Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC137Q6PK04 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC137Q6PK04 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC137Q6PK04 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC137Q6PK04 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC137Q6PK04 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC137Q6PK04 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms