RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.04■■■■■ 5.76
ACTB-211ENST00000480301 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.31■■■■■ 4.84
ACTB-211ENST00000480301 ABCC9O60706 1549 aa44.51■■■■■ 4.72
ACTB-211ENST00000480301 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.73■■■■■ 4.43
ACTB-211ENST00000480301 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.72■■■■■ 4.43
ACTB-211ENST00000480301 NACADO15069 1562 aa42.68■■■■■ 4.42
ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
ACTB-211ENST00000480301 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.41■■■■■ 4.38
ACTB-211ENST00000480301 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.21■■■■■ 4.35
ACTB-211ENST00000480301 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.71■■■■■ 4.27
ACTB-211ENST00000480301 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.64■■■■■ 4.26
ACTB-211ENST00000480301 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.48■■■■■ 4.23
ACTB-211ENST00000480301 SCRIBQ14160 1630 aa41.38■■■■■ 4.21
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.02■■■■■ 4.16
ACTB-211ENST00000480301 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.99■■■■■ 4.15
ACTB-211ENST00000480301 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
ACTB-211ENST00000480301 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.23■■■■■ 4.03
ACTB-211ENST00000480301 CECR2Q9BXF3 1484 aa40■■■■□ 3.99
ACTB-211ENST00000480301 SMARCA4P51532 1647 aa39.58■■■■□ 3.93
ACTB-211ENST00000480301 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
ACTB-211ENST00000480301 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.44■■■■□ 3.9
ACTB-211ENST00000480301 NCAPD3P42695 1498 aa39.43■■■■□ 3.9
ACTB-211ENST00000480301 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.35■■■■□ 3.89
ACTB-211ENST00000480301 SMARCA2P51531 1590 aa39.33■■■■□ 3.89
ACTB-211ENST00000480301 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.21■■■■□ 3.87
ACTB-211ENST00000480301 HMGXB3Q12766 1538 aa39.18■■■■□ 3.86
ACTB-211ENST00000480301 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.85
ACTB-211ENST00000480301 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.89■■■■□ 3.82
ACTB-211ENST00000480301 WIZO95785 1651 aa38.88■■■■□ 3.81
ACTB-211ENST00000480301 NESP48681 1621 aa38.51■■■■□ 3.76
ACTB-211ENST00000480301 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
ACTB-211ENST00000480301 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.33■■■■□ 3.73
ACTB-211ENST00000480301 ERCC6Q03468 1493 aa38.33■■■■□ 3.73
ACTB-211ENST00000480301 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.29■■■■□ 3.72
ACTB-211ENST00000480301 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.12■■■■□ 3.69
ACTB-211ENST00000480301 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.07■■■■□ 3.68
ACTB-211ENST00000480301 CFTRP13569 1480 aa38.03■■■■□ 3.68
ACTB-211ENST00000480301 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.97■■■■□ 3.67
ACTB-211ENST00000480301 CUX2O14529 1486 aa37.96■■■■□ 3.67
ACTB-211ENST00000480301 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
ACTB-211ENST00000480301 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
ACTB-211ENST00000480301 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.82■■■■□ 3.64
ACTB-211ENST00000480301 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.75■■■■□ 3.63
ACTB-211ENST00000480301 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.73■■■■□ 3.63
ACTB-211ENST00000480301 WDR62O43379 1518 aa37.6■■■■□ 3.61
ACTB-211ENST00000480301 PRDM2Q13029 1718 aa37.59■■■■□ 3.61
ACTB-211ENST00000480301 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
ACTB-211ENST00000480301 TOPBP1Q92547 1522 aa37.2■■■■□ 3.55
ACTB-211ENST00000480301 ABCC8Q09428 1581 aa37.17■■■■□ 3.54
ACTB-211ENST00000480301 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.12■■■■□ 3.53
ACTB-211ENST00000480301 IFT140Q96RY7 1462 aa36.99■■■■□ 3.51
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.96■■■■□ 3.51
ACTB-211ENST00000480301 CUX1P39880 1505 aa36.9■■■■□ 3.5
ACTB-211ENST00000480301 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
ACTB-211ENST00000480301 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
ACTB-211ENST00000480301 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
ACTB-211ENST00000480301 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.79■■■■□ 3.48
ACTB-211ENST00000480301 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.76■■■■□ 3.48
ACTB-211ENST00000480301 SOGA1O94964 1423 aa36.76■■■■□ 3.47
ACTB-211ENST00000480301 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.65■■■■□ 3.464e-16■■■■■ 44.2
ACTB-211ENST00000480301 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.65■■■■□ 3.463e-23■■□□□ 11.8
ACTB-211ENST00000480301 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
ACTB-211ENST00000480301 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
ACTB-211ENST00000480301 SYNJ1O43426 1573 aa36.54■■■■□ 3.44
ACTB-211ENST00000480301 TOP2BQ02880 1626 aa36.54■■■■□ 3.44
ACTB-211ENST00000480301 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.52■■■■□ 3.44
ACTB-211ENST00000480301 WDR97A6NE52 1622 aa36.45■■■■□ 3.42
ACTB-211ENST00000480301 OSCARQ8IYS5 282 aa36.44■■■■□ 3.42
ACTB-211ENST00000480301 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.43■■■■□ 3.42
ACTB-211ENST00000480301 GRIN2BQ13224 1484 aa36.31■■■■□ 3.4
ACTB-211ENST00000480301 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.31■■■■□ 3.4
ACTB-211ENST00000480301 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.27■■■■□ 3.4
ACTB-211ENST00000480301 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.25■■■■□ 3.39
ACTB-211ENST00000480301 FBLN2P98095 1184 aa36.21■■■■□ 3.39
ACTB-211ENST00000480301 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
ACTB-211ENST00000480301 CHD1O14646 1710 aa36.16■■■■□ 3.38
ACTB-211ENST00000480301 PBRM1Q86U86 1689 aa36.15■■■■□ 3.38
ACTB-211ENST00000480301 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
ACTB-211ENST00000480301 SYNJ2O15056 1496 aa36.08■■■■□ 3.37
ACTB-211ENST00000480301 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.97■■■■□ 3.35
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS12P58397 1594 aa35.9■■■■□ 3.34
ACTB-211ENST00000480301 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.9■■■■□ 3.34
ACTB-211ENST00000480301 KIF27Q86VH2 1401 aa35.88■■■■□ 3.33
ACTB-211ENST00000480301 GRIN2AQ12879 1464 aa35.84■■■■□ 3.33
ACTB-211ENST00000480301 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.83■■■■□ 3.33
ACTB-211ENST00000480301 IGF1RP08069 1367 aa35.81■■■■□ 3.32
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF11O15085 1522 aa35.8■■■■□ 3.32
ACTB-211ENST00000480301 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.79■■■■□ 3.32
ACTB-211ENST00000480301 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.79■■■■□ 3.32
ACTB-211ENST00000480301 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.79■■■■□ 3.32
ACTB-211ENST00000480301 TRIM41Q8WV44 630 aa35.76■■■■□ 3.32
ACTB-211ENST00000480301 NUP160Q12769 1436 aa35.71■■■■□ 3.31
ACTB-211ENST00000480301 CEP170Q5SW79 1584 aa35.66■■■■□ 3.3
ACTB-211ENST00000480301 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.58■■■■□ 3.29
ACTB-211ENST00000480301 CUL7Q14999 1698 aa35.58■■■■□ 3.29
ACTB-211ENST00000480301 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.56■■■■□ 3.28
ACTB-211ENST00000480301 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.53■■■■□ 3.28
ACTB-211ENST00000480301 ARAP1Q96P48 1450 aa35.53■■■■□ 3.28
ACTB-211ENST00000480301 SHROOM2Q13796 1616 aa35.39■■■■□ 3.26
ACTB-211ENST00000480301 JPH4Q96JJ6 628 aa35.38■■■■□ 3.25
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