RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258930.7

CIB2-201, Transcript of calcium and integrin binding family member 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CIB2, Length 1,598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2-201ENST00000258930 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.74■■■■■ 7.15
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CIB2-201ENST00000258930 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50■■■■■ 5.6
CIB2-201ENST00000258930 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.61■■■■■ 5.53
CIB2-201ENST00000258930 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.44■■■■■ 5.51
CIB2-201ENST00000258930 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.18■■■■■ 5.46
CIB2-201ENST00000258930 NACADO15069 1562 aa49.12■■■■■ 5.45
CIB2-201ENST00000258930 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.9■■■■■ 5.42
CIB2-201ENST00000258930 SCRIBQ14160 1630 aa48.11■■■■■ 5.29
CIB2-201ENST00000258930 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.07■■■■■ 5.29
CIB2-201ENST00000258930 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.76■■■■■ 5.24
CIB2-201ENST00000258930 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.33■■■■■ 5.17
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CIB2-201ENST00000258930 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.41■■■■■ 5.02
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CIB2-201ENST00000258930 SMARCA4P51532 1647 aa46.09■■■■■ 4.97
CIB2-201ENST00000258930 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.07■■■■■ 4.97
CIB2-201ENST00000258930 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
CIB2-201ENST00000258930 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.99■■■■■ 4.95
CIB2-201ENST00000258930 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.94
CIB2-201ENST00000258930 WIZO95785 1651 aa45.65■■■■■ 4.9
CIB2-201ENST00000258930 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.58■■■■■ 4.89
CIB2-201ENST00000258930 SMARCA2P51531 1590 aa45.55■■■■■ 4.88
CIB2-201ENST00000258930 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.54■■■■■ 4.88
CIB2-201ENST00000258930 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.54■■■■■ 4.88
CIB2-201ENST00000258930 NCAPD3P42695 1498 aa45.32■■■■■ 4.84
CIB2-201ENST00000258930 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
CIB2-201ENST00000258930 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
CIB2-201ENST00000258930 HMGXB3Q12766 1538 aa45.19■■■■■ 4.82
CIB2-201ENST00000258930 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.06■■■■■ 4.8
CIB2-201ENST00000258930 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.71■■■■■ 4.75
CIB2-201ENST00000258930 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.1■■■■■ 4.65
CIB2-201ENST00000258930 CFTRP13569 1480 aa44.07■■■■■ 4.65
CIB2-201ENST00000258930 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.93■■■■■ 4.62
CIB2-201ENST00000258930 NESP48681 1621 aa43.89■■■■■ 4.62
CIB2-201ENST00000258930 PRDM2Q13029 1718 aa43.8■■■■■ 4.6
CIB2-201ENST00000258930 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.64■■■■■ 4.58
CIB2-201ENST00000258930 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.59■■■■■ 4.57
CIB2-201ENST00000258930 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.49■■■■■ 4.55
CIB2-201ENST00000258930 ABCC8Q09428 1581 aa43.46■■■■■ 4.55
CIB2-201ENST00000258930 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.43■■■■■ 4.54
CIB2-201ENST00000258930 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.38■■■■■ 4.54
CIB2-201ENST00000258930 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.36■■■■■ 4.53
CIB2-201ENST00000258930 ERCC6Q03468 1493 aa43.31■■■■■ 4.52
CIB2-201ENST00000258930 TRIM41Q8WV44 630 aa43.28■■■■■ 4.52
CIB2-201ENST00000258930 SYNJ1O43426 1573 aa43.15■■■■■ 4.5
CIB2-201ENST00000258930 CUX1P39880 1505 aa43.15■■■■■ 4.5
CIB2-201ENST00000258930 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.1■■■■■ 4.49
CIB2-201ENST00000258930 TOP2BQ02880 1626 aa43.1■■■■■ 4.49
CIB2-201ENST00000258930 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.07■■■■■ 4.49
CIB2-201ENST00000258930 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.06■■■■■ 4.48
CIB2-201ENST00000258930 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
CIB2-201ENST00000258930 TOPBP1Q92547 1522 aa43.02■■■■■ 4.48
CIB2-201ENST00000258930 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
CIB2-201ENST00000258930 WDR62O43379 1518 aa42.88■■■■■ 4.46
CIB2-201ENST00000258930 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.83■■■■■ 4.45
CIB2-201ENST00000258930 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
CIB2-201ENST00000258930 SOGA1O94964 1423 aa42.63■■■■■ 4.41
CIB2-201ENST00000258930 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.57■■■■■ 4.4
CIB2-201ENST00000258930 CUX2O14529 1486 aa42.52■■■■■ 4.4
CIB2-201ENST00000258930 IFT140Q96RY7 1462 aa42.45■■■■■ 4.39
CIB2-201ENST00000258930 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.45■■■■■ 4.39
CIB2-201ENST00000258930 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
CIB2-201ENST00000258930 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
CIB2-201ENST00000258930 KIF27Q86VH2 1401 aa42.37■■■■■ 4.37
CIB2-201ENST00000258930 EEA1Q15075 1411 aa42.36■■■■■ 4.37
CIB2-201ENST00000258930 WDR97A6NE52 1622 aa42.35■■■■■ 4.37
CIB2-201ENST00000258930 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.34■■■■■ 4.37
CIB2-201ENST00000258930 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
CIB2-201ENST00000258930 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.17■■■■■ 4.34
CIB2-201ENST00000258930 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
CIB2-201ENST00000258930 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.15■■■■■ 4.34
CIB2-201ENST00000258930 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.14■■■■■ 4.34
CIB2-201ENST00000258930 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.11■■■■■ 4.33
CIB2-201ENST00000258930 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
CIB2-201ENST00000258930 IGF1RP08069 1367 aa42.03■■■■■ 4.32
CIB2-201ENST00000258930 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.97■■■■■ 4.31
CIB2-201ENST00000258930 GRIN2BQ13224 1484 aa41.96■■■■■ 4.31
CIB2-201ENST00000258930 PBRM1Q86U86 1689 aa41.93■■■■■ 4.3
CIB2-201ENST00000258930 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.83■■■■■ 4.29
CIB2-201ENST00000258930 CUL7Q14999 1698 aa41.83■■■■■ 4.29
CIB2-201ENST00000258930 PRXQ9BXM0 1461 aa41.82■■■■■ 4.29
CIB2-201ENST00000258930 KIF21BO75037 1637 aa41.8■■■■■ 4.28
CIB2-201ENST00000258930 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.77■■■■■ 4.28
CIB2-201ENST00000258930 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.75■■■■■ 4.27
CIB2-201ENST00000258930 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.73■■■■■ 4.27
CIB2-201ENST00000258930 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
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CIB2-201ENST00000258930 GOLGA3Q08378 1498 aa41.7■■■■■ 4.27
CIB2-201ENST00000258930 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.69■■■■■ 4.26
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CIB2-201ENST00000258930 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
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CIB2-201ENST00000258930 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
CIB2-201ENST00000258930 FBLN2P98095 1184 aa41.46■■■■■ 4.23
CIB2-201ENST00000258930 GRIN2AQ12879 1464 aa41.41■■■■■ 4.22
CIB2-201ENST00000258930 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.4■■■■■ 4.22
CIB2-201ENST00000258930 CHD1O14646 1710 aa41.27■■■■■ 4.2
CIB2-201ENST00000258930 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.21■■■■■ 4.19
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