RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560243.5

RABGGTA-216, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-216ENST00000560243 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.65■■■□□ 2.18
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RABGGTA-216ENST00000560243 ABCC9O60706 1549 aa25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-216ENST00000560243 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-216ENST00000560243 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-216ENST00000560243 NACADO15069 1562 aa24.02■■□□□ 1.44
RABGGTA-216ENST00000560243 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
RABGGTA-216ENST00000560243 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.79■■□□□ 1.4
RABGGTA-216ENST00000560243 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.64■■□□□ 1.38
RABGGTA-216ENST00000560243 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.62■■□□□ 1.37
RABGGTA-216ENST00000560243 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.364e-10■■■□□ 15
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RABGGTA-216ENST00000560243 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.33■■□□□ 1.33
RABGGTA-216ENST00000560243 SCRIBQ14160 1630 aa23.33■■□□□ 1.32
RABGGTA-216ENST00000560243 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.05■■□□□ 1.28
RABGGTA-216ENST00000560243 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-216ENST00000560243 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-216ENST00000560243 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-216ENST00000560243 SMARCA4P51532 1647 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-216ENST00000560243 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-216ENST00000560243 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-216ENST00000560243 NCAPD3P42695 1498 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-216ENST00000560243 SMARCA2P51531 1590 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-216ENST00000560243 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-216ENST00000560243 HMGXB3Q12766 1538 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-216ENST00000560243 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-216ENST00000560243 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-216ENST00000560243 WIZO95785 1651 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-216ENST00000560243 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-216ENST00000560243 NESP48681 1621 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-216ENST00000560243 ERCC6Q03468 1493 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGGTA-216ENST00000560243 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-216ENST00000560243 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
RABGGTA-216ENST00000560243 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-216ENST00000560243 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-216ENST00000560243 CUX2O14529 1486 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-216ENST00000560243 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-216ENST00000560243 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-216ENST00000560243 CFTRP13569 1480 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-216ENST00000560243 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-216ENST00000560243 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-216ENST00000560243 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.27■■□□□ 1
RABGGTA-216ENST00000560243 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.27■■□□□ 1
RABGGTA-216ENST00000560243 WDR62O43379 1518 aa21.21■□□□□ 0.99
RABGGTA-216ENST00000560243 PRDM2Q13029 1718 aa21.19■□□□□ 0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.06■□□□□ 0.96
RABGGTA-216ENST00000560243 TOPBP1Q92547 1522 aa20.94■□□□□ 0.94
RABGGTA-216ENST00000560243 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.89■□□□□ 0.93
RABGGTA-216ENST00000560243 ABCC8Q09428 1581 aa20.86■□□□□ 0.93
RABGGTA-216ENST00000560243 IFT140Q96RY7 1462 aa20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-216ENST00000560243 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-216ENST00000560243 CUX1P39880 1505 aa20.75■□□□□ 0.91
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RABGGTA-216ENST00000560243 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.69■□□□□ 0.9
RABGGTA-216ENST00000560243 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
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RABGGTA-216ENST00000560243 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 OSCARQ8IYS5 282 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-216ENST00000560243 WDR97A6NE52 1622 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-216ENST00000560243 SYNJ1O43426 1573 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-216ENST00000560243 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.87
RABGGTA-216ENST00000560243 TOP2BQ02880 1626 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-216ENST00000560243 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-216ENST00000560243 CHD1O14646 1710 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-216ENST00000560243 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-216ENST00000560243 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-216ENST00000560243 FBLN2P98095 1184 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGGTA-216ENST00000560243 GRIN2BQ13224 1484 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-216ENST00000560243 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-216ENST00000560243 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-216ENST00000560243 PBRM1Q86U86 1689 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGGTA-216ENST00000560243 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-216ENST00000560243 TRIM41Q8WV44 630 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-216ENST00000560243 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-216ENST00000560243 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-216ENST00000560243 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-216ENST00000560243 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-216ENST00000560243 SYNJ2O15056 1496 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-216ENST00000560243 ARHGEF11O15085 1522 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-216ENST00000560243 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-216ENST00000560243 ADAMTS12P58397 1594 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-216ENST00000560243 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.19■□□□□ 0.82
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RABGGTA-216ENST00000560243 CEP170Q5SW79 1584 aa20.12■□□□□ 0.81
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RABGGTA-216ENST00000560243 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-216ENST00000560243 NUP160Q12769 1436 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-216ENST00000560243 KIF27Q86VH2 1401 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-216ENST00000560243 IGF1RP08069 1367 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-216ENST00000560243 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTA-216ENST00000560243 CUL7Q14999 1698 aa19.97■□□□□ 0.79
RABGGTA-216ENST00000560243 SHROOM2Q13796 1616 aa19.97■□□□□ 0.79
RABGGTA-216ENST00000560243 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.96■□□□□ 0.79
RABGGTA-216ENST00000560243 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.92■□□□□ 0.78
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