RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.27■■■■□ 3.72
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.18■■■□□ 2.9
RABGGTA-201ENST00000216840 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
RABGGTA-201ENST00000216840 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.6■■■□□ 2.65
RABGGTA-201ENST00000216840 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.54■■■□□ 2.64
RABGGTA-201ENST00000216840 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.53■■■□□ 2.64
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCC9O60706 1549 aa31.11■■■□□ 2.57
RABGGTA-201ENST00000216840 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.07■■■□□ 2.56
RABGGTA-201ENST00000216840 NACADO15069 1562 aa30.81■■■□□ 2.52
RABGGTA-201ENST00000216840 SCRIBQ14160 1630 aa30.63■■■□□ 2.49
RABGGTA-201ENST00000216840 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
RABGGTA-201ENST00000216840 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.46■■■□□ 2.47
RABGGTA-201ENST00000216840 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.97■■■□□ 2.39
RABGGTA-201ENST00000216840 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
RABGGTA-201ENST00000216840 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.75■■■□□ 2.35
RABGGTA-201ENST00000216840 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.62■■■□□ 2.33
RABGGTA-201ENST00000216840 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.6■■■□□ 2.33
RABGGTA-201ENST00000216840 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
RABGGTA-201ENST00000216840 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.43■■■□□ 2.34e-10■■■□□ 15
RABGGTA-201ENST00000216840 WIZO95785 1651 aa29.42■■■□□ 2.3
RABGGTA-201ENST00000216840 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.4■■■□□ 2.3
RABGGTA-201ENST00000216840 SMARCA4P51532 1647 aa29.36■■■□□ 2.29
RABGGTA-201ENST00000216840 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
RABGGTA-201ENST00000216840 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.95■■■□□ 2.23
RABGGTA-201ENST00000216840 SMARCA2P51531 1590 aa28.83■■■□□ 2.21
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.8■■■□□ 2.2
RABGGTA-201ENST00000216840 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.77■■■□□ 2.2
RABGGTA-201ENST00000216840 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
RABGGTA-201ENST00000216840 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
RABGGTA-201ENST00000216840 TRIM41Q8WV44 630 aa28.62■■■□□ 2.17
RABGGTA-201ENST00000216840 NCAPD3P42695 1498 aa28.44■■■□□ 2.14
RABGGTA-201ENST00000216840 HMGXB3Q12766 1538 aa28.43■■■□□ 2.14
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCC8Q09428 1581 aa28.34■■■□□ 2.13
RABGGTA-201ENST00000216840 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.33■■■□□ 2.13
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
RABGGTA-201ENST00000216840 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.16■■■□□ 2.1
RABGGTA-201ENST00000216840 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SYNJ1O43426 1573 aa27.97■■■□□ 2.07
RABGGTA-201ENST00000216840 CFTRP13569 1480 aa27.92■■■□□ 2.06
RABGGTA-201ENST00000216840 SOGA1O94964 1423 aa27.87■■■□□ 2.05
RABGGTA-201ENST00000216840 PRDM2Q13029 1718 aa27.84■■■□□ 2.05
RABGGTA-201ENST00000216840 EEA1Q15075 1411 aa27.81■■■□□ 2.04
RABGGTA-201ENST00000216840 TOP2BQ02880 1626 aa27.8■■■□□ 2.04
RABGGTA-201ENST00000216840 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.79■■■□□ 2.04
RABGGTA-201ENST00000216840 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.77■■■□□ 2.04
RABGGTA-201ENST00000216840 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.77■■■□□ 2.04
RABGGTA-201ENST00000216840 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.74■■■□□ 2.03
RABGGTA-201ENST00000216840 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.67■■■□□ 2.02
RABGGTA-201ENST00000216840 CUX1P39880 1505 aa27.66■■■□□ 2.02
RABGGTA-201ENST00000216840 GOLGA3Q08378 1498 aa27.48■■□□□ 1.99
RABGGTA-201ENST00000216840 KIF21BO75037 1637 aa27.48■■□□□ 1.99
RABGGTA-201ENST00000216840 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.47■■□□□ 1.99
RABGGTA-201ENST00000216840 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.45■■□□□ 1.98
RABGGTA-201ENST00000216840 NESP48681 1621 aa27.45■■□□□ 1.98
RABGGTA-201ENST00000216840 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.44■■□□□ 1.98
RABGGTA-201ENST00000216840 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.41■■□□□ 1.98
RABGGTA-201ENST00000216840 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.4■■□□□ 1.98
RABGGTA-201ENST00000216840 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.38■■□□□ 1.97
RABGGTA-201ENST00000216840 CEP162Q5TB80 1403 aa27.36■■□□□ 1.97
RABGGTA-201ENST00000216840 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
RABGGTA-201ENST00000216840 KIF27Q86VH2 1401 aa27.3■■□□□ 1.96
RABGGTA-201ENST00000216840 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.29■■□□□ 1.96
RABGGTA-201ENST00000216840 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.28■■□□□ 1.96
RABGGTA-201ENST00000216840 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.27■■□□□ 1.96
RABGGTA-201ENST00000216840 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
RABGGTA-201ENST00000216840 PRXQ9BXM0 1461 aa27.23■■□□□ 1.95
RABGGTA-201ENST00000216840 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.21■■□□□ 1.95
RABGGTA-201ENST00000216840 TOPBP1Q92547 1522 aa27.21■■□□□ 1.95
RABGGTA-201ENST00000216840 CUX2O14529 1486 aa27.18■■□□□ 1.94
RABGGTA-201ENST00000216840 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.17■■□□□ 1.94
RABGGTA-201ENST00000216840 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.12■■□□□ 1.93
RABGGTA-201ENST00000216840 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
RABGGTA-201ENST00000216840 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
RABGGTA-201ENST00000216840 CLIP1P30622 1438 aa27.07■■□□□ 1.92
RABGGTA-201ENST00000216840 IGF1RP08069 1367 aa27.05■■□□□ 1.92
RABGGTA-201ENST00000216840 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.05■■□□□ 1.92
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.04■■□□□ 1.92
RABGGTA-201ENST00000216840 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
RABGGTA-201ENST00000216840 WDR97A6NE52 1622 aa26.95■■□□□ 1.91
RABGGTA-201ENST00000216840 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-201ENST00000216840 HRCP23327 699 aa26.88■■□□□ 1.89
RABGGTA-201ENST00000216840 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-201ENST00000216840 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-201ENST00000216840 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.81■■□□□ 1.88
RABGGTA-201ENST00000216840 CUL7Q14999 1698 aa26.8■■□□□ 1.88
RABGGTA-201ENST00000216840 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
RABGGTA-201ENST00000216840 ARAP1Q96P48 1450 aa26.78■■□□□ 1.88
RABGGTA-201ENST00000216840 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
RABGGTA-201ENST00000216840 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.72■■□□□ 1.87
RABGGTA-201ENST00000216840 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.7■■□□□ 1.86
RABGGTA-201ENST00000216840 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
RABGGTA-201ENST00000216840 WDR62O43379 1518 aa26.68■■□□□ 1.86
RABGGTA-201ENST00000216840 ERCC6Q03468 1493 aa26.59■■□□□ 1.85
RABGGTA-201ENST00000216840 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.59■■□□□ 1.85
RABGGTA-201ENST00000216840 APLP2Q06481 763 aa26.59■■□□□ 1.85
RABGGTA-201ENST00000216840 PBRM1Q86U86 1689 aa26.58■■□□□ 1.85
RABGGTA-201ENST00000216840 IFT140Q96RY7 1462 aa26.55■■□□□ 1.84
RABGGTA-201ENST00000216840 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
RABGGTA-201ENST00000216840 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.844e-7■■■■□ 23.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms