 aa37.24■■■■□ 3.55
CANX-217ENST00000513246 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.02■■■■□ 3.52
CANX-217ENST00000513246 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.99■■■■□ 3.51
CANX-217ENST00000513246 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
CANX-217ENST00000513246 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.8■■■■□ 3.48
CANX-217ENST00000513246 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.76■■■■□ 3.48
CANX-217ENST00000513246 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.48■■■■□ 3.43
CANX-217ENST00000513246 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.43■■■■□ 3.42
CANX-217ENST00000513246 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.22■■■■□ 3.39
CANX-217ENST00000513246 SCRIBQ14160 1630 aa36.06■■■■□ 3.36
CANX-217ENST00000513246 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.84■■■■□ 3.33
CANX-217ENST00000513246 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
CANX-217ENST00000513246 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.24■■■■□ 3.23
CANX-217ENST00000513246 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.17■■■■□ 3.22
CANX-217ENST00000513246 SMARCA4P51532 1647 aa34.5■■■■□ 3.11
CANX-217ENST00000513246 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
CANX-217ENST00000513246 NCAPD3P42695 1498 aa34.35■■■■□ 3.09
CANX-217ENST00000513246 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.34■■■■□ 3.09
CANX-217ENST00000513246 SMARCA2P51531 1590 aa34.3■■■■□ 3.08
CANX-217ENST00000513246 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.21■■■■□ 3.07
CANX-217ENST00000513246 HMGXB3Q12766 1538 aa34.2■■■■□ 3.06
CANX-217ENST00000513246 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.19■■■■□ 3.06
CANX-217ENST00000513246 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
CANX-217ENST00000513246 WIZO95785 1651 aa33.83■■■■□ 3.01
CANX-217ENST00000513246 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.76■■■□□ 2.99
CANX-217ENST00000513246 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.73■■■□□ 2.99
CANX-217ENST00000513246 ERCC6Q03468 1493 aa33.66■■■□□ 2.98
CANX-217ENST00000513246 CUX2O14529 1486 aa33.61■■■□□ 2.97
CANX-217ENST00000513246 NESP48681 1621 aa33.57■■■□□ 2.97
CANX-217ENST00000513246 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
CANX-217ENST00000513246 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.47■■■□□ 2.95
CANX-217ENST00000513246 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.32■■■□□ 2.92
CANX-217ENST00000513246 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.23■■■□□ 2.91
CANX-217ENST00000513246 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.18■■■□□ 2.9
CANX-217ENST00000513246 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
CANX-217ENST00000513246 CFTRP13569 1480 aa33.12■■■□□ 2.89
CANX-217ENST00000513246 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.06■■■□□ 2.88
CANX-217ENST00000513246 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.94■■■□□ 2.86
CANX-217ENST00000513246 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.93■■■□□ 2.86
CANX-217ENST00000513246 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.93■■■□□ 2.86
CANX-217ENST00000513246 PRDM2Q13029 1718 aa32.88■■■□□ 2.85
CANX-217ENST00000513246 WDR62O43379 1518 aa32.84■■■□□ 2.85
CANX-217ENST00000513246 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
CANX-217ENST00000513246 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
CANX-217ENST00000513246 TOPBP1Q92547 1522 aa32.41■■■□□ 2.78
CANX-217ENST00000513246 ABCC8Q09428 1581 aa32.39■■■□□ 2.78
CANX-217ENST00000513246 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.37■■■□□ 2.77
CANX-217ENST00000513246 IFT140Q96RY7 1462 aa32.24■■■□□ 2.75
CANX-217ENST00000513246 TRIM41Q8WV44 630 aa32.2■■■□□ 2.75
CANX-217ENST00000513246 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
CANX-217ENST00000513246 OSCARQ8IYS5 282 aa32.13■■■□□ 2.73
CANX-217ENST00000513246 CUX1P39880 1505 aa32.12■■■□□ 2.73
CANX-217ENST00000513246 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
CANX-217ENST00000513246 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
CANX-217ENST00000513246 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.02■■■□□ 2.72
CANX-217ENST00000513246 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
CANX-217ENST00000513246 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.97■■■□□ 2.71
CANX-217ENST00000513246 SOGA1O94964 1423 aa31.95■■■□□ 2.71
CANX-217ENST00000513246 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.89■■■□□ 2.79e-10■■■□□ 16.2
CANX-217ENST00000513246 WDR97A6NE52 1622 aa31.84■■■□□ 2.69
CANX-217ENST00000513246 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.82■■■□□ 2.68
CANX-217ENST00000513246 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.81■■■□□ 2.68
CANX-217ENST00000513246 TOP2BQ02880 1626 aa31.79■■■□□ 2.68
CANX-217ENST00000513246 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
CANX-217ENST00000513246 SYNJ1O43426 1573 aa31.77■■■□□ 2.68
CANX-217ENST00000513246 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.71■■■□□ 2.67
CANX-217ENST00000513246 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.67■■■□□ 2.66
CANX-217ENST00000513246 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.67■■■□□ 2.66
CANX-217ENST00000513246 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.67■■■□□ 2.66
CANX-217ENST00000513246 GRIN2BQ13224 1484 aa31.63■■■□□ 2.65
CANX-217ENST00000513246 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.63■■■□□ 2.65
CANX-217ENST00000513246 CHD1O14646 1710 aa31.63■■■□□ 2.65
CANX-217ENST00000513246 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.61■■■□□ 2.65
CANX-217ENST00000513246 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.6■■■□□ 2.65
CANX-217ENST00000513246 ARHGEF11O15085 1522 aa31.59■■■□□ 2.65
CANX-217ENST00000513246 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
CANX-217ENST00000513246 PBRM1Q86U86 1689 aa31.57■■■□□ 2.65
CANX-217ENST00000513246 FBLN2P98095 1184 aa31.5■■■□□ 2.63
CANX-217ENST00000513246 SYNJ2O15056 1496 aa31.45■■■□□ 2.62
CANX-217ENST00000513246 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.41■■■□□ 2.62
CANX-217ENST00000513246 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
CANX-217ENST00000513246 ADAMTS12P58397 1594 aa31.33■■■□□ 2.61
CANX-217ENST00000513246 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.33■■■□□ 2.61
CANX-217ENST00000513246 ARAP1Q96P48 1450 aa31.31■■■□□ 2.6
CANX-217ENST00000513246 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.29■■■□□ 2.6
CANX-217ENST00000513246 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.24■■■□□ 2.59
CANX-217ENST00000513246 GRIN2AQ12879 1464 aa31.23■■■□□ 2.59
CANX-217ENST00000513246 KIF27Q86VH2 1401 aa31.16■■■□□ 2.58
CANX-217ENST00000513246 NUP160Q12769 1436 aa31.12■■■□□ 2.57
CANX-217ENST00000513246 CEP170Q5SW79 1584 aa31.09■■■□□ 2.57
CANX-217ENST00000513246 IGF1RP08069 1367 aa31.06■■■□□ 2.56
CANX-217ENST00000513246 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
CANX-217ENST00000513246 CUL7Q14999 1698 aa31.02■■■□□ 2.56
CANX-217ENST00000513246 SHROOM2Q13796 1616 aa30.92■■■□□ 2.54
CANX-217ENST00000513246 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.88■■■□□ 2.53
CANX-217ENST00000513246 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.86■■■□□ 2.53
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