RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235150.4

RNF19B-201, Transcript of ring finger protein 19B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF19B, Length 2,334 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19B-201ENST00000235150 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.45■■■■■ 6.31
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RNF19B-201ENST00000235150 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.1■■■■■ 4.81
RNF19B-201ENST00000235150 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.98■■■■■ 4.79
RNF19B-201ENST00000235150 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.68■■■■■ 4.74
RNF19B-201ENST00000235150 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.1■■■■■ 4.65
RNF19B-201ENST00000235150 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.79■■■■■ 4.6
RNF19B-201ENST00000235150 ABCC9O60706 1549 aa43.75■■■■■ 4.59
RNF19B-201ENST00000235150 NACADO15069 1562 aa43.59■■■■■ 4.57
RNF19B-201ENST00000235150 SCRIBQ14160 1630 aa43.46■■■■■ 4.55
RNF19B-201ENST00000235150 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.02■■■■■ 4.48
RNF19B-201ENST00000235150 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
RNF19B-201ENST00000235150 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.38■■■■■ 4.38
RNF19B-201ENST00000235150 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.32■■■■■ 4.37
RNF19B-201ENST00000235150 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.28■■■■■ 4.36
RNF19B-201ENST00000235150 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.14■■■■■ 4.34
RNF19B-201ENST00000235150 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
RNF19B-201ENST00000235150 WIZO95785 1651 aa41.87■■■■■ 4.29
RNF19B-201ENST00000235150 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.78■■■■■ 4.28
RNF19B-201ENST00000235150 SMARCA4P51532 1647 aa41.69■■■■■ 4.26
RNF19B-201ENST00000235150 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.22
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RNF19B-201ENST00000235150 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
RNF19B-201ENST00000235150 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.12■■■■■ 4.17
RNF19B-201ENST00000235150 TRIM41Q8WV44 630 aa41.07■■■■■ 4.17
RNF19B-201ENST00000235150 SMARCA2P51531 1590 aa41.06■■■■■ 4.16
RNF19B-201ENST00000235150 CCDC88BA6NC98 1476 aa41■■■■■ 4.15
RNF19B-201ENST00000235150 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.83■■■■■ 4.13
RNF19B-201ENST00000235150 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.76■■■■■ 4.12
RNF19B-201ENST00000235150 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
RNF19B-201ENST00000235150 ABCC8Q09428 1581 aa40.48■■■■■ 4.07
RNF19B-201ENST00000235150 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
RNF19B-201ENST00000235150 HMGXB3Q12766 1538 aa40.27■■■■■ 4.04
RNF19B-201ENST00000235150 NCAPD3P42695 1498 aa40.24■■■■■ 4.03
RNF19B-201ENST00000235150 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.05■■■■■ 4
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RNF19B-201ENST00000235150 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.88■■■■□ 3.97
RNF19B-201ENST00000235150 SOGA1O94964 1423 aa39.88■■■■□ 3.97
RNF19B-201ENST00000235150 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.83■■■■□ 3.97
RNF19B-201ENST00000235150 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.69■■■■□ 3.94
RNF19B-201ENST00000235150 TOP2BQ02880 1626 aa39.65■■■■□ 3.94
RNF19B-201ENST00000235150 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.62■■■■□ 3.93
RNF19B-201ENST00000235150 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
RNF19B-201ENST00000235150 CFTRP13569 1480 aa39.61■■■■□ 3.93
RNF19B-201ENST00000235150 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.61■■■■□ 3.93
RNF19B-201ENST00000235150 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.59■■■■□ 3.93
RNF19B-201ENST00000235150 PRDM2Q13029 1718 aa39.52■■■■□ 3.92
RNF19B-201ENST00000235150 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.47■■■■□ 3.91
RNF19B-201ENST00000235150 HRCP23327 699 aa39.45■■■■□ 3.91
RNF19B-201ENST00000235150 GOLGA3Q08378 1498 aa39.43■■■■□ 3.9
RNF19B-201ENST00000235150 KIF21BO75037 1637 aa39.39■■■■□ 3.9
RNF19B-201ENST00000235150 CEP162Q5TB80 1403 aa39.35■■■■□ 3.89
RNF19B-201ENST00000235150 CUX1P39880 1505 aa39.34■■■■□ 3.89
RNF19B-201ENST00000235150 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.34■■■■□ 3.89
RNF19B-201ENST00000235150 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.27■■■■□ 3.88
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RNF19B-201ENST00000235150 KIF27Q86VH2 1401 aa38.93■■■■□ 3.82
RNF19B-201ENST00000235150 PRXQ9BXM0 1461 aa38.93■■■■□ 3.82
RNF19B-201ENST00000235150 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.87■■■■□ 3.81
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RNF19B-201ENST00000235150 CLIP1P30622 1438 aa38.83■■■■□ 3.81
RNF19B-201ENST00000235150 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.75■■■■□ 3.79
RNF19B-201ENST00000235150 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.73■■■■□ 3.79
RNF19B-201ENST00000235150 NESP48681 1621 aa38.72■■■■□ 3.79
RNF19B-201ENST00000235150 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.68■■■■□ 3.78
RNF19B-201ENST00000235150 CUX2O14529 1486 aa38.66■■■■□ 3.78
RNF19B-201ENST00000235150 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.62■■■■□ 3.77
RNF19B-201ENST00000235150 TOPBP1Q92547 1522 aa38.56■■■■□ 3.76
RNF19B-201ENST00000235150 IGF1RP08069 1367 aa38.52■■■■□ 3.76
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RNF19B-201ENST00000235150 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.38■■■■□ 3.73
RNF19B-201ENST00000235150 ARAP1Q96P48 1450 aa38.37■■■■□ 3.73
RNF19B-201ENST00000235150 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
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RNF19B-201ENST00000235150 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.27■■■■□ 3.72
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RNF19B-201ENST00000235150 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
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RNF19B-201ENST00000235150 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
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RNF19B-201ENST00000235150 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.9■■■■□ 3.66
RNF19B-201ENST00000235150 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
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RNF19B-201ENST00000235150 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
RNF19B-201ENST00000235150 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.78■■■■□ 3.64
RNF19B-201ENST00000235150 MAP3K1Q13233 1512 aa37.77■■■■□ 3.64
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