RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394588.3

NMB-202, Transcript of neuromedin B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NMB, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMB-202ENST00000394588 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.74■■■■■ 7.95
NMB-202ENST00000394588 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.58■■■■■ 6.81
NMB-202ENST00000394588 ABCC9O60706 1549 aa56.05■■■■■ 6.56
NMB-202ENST00000394588 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.04■■■■■ 6.24
NMB-202ENST00000394588 NACADO15069 1562 aa54.01■■■■■ 6.24
NMB-202ENST00000394588 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54■■■■■ 6.23
NMB-202ENST00000394588 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.84■■■■■ 6.21
NMB-202ENST00000394588 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.75■■■■■ 6.2
NMB-202ENST00000394588 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.59■■■■■ 6.17
NMB-202ENST00000394588 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.93■■■■■ 6.06
NMB-202ENST00000394588 SCRIBQ14160 1630 aa52.5■■■■■ 5.99
NMB-202ENST00000394588 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.43■■■■■ 5.98
NMB-202ENST00000394588 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.33■■■■■ 5.97
NMB-202ENST00000394588 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.86■■■■■ 5.89
NMB-202ENST00000394588 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.23■■■■■ 5.79
NMB-202ENST00000394588 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.01■■■■■ 5.76
NMB-202ENST00000394588 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.76■■■■■ 5.72
NMB-202ENST00000394588 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.4■■■■■ 5.66
NMB-202ENST00000394588 SMARCA4P51532 1647 aa50.25■■■■■ 5.63
NMB-202ENST00000394588 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.17■■■■■ 5.62
NMB-202ENST00000394588 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.91■■■■■ 5.58
NMB-202ENST00000394588 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.86■■■■■ 5.57
NMB-202ENST00000394588 SMARCA2P51531 1590 aa49.83■■■■■ 5.57
NMB-202ENST00000394588 NCAPD3P42695 1498 aa49.8■■■■■ 5.56
NMB-202ENST00000394588 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.75■■■■■ 5.55
NMB-202ENST00000394588 HMGXB3Q12766 1538 aa49.63■■■■■ 5.54
NMB-202ENST00000394588 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.46■■■■■ 5.51
NMB-202ENST00000394588 WIZO95785 1651 aa49.42■■■■■ 5.5
NMB-202ENST00000394588 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.35■■■■■ 5.49
NMB-202ENST00000394588 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.42
NMB-202ENST00000394588 NESP48681 1621 aa48.58■■■■■ 5.37
NMB-202ENST00000394588 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.51■■■■■ 5.36
NMB-202ENST00000394588 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.32■■■■■ 5.33
NMB-202ENST00000394588 ERCC6Q03468 1493 aa48.28■■■■■ 5.32
NMB-202ENST00000394588 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.26■■■■■ 5.32
NMB-202ENST00000394588 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.14■■■■■ 5.3
NMB-202ENST00000394588 CFTRP13569 1480 aa48.11■■■■■ 5.29
NMB-202ENST00000394588 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.09■■■■■ 5.29
NMB-202ENST00000394588 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.09■■■■■ 5.29
NMB-202ENST00000394588 PRDM2Q13029 1718 aa47.93■■■■■ 5.26
NMB-202ENST00000394588 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.26
NMB-202ENST00000394588 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.81■■■■■ 5.24
NMB-202ENST00000394588 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.75■■■■■ 5.23
NMB-202ENST00000394588 CUX2O14529 1486 aa47.73■■■■■ 5.23
NMB-202ENST00000394588 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.65■■■■■ 5.22
NMB-202ENST00000394588 WDR62O43379 1518 aa47.52■■■■■ 5.2
NMB-202ENST00000394588 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.35■■■■■ 5.17
NMB-202ENST00000394588 TOPBP1Q92547 1522 aa47.09■■■■■ 5.13
NMB-202ENST00000394588 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.08■■■■■ 5.13
NMB-202ENST00000394588 ABCC8Q09428 1581 aa47.06■■■■■ 5.12
NMB-202ENST00000394588 CUX1P39880 1505 aa46.82■■■■■ 5.09
NMB-202ENST00000394588 IFT140Q96RY7 1462 aa46.72■■■■■ 5.07
NMB-202ENST00000394588 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.7■■■■■ 5.07
NMB-202ENST00000394588 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.62■■■■■ 5.05
NMB-202ENST00000394588 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.61■■■■■ 5.05
NMB-202ENST00000394588 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.53■■■■■ 5.04
NMB-202ENST00000394588 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.51■■■■■ 5.04
NMB-202ENST00000394588 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.51■■■■■ 5.04
NMB-202ENST00000394588 SYNJ1O43426 1573 aa46.48■■■■■ 5.03
NMB-202ENST00000394588 TOP2BQ02880 1626 aa46.48■■■■■ 5.03
NMB-202ENST00000394588 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.47■■■■■ 5.03
NMB-202ENST00000394588 SOGA1O94964 1423 aa46.45■■■■■ 5.03
NMB-202ENST00000394588 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
NMB-202ENST00000394588 WDR97A6NE52 1622 aa46.33■■■■■ 5.01
NMB-202ENST00000394588 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.24■■■■■ 4.99
NMB-202ENST00000394588 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.17■■■■■ 4.98
NMB-202ENST00000394588 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.16■■■■■ 4.98
NMB-202ENST00000394588 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.04■■■■■ 4.96
NMB-202ENST00000394588 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.97■■■■■ 4.95
NMB-202ENST00000394588 PBRM1Q86U86 1689 aa45.96■■■■■ 4.95
NMB-202ENST00000394588 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.94■■■■■ 4.95
NMB-202ENST00000394588 GRIN2BQ13224 1484 aa45.93■■■■■ 4.94
NMB-202ENST00000394588 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.87■■■■■ 4.93
NMB-202ENST00000394588 CHD1O14646 1710 aa45.81■■■■■ 4.92
NMB-202ENST00000394588 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.8■■■■■ 4.92
NMB-202ENST00000394588 OSCARQ8IYS5 282 aa45.68■■■■■ 4.9
NMB-202ENST00000394588 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.62■■■■■ 4.89
NMB-202ENST00000394588 SYNJ2O15056 1496 aa45.61■■■■■ 4.89
NMB-202ENST00000394588 ADAMTS12P58397 1594 aa45.58■■■■■ 4.89
NMB-202ENST00000394588 FBLN2P98095 1184 aa45.56■■■■■ 4.88
NMB-202ENST00000394588 KIF27Q86VH2 1401 aa45.52■■■■■ 4.88
NMB-202ENST00000394588 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.48■■■■■ 4.87
NMB-202ENST00000394588 TRIM41Q8WV44 630 aa45.46■■■■■ 4.87
NMB-202ENST00000394588 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.42■■■■■ 4.86
NMB-202ENST00000394588 GRIN2AQ12879 1464 aa45.36■■■■■ 4.85
NMB-202ENST00000394588 CUL7Q14999 1698 aa45.3■■■■■ 4.84
NMB-202ENST00000394588 IGF1RP08069 1367 aa45.3■■■■■ 4.84
NMB-202ENST00000394588 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.29■■■■■ 4.84
NMB-202ENST00000394588 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.21■■■■■ 4.83
NMB-202ENST00000394588 CEP170Q5SW79 1584 aa45.16■■■■■ 4.82
NMB-202ENST00000394588 NUP160Q12769 1436 aa45.14■■■■■ 4.82
NMB-202ENST00000394588 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.09■■■■■ 4.81
NMB-202ENST00000394588 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.09■■■■■ 4.81
NMB-202ENST00000394588 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.09■■■■■ 4.81
NMB-202ENST00000394588 ARHGEF11O15085 1522 aa45.06■■■■■ 4.8
NMB-202ENST00000394588 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.05■■■■■ 4.8
NMB-202ENST00000394588 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.03■■■■■ 4.8
NMB-202ENST00000394588 SHROOM2Q13796 1616 aa44.85■■■■■ 4.77
NMB-202ENST00000394588 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.83■■■■■ 4.77
NMB-202ENST00000394588 EEA1Q15075 1411 aa44.78■■■■■ 4.76
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