Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.071e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 FAM83A-208ENST00000536633 3701 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.671e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.426e-26■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 ATP5B-208ENST00000551182 457 ntTSL 27.65□□□□□ -1.186e-26■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 ATP5B-204ENST00000548474 449 ntTSL 36.93□□□□□ -1.36e-26■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.433e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.13e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.093e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.033e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 MED15-222ENST00000473244 2733 ntTSL 1 (best)19.35■□□□□ 0.691e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 MED15-231ENST00000493216 4701 ntTSL 217.52■□□□□ 0.391e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 MED15-229ENST00000489651 3563 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.541e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 ATP5G2-206ENST00000550241 406 ntTSL 39.45□□□□□ -0.95e-34■■■□□ 16.1
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PCBP1Q15365 ASPSCR1-215ENST00000583142 532 ntTSL 311.82□□□□□ -0.528e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.61e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.431e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RABGGTA-209ENST00000559551 2060 ntTSL 515.45■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RABGGTA-212ENST00000559974 1963 ntTSL 515.16■□□□□ 0.021e-6■■■□□ 16.1
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PCBP1Q15365 RABGGTA-218ENST00000560777 1197 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.31e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RABGGTA-216ENST00000560243 704 ntTSL 512.88□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RABGGTA-204ENST00000558376 1883 ntTSL 512.28□□□□□ -0.441e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RABGGTA-221ENST00000561055 735 ntTSL 210.69□□□□□ -0.71e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RABGGTA-217ENST00000560521 680 ntTSL 39.96□□□□□ -0.821e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PFKL-209ENST00000495274 951 ntTSL 218.2■□□□□ 0.56e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.212e-10■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PCBP2-225ENST00000553064 1786 ntTSL 514.84□□□□□ -0.037e-10■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PCBP2-208ENST00000546652 823 ntTSL 512.72□□□□□ -0.377e-10■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PCBP2-226ENST00000562264 1145 ntTSL 512.01□□□□□ -0.497e-10■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PCBP2-204ENST00000439930 1296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.496e-10■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 MIB1-204ENST00000578646 3306 ntTSL 211.35□□□□□ -0.592e-10■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PCBP2-210ENST00000547859 1919 ntTSL 210.66□□□□□ -0.78e-10■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PCBP2-213ENST00000548933 1202 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.827e-10■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PCBP2-211ENST00000547987 681 ntTSL 39.73□□□□□ -0.857e-10■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PCBP2-218ENST00000550585 2543 ntTSL 58.99□□□□□ -0.977e-10■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PCBP2-221ENST00000551104 681 ntTSL 39.35□□□□□ -0.915e-17■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.094e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 GSK3B-202ENST00000316626 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.64e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.629e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.539e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.29e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.56■□□□□ 0.089e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 WNK2-203ENST00000411624 6679 ntTSL 1 (best)15.19■□□□□ 0.029e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 HSPB1-202ENST00000429938 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.427e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.691e-9■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.611e-9■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.471e-6■■■□□ 16
PCBP1Q15365 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.741e-6■■■□□ 16
PCBP1Q15365 YIF1B-206ENST00000586319 936 ntTSL 319.36■□□□□ 0.691e-6■■■□□ 16
PCBP1Q15365 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.621e-6■■■□□ 16
PCBP1Q15365 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 16
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PCBP1Q15365 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.261e-6■■■□□ 16
PCBP1Q15365 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 16
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PCBP1Q15365 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.026e-14■■■□□ 16
PCBP1Q15365 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.16e-14■■■□□ 16
PCBP1Q15365 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.196e-14■■■□□ 16
PCBP1Q15365 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.119e-15■■■□□ 16
PCBP1Q15365 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.383e-6■■■□□ 16
PCBP1Q15365 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.451e-13■■■□□ 16
PCBP1Q15365 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.11e-13■■■□□ 16
PCBP1Q15365 ARCN1-205ENST00000614498 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-13■■■□□ 16
PCBP1Q15365 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-13■■■□□ 16
PCBP1Q15365 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.331e-13■■■□□ 16
PCBP1Q15365 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.064e-12■■■□□ 16
PCBP1Q15365 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-8■■■□□ 16
PCBP1Q15365 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-8■■■□□ 16
PCBP1Q15365 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.066e-7■■■□□ 16
PCBP1Q15365 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.26e-7■■■□□ 16
PCBP1Q15365 LCOR-209ENST00000540664 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.86e-7■■■□□ 16
PCBP1Q15365 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.76e-7■■■□□ 16
PCBP1Q15365 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.916e-7■■■□□ 16
PCBP1Q15365 TMC6-211ENST00000589271 1099 ntTSL 518.96■□□□□ 0.638e-11■■■□□ 16
PCBP1Q15365 TMC6-221ENST00000592063 743 ntTSL 515.55■□□□□ 0.081e-7■■■□□ 16
PCBP1Q15365 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.433e-16■■■□□ 16
PCBP1Q15365 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.362e-68■■■□□ 16
PCBP1Q15365 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.363e-16■■■□□ 16
PCBP1Q15365 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.353e-16■■■□□ 16
PCBP1Q15365 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-16■■■□□ 16
PCBP1Q15365 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-16■■■□□ 16
PCBP1Q15365 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-16■■■□□ 16
PCBP1Q15365 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.183e-16■■■□□ 16
PCBP1Q15365 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.253e-16■■■□□ 16
PCBP1Q15365 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.13e-6■■■□□ 16
PCBP1Q15365 R3HDM4-205ENST00000589445 705 ntTSL 324.69■■□□□ 1.543e-6■■■□□ 16
PCBP1Q15365 R3HDM4-206ENST00000590454 1006 ntTSL 323.55■■□□□ 1.363e-6■■■□□ 16
PCBP1Q15365 CALR-203ENST00000586803 667 ntTSL 214.79□□□□□ -0.042e-42■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 GATA2-204ENST00000489987 1433 ntTSL 222.82■■□□□ 1.243e-6■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.148e-7■■■□□ 15.9
PCBP1Q15365 SF1-210ENST00000443908 767 ntTSL 314.71□□□□□ -0.056e-8■■■□□ 15.9
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