RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409463.5

INPP4A-203, Transcript of inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene INPP4A, Length 1,565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4A-203ENST00000409463 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.07■■■■■ 7.21
INPP4A-203ENST00000409463 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.9■■■■■ 6.06
INPP4A-203ENST00000409463 ABCC9O60706 1549 aa50.63■■■■■ 5.7
INPP4A-203ENST00000409463 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.31■■■■■ 5.64
INPP4A-203ENST00000409463 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.83■■■■■ 5.57
INPP4A-203ENST00000409463 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.66■■■■■ 5.54
INPP4A-203ENST00000409463 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.37■■■■■ 5.49
INPP4A-203ENST00000409463 NACADO15069 1562 aa49.37■■■■■ 5.49
INPP4A-203ENST00000409463 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.16■■■■■ 5.46
INPP4A-203ENST00000409463 SCRIBQ14160 1630 aa48.49■■■■■ 5.35
INPP4A-203ENST00000409463 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.41■■■■■ 5.34
INPP4A-203ENST00000409463 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.33■■■■■ 5.33
INPP4A-203ENST00000409463 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.69■■■■■ 5.22
INPP4A-203ENST00000409463 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.52■■■■■ 5.2
INPP4A-203ENST00000409463 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.72■■■■■ 5.07
INPP4A-203ENST00000409463 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
INPP4A-203ENST00000409463 SMARCA4P51532 1647 aa46.42■■■■■ 5.02
INPP4A-203ENST00000409463 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.38■■■■■ 5.02
INPP4A-203ENST00000409463 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.32■■■■■ 5.01
INPP4A-203ENST00000409463 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.24■■■■■ 4.99
INPP4A-203ENST00000409463 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
INPP4A-203ENST00000409463 WIZO95785 1651 aa46.06■■■■■ 4.96
INPP4A-203ENST00000409463 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.87■■■■■ 4.93
INPP4A-203ENST00000409463 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.85■■■■■ 4.93
INPP4A-203ENST00000409463 SMARCA2P51531 1590 aa45.77■■■■■ 4.92
INPP4A-203ENST00000409463 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.77■■■■■ 4.92
INPP4A-203ENST00000409463 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.51■■■■■ 4.88
INPP4A-203ENST00000409463 NCAPD3P42695 1498 aa45.49■■■■■ 4.87
INPP4A-203ENST00000409463 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.49■■■■■ 4.87
INPP4A-203ENST00000409463 HMGXB3Q12766 1538 aa45.43■■■■■ 4.86
INPP4A-203ENST00000409463 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.31■■■■■ 4.84
INPP4A-203ENST00000409463 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.97■■■■■ 4.79
INPP4A-203ENST00000409463 PRDM2Q13029 1718 aa44.28■■■■■ 4.68
INPP4A-203ENST00000409463 CFTRP13569 1480 aa44.27■■■■■ 4.68
INPP4A-203ENST00000409463 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.26■■■■■ 4.68
INPP4A-203ENST00000409463 NESP48681 1621 aa44.21■■■■■ 4.67
INPP4A-203ENST00000409463 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.18■■■■■ 4.66
INPP4A-203ENST00000409463 ABCC8Q09428 1581 aa43.83■■■■■ 4.61
INPP4A-203ENST00000409463 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.82■■■■■ 4.61
INPP4A-203ENST00000409463 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.82■■■■■ 4.61
INPP4A-203ENST00000409463 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.78■■■■■ 4.6
INPP4A-203ENST00000409463 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.71■■■■■ 4.59
INPP4A-203ENST00000409463 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.65■■■■■ 4.58
INPP4A-203ENST00000409463 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.57■■■■■ 4.57
INPP4A-203ENST00000409463 ERCC6Q03468 1493 aa43.5■■■■■ 4.55
INPP4A-203ENST00000409463 SYNJ1O43426 1573 aa43.5■■■■■ 4.55
INPP4A-203ENST00000409463 TRIM41Q8WV44 630 aa43.44■■■■■ 4.54
INPP4A-203ENST00000409463 CUX1P39880 1505 aa43.44■■■■■ 4.54
INPP4A-203ENST00000409463 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.4■■■■■ 4.54
INPP4A-203ENST00000409463 TOP2BQ02880 1626 aa43.39■■■■■ 4.54
INPP4A-203ENST00000409463 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.33■■■■■ 4.53
INPP4A-203ENST00000409463 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
INPP4A-203ENST00000409463 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.3■■■■■ 4.52
INPP4A-203ENST00000409463 TOPBP1Q92547 1522 aa43.28■■■■■ 4.52
INPP4A-203ENST00000409463 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
INPP4A-203ENST00000409463 WDR62O43379 1518 aa43.13■■■■■ 4.49
INPP4A-203ENST00000409463 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.08■■■■■ 4.49
INPP4A-203ENST00000409463 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
INPP4A-203ENST00000409463 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.83■■■■■ 4.45
INPP4A-203ENST00000409463 SOGA1O94964 1423 aa42.81■■■■■ 4.44
INPP4A-203ENST00000409463 CUX2O14529 1486 aa42.77■■■■■ 4.44
INPP4A-203ENST00000409463 WDR97A6NE52 1622 aa42.75■■■■■ 4.43
INPP4A-203ENST00000409463 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
INPP4A-203ENST00000409463 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.67■■■■■ 4.42
INPP4A-203ENST00000409463 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.67■■■■■ 4.42
INPP4A-203ENST00000409463 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
INPP4A-203ENST00000409463 IFT140Q96RY7 1462 aa42.62■■■■■ 4.41
INPP4A-203ENST00000409463 KIF27Q86VH2 1401 aa42.53■■■■■ 4.4
INPP4A-203ENST00000409463 EEA1Q15075 1411 aa42.5■■■■■ 4.39
INPP4A-203ENST00000409463 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.46■■■■■ 4.39
INPP4A-203ENST00000409463 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
INPP4A-203ENST00000409463 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
INPP4A-203ENST00000409463 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
INPP4A-203ENST00000409463 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.35■■■■■ 4.37
INPP4A-203ENST00000409463 PBRM1Q86U86 1689 aa42.35■■■■■ 4.37
INPP4A-203ENST00000409463 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.34■■■■■ 4.376e-7■■■■■ 28.3
INPP4A-203ENST00000409463 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.31■■■■■ 4.36
INPP4A-203ENST00000409463 IGF1RP08069 1367 aa42.2■■■■■ 4.35
INPP4A-203ENST00000409463 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.18■■■■■ 4.34
INPP4A-203ENST00000409463 GRIN2BQ13224 1484 aa42.13■■■■■ 4.34
INPP4A-203ENST00000409463 CUL7Q14999 1698 aa42.12■■■■■ 4.33
INPP4A-203ENST00000409463 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.09■■■■■ 4.33
INPP4A-203ENST00000409463 KIF21BO75037 1637 aa42.09■■■■■ 4.33
INPP4A-203ENST00000409463 PRXQ9BXM0 1461 aa42.03■■■■■ 4.32
INPP4A-203ENST00000409463 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.02■■■■■ 4.32
INPP4A-203ENST00000409463 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42■■■■■ 4.31
INPP4A-203ENST00000409463 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.97■■■■■ 4.31
INPP4A-203ENST00000409463 ADAMTS12P58397 1594 aa41.97■■■■■ 4.31
INPP4A-203ENST00000409463 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.94■■■■■ 4.31
INPP4A-203ENST00000409463 GOLGA3Q08378 1498 aa41.91■■■■■ 4.3
INPP4A-203ENST00000409463 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
INPP4A-203ENST00000409463 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.85■■■■■ 4.29
INPP4A-203ENST00000409463 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
INPP4A-203ENST00000409463 SYNJ2O15056 1496 aa41.73■■■■■ 4.27
INPP4A-203ENST00000409463 CHD1O14646 1710 aa41.69■■■■■ 4.26
INPP4A-203ENST00000409463 GRIN2AQ12879 1464 aa41.63■■■■■ 4.25
INPP4A-203ENST00000409463 FBLN2P98095 1184 aa41.63■■■■■ 4.25
INPP4A-203ENST00000409463 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
INPP4A-203ENST00000409463 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.62■■■■■ 4.25
INPP4A-203ENST00000409463 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.57■■■■■ 4.25
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