RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592618.5

TMEM259-210, Transcript of transmembrane protein 259, humanhuman

TSL 5

Gene TMEM259, Length 1,877 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259-210ENST00000592618 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.46■■■■■ 6.47
TMEM259-210ENST00000592618 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.26■■■■■ 5.32
TMEM259-210ENST00000592618 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.64■■■■■ 5.06
TMEM259-210ENST00000592618 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.91■■■■■ 4.94
TMEM259-210ENST00000592618 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.61■■■■■ 4.89
TMEM259-210ENST00000592618 ABCC9O60706 1549 aa45.37■■■■■ 4.85
TMEM259-210ENST00000592618 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.31■■■■■ 4.84
TMEM259-210ENST00000592618 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.27■■■■■ 4.84
TMEM259-210ENST00000592618 NACADO15069 1562 aa44.91■■■■■ 4.78
TMEM259-210ENST00000592618 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.44■■■■■ 4.7
TMEM259-210ENST00000592618 SCRIBQ14160 1630 aa44.34■■■■■ 4.69
TMEM259-210ENST00000592618 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
TMEM259-210ENST00000592618 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.56■■■■■ 4.56
TMEM259-210ENST00000592618 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.13■■■■■ 4.49
TMEM259-210ENST00000592618 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
TMEM259-210ENST00000592618 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.06■■■■■ 4.48
TMEM259-210ENST00000592618 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.83■■■■■ 4.45
TMEM259-210ENST00000592618 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.83■■■■■ 4.451e-9■■□□□ 14
TMEM259-210ENST00000592618 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
TMEM259-210ENST00000592618 SMARCA4P51532 1647 aa42.57■■■■■ 4.41
TMEM259-210ENST00000592618 WIZO95785 1651 aa42.48■■■■■ 4.39
TMEM259-210ENST00000592618 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.1■■■■■ 4.33
TMEM259-210ENST00000592618 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.32
TMEM259-210ENST00000592618 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.02■■■■■ 4.32
TMEM259-210ENST00000592618 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.83■■■■■ 4.29
TMEM259-210ENST00000592618 SMARCA2P51531 1590 aa41.81■■■■■ 4.28
TMEM259-210ENST00000592618 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
TMEM259-210ENST00000592618 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.65■■■■■ 4.26
TMEM259-210ENST00000592618 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
TMEM259-210ENST00000592618 NCAPD3P42695 1498 aa41.47■■■■■ 4.23
TMEM259-210ENST00000592618 HMGXB3Q12766 1538 aa41.41■■■■■ 4.22
TMEM259-210ENST00000592618 TRIM41Q8WV44 630 aa41.11■■■■■ 4.17
TMEM259-210ENST00000592618 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.1■■■■■ 4.17
TMEM259-210ENST00000592618 ABCC8Q09428 1581 aa40.8■■■■■ 4.12
TMEM259-210ENST00000592618 CFTRP13569 1480 aa40.6■■■■■ 4.09
TMEM259-210ENST00000592618 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.55■■■■■ 4.082e-8■■□□□ 13.6
TMEM259-210ENST00000592618 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.4■■■■■ 4.06
TMEM259-210ENST00000592618 PRDM2Q13029 1718 aa40.37■■■■■ 4.05
TMEM259-210ENST00000592618 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.37■■■■■ 4.05
TMEM259-210ENST00000592618 SYNJ1O43426 1573 aa40.36■■■■■ 4.05
TMEM259-210ENST00000592618 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
TMEM259-210ENST00000592618 TOP2BQ02880 1626 aa40.21■■■■■ 4.03
TMEM259-210ENST00000592618 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.16■■■■■ 4.02
TMEM259-210ENST00000592618 EEA1Q15075 1411 aa40.11■■■■■ 4.01
TMEM259-210ENST00000592618 SOGA1O94964 1423 aa40.1■■■■■ 4.01
TMEM259-210ENST00000592618 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.08■■■■■ 4.01
TMEM259-210ENST00000592618 CUX1P39880 1505 aa40.04■■■■■ 4
TMEM259-210ENST00000592618 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.99■■■■□ 3.99
TMEM259-210ENST00000592618 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.93■■■■□ 3.98
TMEM259-210ENST00000592618 NESP48681 1621 aa39.92■■■■□ 3.98
TMEM259-210ENST00000592618 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.92■■■■□ 3.98
TMEM259-210ENST00000592618 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.85■■■■□ 3.97
TMEM259-210ENST00000592618 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.67■■■■□ 3.94
TMEM259-210ENST00000592618 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.65■■■■□ 3.94
TMEM259-210ENST00000592618 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.64■■■■□ 3.94
TMEM259-210ENST00000592618 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.61■■■■□ 3.93
TMEM259-210ENST00000592618 KIF21BO75037 1637 aa39.56■■■■□ 3.92
TMEM259-210ENST00000592618 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.55■■■■□ 3.92
TMEM259-210ENST00000592618 TOPBP1Q92547 1522 aa39.53■■■■□ 3.92
TMEM259-210ENST00000592618 GOLGA3Q08378 1498 aa39.52■■■■□ 3.92
TMEM259-210ENST00000592618 KIF27Q86VH2 1401 aa39.5■■■■□ 3.91
TMEM259-210ENST00000592618 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.48■■■■□ 3.91
TMEM259-210ENST00000592618 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.45■■■■□ 3.91
TMEM259-210ENST00000592618 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
TMEM259-210ENST00000592618 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
TMEM259-210ENST00000592618 CUX2O14529 1486 aa39.33■■■■□ 3.89
TMEM259-210ENST00000592618 PRXQ9BXM0 1461 aa39.33■■■■□ 3.89
TMEM259-210ENST00000592618 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
TMEM259-210ENST00000592618 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.28■■■■□ 3.88
TMEM259-210ENST00000592618 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.27■■■■□ 3.88
TMEM259-210ENST00000592618 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.25■■■■□ 3.87
TMEM259-210ENST00000592618 CEP162Q5TB80 1403 aa39.24■■■■□ 3.87
TMEM259-210ENST00000592618 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.2■■■■□ 3.87
TMEM259-210ENST00000592618 IGF1RP08069 1367 aa39.16■■■■□ 3.86
TMEM259-210ENST00000592618 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.14■■■■□ 3.86
TMEM259-210ENST00000592618 WDR97A6NE52 1622 aa39.09■■■■□ 3.85
TMEM259-210ENST00000592618 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.94■■■■□ 3.82
TMEM259-210ENST00000592618 WDR62O43379 1518 aa38.94■■■■□ 3.82
TMEM259-210ENST00000592618 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
TMEM259-210ENST00000592618 CLIP1P30622 1438 aa38.9■■■■□ 3.82
TMEM259-210ENST00000592618 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.9■■■■□ 3.82
TMEM259-210ENST00000592618 ERCC6Q03468 1493 aa38.87■■■■□ 3.81
TMEM259-210ENST00000592618 CUL7Q14999 1698 aa38.82■■■■□ 3.8
TMEM259-210ENST00000592618 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.8■■■■□ 3.8
TMEM259-210ENST00000592618 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.79■■■■□ 3.8
TMEM259-210ENST00000592618 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
TMEM259-210ENST00000592618 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
TMEM259-210ENST00000592618 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.71■■■■□ 3.79
TMEM259-210ENST00000592618 IFT140Q96RY7 1462 aa38.7■■■■□ 3.79
TMEM259-210ENST00000592618 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.6■■■■□ 3.77
TMEM259-210ENST00000592618 PBRM1Q86U86 1689 aa38.54■■■■□ 3.76
TMEM259-210ENST00000592618 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.52■■■■□ 3.762e-11■■■■■ 39.4
TMEM259-210ENST00000592618 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
TMEM259-210ENST00000592618 ARAP1Q96P48 1450 aa38.5■■■■□ 3.75
TMEM259-210ENST00000592618 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.47■■■■□ 3.75
TMEM259-210ENST00000592618 GRIN2BQ13224 1484 aa38.46■■■■□ 3.75
TMEM259-210ENST00000592618 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.46■■■■□ 3.75
TMEM259-210ENST00000592618 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.4■■■■□ 3.74
TMEM259-210ENST00000592618 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.39■■■■□ 3.74
TMEM259-210ENST00000592618 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
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