RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.07■■■□□ 2.08
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RABGGTA-204ENST00000558376 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-204ENST00000558376 NACADO15069 1562 aa23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-204ENST00000558376 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.81■■□□□ 1.4
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RABGGTA-204ENST00000558376 SCRIBQ14160 1630 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-204ENST00000558376 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.97■■□□□ 1.27
RABGGTA-204ENST00000558376 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-204ENST00000558376 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.31■■□□□ 1.16
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RABGGTA-204ENST00000558376 ERCC6Q03468 1493 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-204ENST00000558376 SMARCA4P51532 1647 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-204ENST00000558376 SMARCA2P51531 1590 aa21.9■■□□□ 1.1
RABGGTA-204ENST00000558376 HMGXB3Q12766 1538 aa21.89■■□□□ 1.09
RABGGTA-204ENST00000558376 NESP48681 1621 aa21.87■■□□□ 1.09
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RABGGTA-204ENST00000558376 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
RABGGTA-204ENST00000558376 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-204ENST00000558376 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.65■■□□□ 1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.61■■□□□ 1.05
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RABGGTA-204ENST00000558376 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-204ENST00000558376 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-204ENST00000558376 WIZO95785 1651 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-204ENST00000558376 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.34■■□□□ 1.01
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RABGGTA-204ENST00000558376 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.2■□□□□ 0.98
RABGGTA-204ENST00000558376 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-204ENST00000558376 CFTRP13569 1480 aa21.13■□□□□ 0.97
RABGGTA-204ENST00000558376 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
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RABGGTA-204ENST00000558376 OSCARQ8IYS5 282 aa21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-204ENST00000558376 PRDM2Q13029 1718 aa20.89■□□□□ 0.94
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RABGGTA-204ENST00000558376 IFT140Q96RY7 1462 aa20.79■□□□□ 0.92
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RABGGTA-204ENST00000558376 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.77■□□□□ 0.92
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RABGGTA-204ENST00000558376 TOPBP1Q92547 1522 aa20.76■□□□□ 0.91
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RABGGTA-204ENST00000558376 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-204ENST00000558376 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-204ENST00000558376 FBLN2P98095 1184 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 ARAP1Q96P48 1450 aa20.46■□□□□ 0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 SOGA1O94964 1423 aa20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-204ENST00000558376 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-204ENST00000558376 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.38■□□□□ 0.85
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RABGGTA-204ENST00000558376 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-204ENST00000558376 CUX1P39880 1505 aa20.34■□□□□ 0.85
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RABGGTA-204ENST00000558376 GRIN2BQ13224 1484 aa20.27■□□□□ 0.84
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RABGGTA-204ENST00000558376 CEP170Q5SW79 1584 aa19.97■□□□□ 0.79
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RABGGTA-204ENST00000558376 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.91■□□□□ 0.78
RABGGTA-204ENST00000558376 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
RABGGTA-204ENST00000558376 SHROOM2Q13796 1616 aa19.9■□□□□ 0.78
RABGGTA-204ENST00000558376 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.85■□□□□ 0.77
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RABGGTA-204ENST00000558376 JPH4Q96JJ6 628 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-204ENST00000558376 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.77■□□□□ 0.76
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