RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527303.1

PLEC-211, Transcript of plectin, humanhuman

TSL 3

Gene PLEC, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEC-211ENST00000527303 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.53■■■■■ 6.32
PLEC-211ENST00000527303 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.01■■■■■ 5.44
PLEC-211ENST00000527303 ABCC9O60706 1549 aa48.7■■■■■ 5.39
PLEC-211ENST00000527303 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.56■■■■■ 5.04
PLEC-211ENST00000527303 NACADO15069 1562 aa46.29■■■■■ 5
PLEC-211ENST00000527303 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.84■■■■■ 4.93
PLEC-211ENST00000527303 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.74■■■■■ 4.91
PLEC-211ENST00000527303 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.54■■■■■ 4.88
PLEC-211ENST00000527303 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.5■■■■■ 4.87
PLEC-211ENST00000527303 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.3■■■■■ 4.84
PLEC-211ENST00000527303 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
PLEC-211ENST00000527303 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.16■■■■■ 4.82
PLEC-211ENST00000527303 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.11■■■■■ 4.81
PLEC-211ENST00000527303 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.71■■■■■ 4.75
PLEC-211ENST00000527303 SCRIBQ14160 1630 aa44.49■■■■■ 4.71
PLEC-211ENST00000527303 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.09■■■■■ 4.65
PLEC-211ENST00000527303 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
PLEC-211ENST00000527303 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.93■■■■■ 4.62
PLEC-211ENST00000527303 NCAPD3P42695 1498 aa42.68■■■■■ 4.42
PLEC-211ENST00000527303 SMARCA4P51532 1647 aa42.53■■■■■ 4.4
PLEC-211ENST00000527303 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.52■■■■■ 4.4
PLEC-211ENST00000527303 SMARCA2P51531 1590 aa42.49■■■■■ 4.39
PLEC-211ENST00000527303 HMGXB3Q12766 1538 aa42.41■■■■■ 4.38
PLEC-211ENST00000527303 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
PLEC-211ENST00000527303 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.18■■■■■ 4.34
PLEC-211ENST00000527303 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
PLEC-211ENST00000527303 ERCC6Q03468 1493 aa42.11■■■■■ 4.33
PLEC-211ENST00000527303 CUX2O14529 1486 aa42.11■■■■■ 4.33
PLEC-211ENST00000527303 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.94■■■■■ 4.3
PLEC-211ENST00000527303 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.9■■■■■ 4.3
PLEC-211ENST00000527303 NESP48681 1621 aa41.84■■■■■ 4.29
PLEC-211ENST00000527303 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.76■■■■■ 4.27
PLEC-211ENST00000527303 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
PLEC-211ENST00000527303 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.49■■■■■ 4.23
PLEC-211ENST00000527303 WIZO95785 1651 aa41.47■■■■■ 4.23
PLEC-211ENST00000527303 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.42■■■■■ 4.22
PLEC-211ENST00000527303 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.37■■■■■ 4.21
PLEC-211ENST00000527303 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
PLEC-211ENST00000527303 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.07■■■■■ 4.16
PLEC-211ENST00000527303 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
PLEC-211ENST00000527303 WDR62O43379 1518 aa40.99■■■■■ 4.15
PLEC-211ENST00000527303 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.93■■■■■ 4.14
PLEC-211ENST00000527303 CFTRP13569 1480 aa40.92■■■■■ 4.14
PLEC-211ENST00000527303 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.87■■■■■ 4.13
PLEC-211ENST00000527303 PRDM2Q13029 1718 aa40.64■■■■■ 4.1
PLEC-211ENST00000527303 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
PLEC-211ENST00000527303 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.49■■■■■ 4.07
PLEC-211ENST00000527303 ABCC8Q09428 1581 aa40.17■■■■■ 4.02
PLEC-211ENST00000527303 OSCARQ8IYS5 282 aa40.14■■■■■ 4.02
PLEC-211ENST00000527303 IFT140Q96RY7 1462 aa40.13■■■■■ 4.02
PLEC-211ENST00000527303 TOPBP1Q92547 1522 aa40.11■■■■■ 4.01
PLEC-211ENST00000527303 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.01■■■■■ 4
PLEC-211ENST00000527303 TRIM41Q8WV44 630 aa39.97■■■■□ 3.99
PLEC-211ENST00000527303 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
PLEC-211ENST00000527303 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
PLEC-211ENST00000527303 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
PLEC-211ENST00000527303 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
PLEC-211ENST00000527303 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.61■■■■□ 3.936e-7■■□□□ 11.9
PLEC-211ENST00000527303 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.59■■■■□ 3.93
PLEC-211ENST00000527303 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.59■■■■□ 3.93
PLEC-211ENST00000527303 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.59■■■■□ 3.93
PLEC-211ENST00000527303 SOGA1O94964 1423 aa39.53■■■■□ 3.92
PLEC-211ENST00000527303 WDR97A6NE52 1622 aa39.53■■■■□ 3.92
PLEC-211ENST00000527303 CHD1O14646 1710 aa39.51■■■■□ 3.92
PLEC-211ENST00000527303 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.48■■■■□ 3.91
PLEC-211ENST00000527303 ARHGEF11O15085 1522 aa39.46■■■■□ 3.91
PLEC-211ENST00000527303 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.44■■■■□ 3.9
PLEC-211ENST00000527303 CUX1P39880 1505 aa39.42■■■■□ 3.9
PLEC-211ENST00000527303 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
PLEC-211ENST00000527303 FBLN2P98095 1184 aa39.31■■■■□ 3.88
PLEC-211ENST00000527303 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
PLEC-211ENST00000527303 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.24■■■■□ 3.87
PLEC-211ENST00000527303 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
PLEC-211ENST00000527303 GRIN2BQ13224 1484 aa39.21■■■■□ 3.87
PLEC-211ENST00000527303 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.11■■■■□ 3.85
PLEC-211ENST00000527303 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
PLEC-211ENST00000527303 SYNJ1O43426 1573 aa39.1■■■■□ 3.85
PLEC-211ENST00000527303 PBRM1Q86U86 1689 aa39.09■■■■□ 3.85
PLEC-211ENST00000527303 SYNJ2O15056 1496 aa39.07■■■■□ 3.85
PLEC-211ENST00000527303 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.07■■■■□ 3.84
PLEC-211ENST00000527303 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.06■■■■□ 3.84
PLEC-211ENST00000527303 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.06■■■■□ 3.84
PLEC-211ENST00000527303 ARAP1Q96P48 1450 aa39.05■■■■□ 3.84
PLEC-211ENST00000527303 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39■■■■□ 3.83
PLEC-211ENST00000527303 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.92■■■■□ 3.829e-6■■■■■ 50.1
PLEC-211ENST00000527303 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.91■■■■□ 3.82
PLEC-211ENST00000527303 TOP2BQ02880 1626 aa38.89■■■■□ 3.82
PLEC-211ENST00000527303 GRIN2AQ12879 1464 aa38.68■■■■□ 3.78
PLEC-211ENST00000527303 ADAMTS12P58397 1594 aa38.68■■■■□ 3.78
PLEC-211ENST00000527303 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
PLEC-211ENST00000527303 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.62■■■■□ 3.77
PLEC-211ENST00000527303 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.59■■■■□ 3.77
PLEC-211ENST00000527303 NUP160Q12769 1436 aa38.56■■■■□ 3.76
PLEC-211ENST00000527303 CEP170Q5SW79 1584 aa38.51■■■■□ 3.76
PLEC-211ENST00000527303 SHROOM2Q13796 1616 aa38.42■■■■□ 3.74
PLEC-211ENST00000527303 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.36■■■■□ 3.73
PLEC-211ENST00000527303 JPH4Q96JJ6 628 aa38.15■■■■□ 3.7
PLEC-211ENST00000527303 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.7
PLEC-211ENST00000527303 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.13■■■■□ 3.69
PLEC-211ENST00000527303 KIF27Q86VH2 1401 aa38.12■■■■□ 3.69
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