RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000086933.2

GSC2-201, Transcript of goosecoid homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene GSC2, Length 1,033 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2-201ENST00000086933 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.13■■■■■ 8.34
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GSC2-201ENST00000086933 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.52■■■■■ 6.64
GSC2-201ENST00000086933 NACADO15069 1562 aa56.42■■■■■ 6.62
GSC2-201ENST00000086933 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.12■■■■■ 6.57
GSC2-201ENST00000086933 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.86■■■■■ 6.53
GSC2-201ENST00000086933 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.82■■■■■ 6.53
GSC2-201ENST00000086933 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.67■■■■■ 6.5
GSC2-201ENST00000086933 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.23■■■■■ 6.43
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GSC2-201ENST00000086933 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.42■■■■■ 6.3
GSC2-201ENST00000086933 SCRIBQ14160 1630 aa54.42■■■■■ 6.3
GSC2-201ENST00000086933 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.44■■■■■ 6.15
GSC2-201ENST00000086933 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.29■■■■■ 6.12
GSC2-201ENST00000086933 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.99■■■■■ 6.07
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GSC2-201ENST00000086933 SMARCA2P51531 1590 aa51.9■■■■■ 5.9
GSC2-201ENST00000086933 HMGXB3Q12766 1538 aa51.8■■■■■ 5.88
GSC2-201ENST00000086933 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.8■■■■■ 5.88
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GSC2-201ENST00000086933 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.49■■■■■ 5.67
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GSC2-201ENST00000086933 CFTRP13569 1480 aa50.15■■■■■ 5.62
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GSC2-201ENST00000086933 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.82■■■■■ 5.57
GSC2-201ENST00000086933 WDR62O43379 1518 aa49.8■■■■■ 5.56
GSC2-201ENST00000086933 PRDM2Q13029 1718 aa49.65■■■■■ 5.54
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GSC2-201ENST00000086933 ABCC8Q09428 1581 aa49.04■■■■■ 5.44
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GSC2-201ENST00000086933 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.63■■■■■ 5.37
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GSC2-201ENST00000086933 TOP2BQ02880 1626 aa47.99■■■■■ 5.27
GSC2-201ENST00000086933 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.98■■■■■ 5.27
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GSC2-201ENST00000086933 SYNJ1O43426 1573 aa47.92■■■■■ 5.26
GSC2-201ENST00000086933 GRIN2BQ13224 1484 aa47.86■■■■■ 5.25
GSC2-201ENST00000086933 CHD1O14646 1710 aa47.84■■■■■ 5.25
GSC2-201ENST00000086933 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.83■■■■■ 5.25
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GSC2-201ENST00000086933 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.82■■■■■ 5.25
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GSC2-201ENST00000086933 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.54■■■■■ 5.2
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GSC2-201ENST00000086933 CEP170Q5SW79 1584 aa47.04■■■■■ 5.12
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GSC2-201ENST00000086933 CUL7Q14999 1698 aa46.81■■■■■ 5.08
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GSC2-201ENST00000086933 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.68■■■■■ 5.06
GSC2-201ENST00000086933 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.58■■■■■ 5.05
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