RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302945.2

GSX1-201, Transcript of GS homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GSX1, Length 1,663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX1-201ENST00000302945 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.99■■■■■ 6.87
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GSX1-201ENST00000302945 ABCC9O60706 1549 aa48.09■■■■■ 5.29
GSX1-201ENST00000302945 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.01■■■■■ 5.28
GSX1-201ENST00000302945 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.96■■■■■ 5.27
GSX1-201ENST00000302945 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.56■■■■■ 5.2
GSX1-201ENST00000302945 NACADO15069 1562 aa47.33■■■■■ 5.17
GSX1-201ENST00000302945 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.02■■■■■ 5.12
GSX1-201ENST00000302945 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.98■■■■■ 5.11
GSX1-201ENST00000302945 SCRIBQ14160 1630 aa46.53■■■■■ 5.04
GSX1-201ENST00000302945 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.97■■■■■ 4.95
GSX1-201ENST00000302945 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.47■■■■■ 4.87
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GSX1-201ENST00000302945 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
GSX1-201ENST00000302945 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.01■■■■■ 4.8
GSX1-201ENST00000302945 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
GSX1-201ENST00000302945 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.84■■■■■ 4.77
GSX1-201ENST00000302945 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.74■■■■■ 4.75
GSX1-201ENST00000302945 SMARCA4P51532 1647 aa44.63■■■■■ 4.74
GSX1-201ENST00000302945 WIZO95785 1651 aa44.38■■■■■ 4.7
GSX1-201ENST00000302945 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
GSX1-201ENST00000302945 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.12■■■■■ 4.65
GSX1-201ENST00000302945 SMARCA2P51531 1590 aa43.98■■■■■ 4.63
GSX1-201ENST00000302945 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.95■■■■■ 4.63
GSX1-201ENST00000302945 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
GSX1-201ENST00000302945 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
GSX1-201ENST00000302945 NCAPD3P42695 1498 aa43.66■■■■■ 4.58
GSX1-201ENST00000302945 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.6■■■■■ 4.57
GSX1-201ENST00000302945 HMGXB3Q12766 1538 aa43.57■■■■■ 4.57
GSX1-201ENST00000302945 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.56■■■■■ 4.56
GSX1-201ENST00000302945 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.48■■■■■ 4.55
GSX1-201ENST00000302945 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.14■■■■■ 4.5
GSX1-201ENST00000302945 CFTRP13569 1480 aa42.6■■■■■ 4.41
GSX1-201ENST00000302945 TRIM41Q8WV44 630 aa42.57■■■■■ 4.41
GSX1-201ENST00000302945 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.52■■■■■ 4.4
GSX1-201ENST00000302945 PRDM2Q13029 1718 aa42.43■■■■■ 4.38
GSX1-201ENST00000302945 ABCC8Q09428 1581 aa42.43■■■■■ 4.38
GSX1-201ENST00000302945 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.27■■■■■ 4.36
GSX1-201ENST00000302945 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.23■■■■■ 4.35
GSX1-201ENST00000302945 NESP48681 1621 aa42.12■■■■■ 4.33
GSX1-201ENST00000302945 SYNJ1O43426 1573 aa42.04■■■■■ 4.32
GSX1-201ENST00000302945 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.02■■■■■ 4.32
GSX1-201ENST00000302945 TOP2BQ02880 1626 aa41.96■■■■■ 4.31
GSX1-201ENST00000302945 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.93■■■■■ 4.3
GSX1-201ENST00000302945 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.93■■■■■ 4.3
GSX1-201ENST00000302945 CUX1P39880 1505 aa41.86■■■■■ 4.29
GSX1-201ENST00000302945 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.8■■■■■ 4.28
GSX1-201ENST00000302945 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
GSX1-201ENST00000302945 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.67■■■■■ 4.26
GSX1-201ENST00000302945 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.62■■■■■ 4.25
GSX1-201ENST00000302945 EEA1Q15075 1411 aa41.61■■■■■ 4.25
GSX1-201ENST00000302945 SOGA1O94964 1423 aa41.59■■■■■ 4.25
GSX1-201ENST00000302945 TOPBP1Q92547 1522 aa41.54■■■■■ 4.24
GSX1-201ENST00000302945 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
GSX1-201ENST00000302945 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.46■■■■■ 4.23
GSX1-201ENST00000302945 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.43■■■■■ 4.22
GSX1-201ENST00000302945 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.43■■■■■ 4.22
GSX1-201ENST00000302945 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.37■■■■■ 4.21
GSX1-201ENST00000302945 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.36■■■■■ 4.21
GSX1-201ENST00000302945 ERCC6Q03468 1493 aa41.33■■■■■ 4.21
GSX1-201ENST00000302945 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
GSX1-201ENST00000302945 KIF27Q86VH2 1401 aa41.26■■■■■ 4.2
GSX1-201ENST00000302945 CUX2O14529 1486 aa41.15■■■■■ 4.18
GSX1-201ENST00000302945 WDR62O43379 1518 aa41.14■■■■■ 4.18
GSX1-201ENST00000302945 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.14■■■■■ 4.18
GSX1-201ENST00000302945 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.12■■■■■ 4.17
GSX1-201ENST00000302945 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.05■■■■■ 4.16
GSX1-201ENST00000302945 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
GSX1-201ENST00000302945 KIF21BO75037 1637 aa41.02■■■■■ 4.16
GSX1-201ENST00000302945 WDR97A6NE52 1622 aa40.99■■■■■ 4.15
GSX1-201ENST00000302945 GOLGA3Q08378 1498 aa40.96■■■■■ 4.15
GSX1-201ENST00000302945 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
GSX1-201ENST00000302945 IGF1RP08069 1367 aa40.87■■■■■ 4.13
GSX1-201ENST00000302945 PRXQ9BXM0 1461 aa40.87■■■■■ 4.13
GSX1-201ENST00000302945 IFT140Q96RY7 1462 aa40.84■■■■■ 4.13
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GSX1-201ENST00000302945 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.81■■■■■ 4.12
GSX1-201ENST00000302945 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.8■■■■■ 4.12
GSX1-201ENST00000302945 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.79■■■■■ 4.12
GSX1-201ENST00000302945 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
GSX1-201ENST00000302945 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.77■■■■■ 4.12
GSX1-201ENST00000302945 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.74■■■■■ 4.11
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GSX1-201ENST00000302945 CUL7Q14999 1698 aa40.64■■■■■ 4.1
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GSX1-201ENST00000302945 PBRM1Q86U86 1689 aa40.54■■■■■ 4.08
GSX1-201ENST00000302945 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
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GSX1-201ENST00000302945 GRIN2BQ13224 1484 aa40.48■■■■■ 4.07
GSX1-201ENST00000302945 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
GSX1-201ENST00000302945 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.32■■■■■ 4.04
GSX1-201ENST00000302945 CLIP1P30622 1438 aa40.28■■■■■ 4.04
GSX1-201ENST00000302945 ADAMTS12P58397 1594 aa40.27■■■■■ 4.04
GSX1-201ENST00000302945 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.18■■■■■ 4.02
GSX1-201ENST00000302945 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
GSX1-201ENST00000302945 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.14■■■■■ 4.02
GSX1-201ENST00000302945 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
GSX1-201ENST00000302945 SYNJ2O15056 1496 aa40.01■■■■□ 3.99
GSX1-201ENST00000302945 GRIN2AQ12879 1464 aa39.95■■■■□ 3.99
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