RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.26■■■■□ 3.72
ACTB-206ENST00000443528 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.95■■■■□ 3.03
ACTB-206ENST00000443528 ABCC9O60706 1549 aa33.28■■■□□ 2.92
ACTB-206ENST00000443528 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.97■■■□□ 2.71
ACTB-206ENST00000443528 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.96■■■□□ 2.71
ACTB-206ENST00000443528 NACADO15069 1562 aa31.94■■■□□ 2.7
ACTB-206ENST00000443528 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
ACTB-206ENST00000443528 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.77■■■□□ 2.68
ACTB-206ENST00000443528 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.64■■■□□ 2.66
ACTB-206ENST00000443528 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.24■■■□□ 2.59
ACTB-206ENST00000443528 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.13■■■□□ 2.57
ACTB-206ENST00000443528 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.06■■■□□ 2.56
ACTB-206ENST00000443528 SCRIBQ14160 1630 aa31.02■■■□□ 2.56
ACTB-206ENST00000443528 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.67■■■□□ 2.5
ACTB-206ENST00000443528 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.61■■■□□ 2.49
ACTB-206ENST00000443528 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
ACTB-206ENST00000443528 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.08■■■□□ 2.41
ACTB-206ENST00000443528 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.89■■■□□ 2.38
ACTB-206ENST00000443528 SMARCA4P51532 1647 aa29.67■■■□□ 2.34
ACTB-206ENST00000443528 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
ACTB-206ENST00000443528 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.53■■■□□ 2.32
ACTB-206ENST00000443528 NCAPD3P42695 1498 aa29.51■■■□□ 2.31
ACTB-206ENST00000443528 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.5■■■□□ 2.31
ACTB-206ENST00000443528 SMARCA2P51531 1590 aa29.45■■■□□ 2.31
ACTB-206ENST00000443528 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.39■■■□□ 2.29
ACTB-206ENST00000443528 HMGXB3Q12766 1538 aa29.34■■■□□ 2.29
ACTB-206ENST00000443528 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
ACTB-206ENST00000443528 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
ACTB-206ENST00000443528 WIZO95785 1651 aa29.16■■■□□ 2.26
ACTB-206ENST00000443528 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
ACTB-206ENST00000443528 NESP48681 1621 aa28.82■■■□□ 2.2
ACTB-206ENST00000443528 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.7■■■□□ 2.18
ACTB-206ENST00000443528 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.65■■■□□ 2.18
ACTB-206ENST00000443528 ERCC6Q03468 1493 aa28.65■■■□□ 2.18
ACTB-206ENST00000443528 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.53■■■□□ 2.16
ACTB-206ENST00000443528 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.52■■■□□ 2.16
ACTB-206ENST00000443528 CFTRP13569 1480 aa28.48■■■□□ 2.15
ACTB-206ENST00000443528 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.42■■■□□ 2.14
ACTB-206ENST00000443528 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
ACTB-206ENST00000443528 CUX2O14529 1486 aa28.35■■■□□ 2.13
ACTB-206ENST00000443528 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
ACTB-206ENST00000443528 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.32■■■□□ 2.12
ACTB-206ENST00000443528 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.26■■■□□ 2.11
ACTB-206ENST00000443528 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.22■■■□□ 2.11
ACTB-206ENST00000443528 PRDM2Q13029 1718 aa28.18■■■□□ 2.1
ACTB-206ENST00000443528 WDR62O43379 1518 aa28.13■■■□□ 2.09
ACTB-206ENST00000443528 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
ACTB-206ENST00000443528 TOPBP1Q92547 1522 aa27.87■■■□□ 2.05
ACTB-206ENST00000443528 ABCC8Q09428 1581 aa27.82■■■□□ 2.04
ACTB-206ENST00000443528 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.81■■■□□ 2.04
ACTB-206ENST00000443528 IFT140Q96RY7 1462 aa27.67■■■□□ 2.02
ACTB-206ENST00000443528 CUX1P39880 1505 aa27.67■■■□□ 2.02
ACTB-206ENST00000443528 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
ACTB-206ENST00000443528 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
ACTB-206ENST00000443528 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
ACTB-206ENST00000443528 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.56■■■□□ 2
ACTB-206ENST00000443528 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.53■■■□□ 2
ACTB-206ENST00000443528 SOGA1O94964 1423 aa27.52■■■□□ 2
ACTB-206ENST00000443528 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.52■■■□□ 2
ACTB-206ENST00000443528 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.993e-23■■□□□ 11.8
ACTB-206ENST00000443528 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.43■■□□□ 1.981e-15■■■■■ 35.7
ACTB-206ENST00000443528 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
ACTB-206ENST00000443528 SYNJ1O43426 1573 aa27.42■■□□□ 1.98
ACTB-206ENST00000443528 TOP2BQ02880 1626 aa27.41■■□□□ 1.98
ACTB-206ENST00000443528 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.4■■□□□ 1.98
ACTB-206ENST00000443528 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ACTB-206ENST00000443528 WDR97A6NE52 1622 aa27.31■■□□□ 1.96
ACTB-206ENST00000443528 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.3■■□□□ 1.96
ACTB-206ENST00000443528 OSCARQ8IYS5 282 aa27.2■■□□□ 1.94
ACTB-206ENST00000443528 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.19■■□□□ 1.94
ACTB-206ENST00000443528 GRIN2BQ13224 1484 aa27.19■■□□□ 1.94
ACTB-206ENST00000443528 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.17■■□□□ 1.94
ACTB-206ENST00000443528 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.15■■□□□ 1.94
ACTB-206ENST00000443528 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
ACTB-206ENST00000443528 PBRM1Q86U86 1689 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTB-206ENST00000443528 FBLN2P98095 1184 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTB-206ENST00000443528 CHD1O14646 1710 aa27.07■■□□□ 1.92
ACTB-206ENST00000443528 SYNJ2O15056 1496 aa27■■□□□ 1.91
ACTB-206ENST00000443528 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
ACTB-206ENST00000443528 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.95■■□□□ 1.9
ACTB-206ENST00000443528 ADAMTS12P58397 1594 aa26.91■■□□□ 1.9
ACTB-206ENST00000443528 KIF27Q86VH2 1401 aa26.89■■□□□ 1.89
ACTB-206ENST00000443528 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.88■■□□□ 1.89
ACTB-206ENST00000443528 GRIN2AQ12879 1464 aa26.84■■□□□ 1.89
ACTB-206ENST00000443528 IGF1RP08069 1367 aa26.83■■□□□ 1.88
ACTB-206ENST00000443528 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.82■■□□□ 1.88
ACTB-206ENST00000443528 TRIM41Q8WV44 630 aa26.82■■□□□ 1.88
ACTB-206ENST00000443528 ARHGEF11O15085 1522 aa26.75■■□□□ 1.87
ACTB-206ENST00000443528 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.75■■□□□ 1.87
ACTB-206ENST00000443528 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.75■■□□□ 1.87
ACTB-206ENST00000443528 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.75■■□□□ 1.87
ACTB-206ENST00000443528 NUP160Q12769 1436 aa26.73■■□□□ 1.87
ACTB-206ENST00000443528 CEP170Q5SW79 1584 aa26.71■■□□□ 1.87
ACTB-206ENST00000443528 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.71■■□□□ 1.87
ACTB-206ENST00000443528 CUL7Q14999 1698 aa26.68■■□□□ 1.86
ACTB-206ENST00000443528 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.65■■□□□ 1.86
ACTB-206ENST00000443528 ARAP1Q96P48 1450 aa26.55■■□□□ 1.84
ACTB-206ENST00000443528 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.55■■□□□ 1.84
ACTB-206ENST00000443528 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.52■■□□□ 1.84
ACTB-206ENST00000443528 SHROOM2Q13796 1616 aa26.5■■□□□ 1.83
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