Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RGP1-202ENST00000496906 1586 ntTSL 519.66■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 MYO1D-204ENST00000577352 1008 ntTSL 218.45■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.52e-14■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.374e-9■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.312e-14■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.242e-14■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-203ENST00000411973 838 ntTSL 516.5■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 SLC8B1-214ENST00000552565 2287 ntTSL 216.21■□□□□ 0.192e-14■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.162e-14■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.074e-9■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 2938 nt14.48□□□□□ -0.092e-14■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 SLC8B1-211ENST00000550672 2925 ntTSL 1 (best)13.98□□□□□ -0.172e-14■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.24e-9■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-14■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 LINC02210-CRHR1-202ENST00000634540 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PRR11-203ENST00000578542 2334 ntTSL 512.8□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-205ENST00000395568 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 EXOC6-202ENST00000371543 2714 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PRR11-201ENST00000262293 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PRR11-209ENST00000614081 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 ATG13-207ENST00000526508 4199 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.624e-9■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-224ENST00000613154 1863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 LINC02210-213ENST00000591271 9678 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 AK2-214ENST00000626911 160 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.732e-14■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-203ENST00000337898 1465 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 3192 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.792e-14■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PRR11-205ENST00000580177 1641 ntTSL 1 (best)9.86□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.864e-9■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.934e-9■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-202ENST00000317560 1359 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.032e-9■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 LINC02210-CRHR1-201ENST00000587305 560 ntTSL 58.38□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 155.3
UTP3Q9NQZ2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.282e-6■■■■■ 155.2
UTP3Q9NQZ2 KIF13A-202ENST00000358380 4200 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 155.2
UTP3Q9NQZ2 HOXC6-204ENST00000509328 358 ntTSL 321.56■■□□□ 1.047e-7■■■■■ 155.2
UTP3Q9NQZ2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.237e-7■■■■■ 155.2
UTP3Q9NQZ2 HOXC6-203ENST00000504315 538 ntTSL 314.49□□□□□ -0.097e-7■■■■■ 155.2
UTP3Q9NQZ2 MINK1-204ENST00000571207 4569 ntTSL 517.35■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 155.1
UTP3Q9NQZ2 PLEC-211ENST00000527303 598 ntTSL 323■■□□□ 1.271e-10■■■■■ 155.1
UTP3Q9NQZ2 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 320.58■□□□□ 0.896e-7■■■■■ 155
UTP3Q9NQZ2 NDUFA10-206ENST00000419408 662 ntTSL 511.49□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 155
UTP3Q9NQZ2 NDUFA10-211ENST00000476216 817 ntTSL 210.04□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 155
UTP3Q9NQZ2 NDUFA10-208ENST00000444548 621 ntTSL 39.13□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 155
UTP3Q9NQZ2 NDUFA10-209ENST00000448880 434 ntTSL 55.55□□□□□ -1.521e-7■■■■■ 155
UTP3Q9NQZ2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.538e-7■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.398e-7■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.288e-7■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.268e-7■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.388e-7■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.538e-7■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.538e-7■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.568e-7■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.748e-7■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.42e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 NISCH-213ENST00000489895 5350 ntTSL 219.9■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-212ENST00000448704 1599 ntTSL 1 (best)19.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-206ENST00000418140 1372 ntTSL 1 (best)13.45□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-208ENST00000431651 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.79□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-214ENST00000457939 406 ntTSL 311.37□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-213ENST00000451651 585 ntTSL 311.29□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-216ENST00000470156 569 ntTSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-207ENST00000420441 547 ntTSL 25.65□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 EFCAB2-201ENST00000366521 860 ntTSL 213□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 EFCAB2-213ENST00000497591 1201 ntTSL 512.75□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 EFCAB2-208ENST00000473686 906 ntTSL 511.11□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 EFCAB2-211ENST00000487845 1389 ntTSL 29.88□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 EFCAB2-212ENST00000495271 744 ntTSL 59.47□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 EFCAB2-207ENST00000447569 527 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 EFCAB2-204ENST00000391837 738 ntTSL 58.4□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 EFCAB2-215ENST00000549220 557 ntTSL 47.44□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 154.8
UTP3Q9NQZ2 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 154.7
UTP3Q9NQZ2 N4BP2-202ENST00000511480 9747 ntTSL 1 (best)5.34□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 154.7
UTP3Q9NQZ2 MAP4-208ENST00000429422 3724 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 154.7
UTP3Q9NQZ2 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 154.6
UTP3Q9NQZ2 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 154.6
UTP3Q9NQZ2 LIMS1-208ENST00000428064 637 ntTSL 222.12■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 154.6
UTP3Q9NQZ2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 154.6
UTP3Q9NQZ2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 17e-7■■■■■ 154.6
UTP3Q9NQZ2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.785e-7■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.198e-7■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 154.5
UTP3Q9NQZ2 TRRAP-205ENST00000456197 11654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.01□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 154.5
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1099.5 ms