RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592939.1

TNRC6C-AS1-202, TNRC6C antisense RNA 1, humanhuman

Gene TNRC6C-AS1, Length 2,938 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.52■■■□□ 2.32
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.11■■□□□ 1.77
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 ABCC9O60706 1549 aa25.46■■□□□ 1.67
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.58■■□□□ 1.53
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 NACADO15069 1562 aa24.5■■□□□ 1.51
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.49■■□□□ 1.51
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.39■■□□□ 1.5
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.37■■□□□ 1.49
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.06■■□□□ 1.44
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 SCRIBQ14160 1630 aa23.93■■□□□ 1.42
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.85■■□□□ 1.41
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.49■■□□□ 1.35
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.3■■□□□ 1.32
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.04■■□□□ 1.28
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.04■■□□□ 1.28
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 SMARCA4P51532 1647 aa22.87■■□□□ 1.25
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.8■■□□□ 1.24
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.7■■□□□ 1.22
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 NCAPD3P42695 1498 aa22.63■■□□□ 1.21
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.63■■□□□ 1.21
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 SMARCA2P51531 1590 aa22.62■■□□□ 1.21
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 WIZO95785 1651 aa22.57■■□□□ 1.2
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 HMGXB3Q12766 1538 aa22.53■■□□□ 1.2
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 SLC24A1O60721 1099 aa22.2■■□□□ 1.14
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 NESP48681 1621 aa22.13■■□□□ 1.13
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.05■■□□□ 1.12
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 HRCP23327 699 aa22.01■■□□□ 1.11
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.99■■□□□ 1.11
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.98■■□□□ 1.11
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CFTRP13569 1480 aa21.91■■□□□ 1.1
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 ERCC6Q03468 1493 aa21.87■■□□□ 1.09
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.85■■□□□ 1.09
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.81■■□□□ 1.08
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.74■■□□□ 1.07
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 PRDM2Q13029 1718 aa21.74■■□□□ 1.07
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.67■■□□□ 1.06
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.61■■□□□ 1.05
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 WDR62O43379 1518 aa21.56■■□□□ 1.04
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CUX2O14529 1486 aa21.55■■□□□ 1.04
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 TOPBP1Q92547 1522 aa21.43■■□□□ 1.02
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 MYT1Q01538 1121 aa21.41■■□□□ 1.02
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.39■■□□□ 1.02
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CUX1P39880 1505 aa21.37■■□□□ 1.01
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 ABCC8Q09428 1581 aa21.34■■□□□ 1.01
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.28■■□□□ 1
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 SYNJ1O43426 1573 aa21.25■□□□□ 0.99
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.24■□□□□ 0.99
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.21■□□□□ 0.99
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 IFT140Q96RY7 1462 aa21.2■□□□□ 0.98
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 TOP2BQ02880 1626 aa21.19■□□□□ 0.98
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.19■□□□□ 0.98
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 SOGA1O94964 1423 aa21.15■□□□□ 0.98
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.97
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 WDR97A6NE52 1622 aa21.08■□□□□ 0.96
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.02■□□□□ 0.96
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.95■□□□□ 0.94
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.91■□□□□ 0.94
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 PBRM1Q86U86 1689 aa20.89■□□□□ 0.93
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 GRIN2BQ13224 1484 aa20.87■□□□□ 0.93
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.86■□□□□ 0.93
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 TRIM41Q8WV44 630 aa20.84■□□□□ 0.93
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CHD1O14646 1710 aa20.79■□□□□ 0.92
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.76■□□□□ 0.91
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.76■□□□□ 0.91
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.75■□□□□ 0.91
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 KIF27Q86VH2 1401 aa20.74■□□□□ 0.91
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 FBLN2P98095 1184 aa20.74■□□□□ 0.91
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.73■□□□□ 0.91
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 ADAMTS12P58397 1594 aa20.72■□□□□ 0.91
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 SYNJ2O15056 1496 aa20.72■□□□□ 0.91
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 IGF1RP08069 1367 aa20.71■□□□□ 0.91
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 OSCARQ8IYS5 282 aa20.7■□□□□ 0.9
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.66■□□□□ 0.9
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 GRIN2AQ12879 1464 aa20.63■□□□□ 0.89
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CUL7Q14999 1698 aa20.59■□□□□ 0.89
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TNRC6C-AS1-202ENST00000592939 CEP170Q5SW79 1584 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms