RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473244.5

MED15-222, Transcript of mediator complex subunit 15, human

TSL 1 (best)

Gene MED15, Length 2,733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED15-222	ENST00000473244	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.89	■■■■□ 3.82
MED15-222	ENST00000473244	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.84	■■■■□ 3.01
MED15-222	ENST00000473244	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
MED15-222	ENST00000473244	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
MED15-222	ENST00000473244	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.06	■■■□□ 2.88
MED15-222	ENST00000473244	HRC	P23327	699 aa		33.01	■■■□□ 2.88
MED15-222	ENST00000473244	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.83	■■■□□ 2.85
MED15-222	ENST00000473244	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		32.64	■■■□□ 2.82
MED15-222	ENST00000473244	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MED15-222	ENST00000473244	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
MED15-222	ENST00000473244	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MED15-222	ENST00000473244	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.1	■■■□□ 2.73
MED15-222	ENST00000473244	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.97	■■■□□ 2.71
MED15-222	ENST00000473244	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
MED15-222	ENST00000473244	ABCC9	O60706	1549 aa		31.36	■■■□□ 2.61
MED15-222	ENST00000473244	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
MED15-222	ENST00000473244	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
MED15-222	ENST00000473244	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31	■■■□□ 2.55
MED15-222	ENST00000473244	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		30.97	■■■□□ 2.55
MED15-222	ENST00000473244	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	30.95	■■■□□ 2.54
MED15-222	ENST00000473244	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	30.9	■■■□□ 2.54
MED15-222	ENST00000473244	SCRIB	Q14160	1630 aa		30.9	■■■□□ 2.54
MED15-222	ENST00000473244	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	30.88	■■■□□ 2.53
MED15-222	ENST00000473244	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		30.71	■■■□□ 2.51
MED15-222	ENST00000473244	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.41	■■■□□ 2.46
MED15-222	ENST00000473244	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	30.38	■■■□□ 2.45
MED15-222	ENST00000473244	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.35	■■■□□ 2.45
MED15-222	ENST00000473244	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	30.31	■■■□□ 2.44
MED15-222	ENST00000473244	NEUROD1	Q13562	356 aa		30.29	■■■□□ 2.44
MED15-222	ENST00000473244	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	30.25	■■■□□ 2.43
MED15-222	ENST00000473244	WIZ	O95785	1651 aa		30.25	■■■□□ 2.43
MED15-222	ENST00000473244	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	30.17	■■■□□ 2.42
MED15-222	ENST00000473244	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	30.07	■■■□□ 2.4
MED15-222	ENST00000473244	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.04	■■■□□ 2.4
MED15-222	ENST00000473244	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		30.02	■■■□□ 2.4
MED15-222	ENST00000473244	NACAD	O15069	1562 aa		30.01	■■■□□ 2.39
MED15-222	ENST00000473244	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.95	■■■□□ 2.38
MED15-222	ENST00000473244	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.91	■■■□□ 2.38
MED15-222	ENST00000473244	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	29.9	■■■□□ 2.38
MED15-222	ENST00000473244	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.87	■■■□□ 2.37
MED15-222	ENST00000473244	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.85	■■■□□ 2.37
MED15-222	ENST00000473244	CEP162	Q5TB80	1403 aa		29.84	■■■□□ 2.37
MED15-222	ENST00000473244	SOGA1	O94964	1423 aa		29.7	■■■□□ 2.34
MED15-222	ENST00000473244	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.67	■■■□□ 2.34
MED15-222	ENST00000473244	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		29.66	■■■□□ 2.34
MED15-222	ENST00000473244	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	29.63	■■■□□ 2.33
MED15-222	ENST00000473244	SMARCA2	P51531	1590 aa		29.6	■■■□□ 2.33
MED15-222	ENST00000473244	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.56	■■■□□ 2.32
MED15-222	ENST00000473244	SMARCA4	P51532	1647 aa		29.49	■■■□□ 2.31
MED15-222	ENST00000473244	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	29.48	■■■□□ 2.31
MED15-222	ENST00000473244	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.46	■■■□□ 2.31
MED15-222	ENST00000473244	MYT1	Q01538	1121 aa		29.45	■■■□□ 2.3
MED15-222	ENST00000473244	EEA1	Q15075	1411 aa		29.45	■■■□□ 2.3
MED15-222	ENST00000473244	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	29.43	■■■□□ 2.3
MED15-222	ENST00000473244	MIER1	Q8N108	512 aa		29.39	■■■□□ 2.3
MED15-222	ENST00000473244	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29.38	■■■□□ 2.29
MED15-222	ENST00000473244	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
MED15-222	ENST00000473244	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		29.15	■■■□□ 2.26
MED15-222	ENST00000473244	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.12	■■■□□ 2.25
MED15-222	ENST00000473244	KIF21B	O75037	1637 aa		29.12	■■■□□ 2.25
MED15-222	ENST00000473244	CLIP1	P30622	1438 aa		29.1	■■■□□ 2.25
MED15-222	ENST00000473244	SYNJ1	O43426	1573 aa		29.07	■■■□□ 2.24
MED15-222	ENST00000473244	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		29.07	■■■□□ 2.24
MED15-222	ENST00000473244	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.93	■■■□□ 2.22
MED15-222	ENST00000473244	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
MED15-222	ENST00000473244	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MED15-222	ENST00000473244	APLP2	Q06481	763 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MED15-222	ENST00000473244	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
MED15-222	ENST00000473244	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
MED15-222	ENST00000473244	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
MED15-222	ENST00000473244	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MED15-222	ENST00000473244	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MED15-222	ENST00000473244	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	28.69	■■■□□ 2.18	3e-7	■□□□□ 8.9
MED15-222	ENST00000473244	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.61	■■■□□ 2.17
MED15-222	ENST00000473244	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
MED15-222	ENST00000473244	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.57	■■■□□ 2.16
MED15-222	ENST00000473244	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MED15-222	ENST00000473244	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.5	■■■□□ 2.15
MED15-222	ENST00000473244	PRX	Q9BXM0	1461 aa		28.5	■■■□□ 2.15
MED15-222	ENST00000473244	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
MED15-222	ENST00000473244	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MED15-222	ENST00000473244	CUX2	O14529	1486 aa		28.45	■■■□□ 2.15
MED15-222	ENST00000473244	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.45	■■■□□ 2.14
MED15-222	ENST00000473244	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.39	■■■□□ 2.13
MED15-222	ENST00000473244	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.33	■■■□□ 2.13
MED15-222	ENST00000473244	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.28	■■■□□ 2.12
MED15-222	ENST00000473244	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.23	■■■□□ 2.11
MED15-222	ENST00000473244	ITGAE	P38570	1179 aa		28.23	■■■□□ 2.11
MED15-222	ENST00000473244	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		28.22	■■■□□ 2.11
MED15-222	ENST00000473244	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		28.21	■■■□□ 2.11
MED15-222	ENST00000473244	CUX1	P39880	1505 aa		28.2	■■■□□ 2.1
MED15-222	ENST00000473244	BCAN	Q96GW7	911 aa		28.15	■■■□□ 2.1
MED15-222	ENST00000473244	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.13	■■■□□ 2.09
MED15-222	ENST00000473244	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.09	■■■□□ 2.09
MED15-222	ENST00000473244	FKBP8	Q14318	412 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MED15-222	ENST00000473244	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
MED15-222	ENST00000473244	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MED15-222	ENST00000473244	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28	■■■□□ 2.07
MED15-222	ENST00000473244	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		27.99	■■■□□ 2.07
MED15-222	ENST00000473244	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07

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