RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389395.7

MFSD12-202, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 12, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MFSD12, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD12-202ENST00000389395 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.62■■■■■ 6.97
MFSD12-202ENST00000389395 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.33■■■■■ 5.81
MFSD12-202ENST00000389395 ABCC9O60706 1549 aa49.3■■■■■ 5.48
MFSD12-202ENST00000389395 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.09■■■■■ 5.45
MFSD12-202ENST00000389395 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.78■■■■■ 5.4
MFSD12-202ENST00000389395 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.39■■■■■ 5.34
MFSD12-202ENST00000389395 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.06■■■■■ 5.28
MFSD12-202ENST00000389395 NACADO15069 1562 aa48.01■■■■■ 5.28
MFSD12-202ENST00000389395 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.77■■■■■ 5.24
MFSD12-202ENST00000389395 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.47■■■■■ 5.19
MFSD12-202ENST00000389395 SCRIBQ14160 1630 aa47.22■■■■■ 5.15
MFSD12-202ENST00000389395 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.78■■■■■ 5.08
MFSD12-202ENST00000389395 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.42■■■■■ 5.02
MFSD12-202ENST00000389395 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.37■■■■■ 5.01
MFSD12-202ENST00000389395 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.67■■■■■ 4.9
MFSD12-202ENST00000389395 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
MFSD12-202ENST00000389395 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.29■■■■■ 4.84
MFSD12-202ENST00000389395 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
MFSD12-202ENST00000389395 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.25■■■■■ 4.83
MFSD12-202ENST00000389395 SMARCA4P51532 1647 aa45.18■■■■■ 4.82
MFSD12-202ENST00000389395 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.04■■■■■ 4.8
MFSD12-202ENST00000389395 WIZO95785 1651 aa44.88■■■■■ 4.77
MFSD12-202ENST00000389395 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.65■■■■■ 4.74
MFSD12-202ENST00000389395 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.63■■■■■ 4.74
MFSD12-202ENST00000389395 SMARCA2P51531 1590 aa44.55■■■■■ 4.72
MFSD12-202ENST00000389395 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.55■■■■■ 4.72
MFSD12-202ENST00000389395 NCAPD3P42695 1498 aa44.35■■■■■ 4.69
MFSD12-202ENST00000389395 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
MFSD12-202ENST00000389395 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
MFSD12-202ENST00000389395 HMGXB3Q12766 1538 aa44.19■■■■■ 4.66
MFSD12-202ENST00000389395 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.16■■■■■ 4.66
MFSD12-202ENST00000389395 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.95■■■■■ 4.63
MFSD12-202ENST00000389395 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.2■■■■■ 4.51
MFSD12-202ENST00000389395 CFTRP13569 1480 aa43.19■■■■■ 4.5
MFSD12-202ENST00000389395 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.15■■■■■ 4.5
MFSD12-202ENST00000389395 NESP48681 1621 aa43.08■■■■■ 4.49
MFSD12-202ENST00000389395 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.92■■■■■ 4.46
MFSD12-202ENST00000389395 ABCC8Q09428 1581 aa42.83■■■■■ 4.45
MFSD12-202ENST00000389395 PRDM2Q13029 1718 aa42.82■■■■■ 4.45
MFSD12-202ENST00000389395 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.71■■■■■ 4.43
MFSD12-202ENST00000389395 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.65■■■■■ 4.42
MFSD12-202ENST00000389395 TRIM41Q8WV44 630 aa42.65■■■■■ 4.42
MFSD12-202ENST00000389395 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.6■■■■■ 4.41
MFSD12-202ENST00000389395 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.49■■■■■ 4.39
MFSD12-202ENST00000389395 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.48■■■■■ 4.39
MFSD12-202ENST00000389395 SYNJ1O43426 1573 aa42.45■■■■■ 4.39
MFSD12-202ENST00000389395 CUX1P39880 1505 aa42.38■■■■■ 4.37
MFSD12-202ENST00000389395 ERCC6Q03468 1493 aa42.31■■■■■ 4.36
MFSD12-202ENST00000389395 TOP2BQ02880 1626 aa42.29■■■■■ 4.36
MFSD12-202ENST00000389395 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.23■■■■■ 4.35
MFSD12-202ENST00000389395 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
MFSD12-202ENST00000389395 TOPBP1Q92547 1522 aa42.17■■■■■ 4.34
MFSD12-202ENST00000389395 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.16■■■■■ 4.34
MFSD12-202ENST00000389395 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.13■■■■■ 4.33
MFSD12-202ENST00000389395 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.03■■■■■ 4.32
MFSD12-202ENST00000389395 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
MFSD12-202ENST00000389395 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
MFSD12-202ENST00000389395 WDR62O43379 1518 aa41.92■■■■■ 4.3
MFSD12-202ENST00000389395 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
MFSD12-202ENST00000389395 SOGA1O94964 1423 aa41.91■■■■■ 4.3
MFSD12-202ENST00000389395 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.83■■■■■ 4.29
MFSD12-202ENST00000389395 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.8■■■■■ 4.28
MFSD12-202ENST00000389395 CUX2O14529 1486 aa41.68■■■■■ 4.26
MFSD12-202ENST00000389395 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.61■■■■■ 4.25
MFSD12-202ENST00000389395 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.6■■■■■ 4.25
MFSD12-202ENST00000389395 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
MFSD12-202ENST00000389395 KIF27Q86VH2 1401 aa41.57■■■■■ 4.25
MFSD12-202ENST00000389395 EEA1Q15075 1411 aa41.56■■■■■ 4.24
MFSD12-202ENST00000389395 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.51■■■■■ 4.24
MFSD12-202ENST00000389395 IFT140Q96RY7 1462 aa41.51■■■■■ 4.23
MFSD12-202ENST00000389395 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
MFSD12-202ENST00000389395 WDR97A6NE52 1622 aa41.49■■■■■ 4.23
MFSD12-202ENST00000389395 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.41■■■■■ 4.22
MFSD12-202ENST00000389395 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
MFSD12-202ENST00000389395 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.215e-8■■■■■ 27
MFSD12-202ENST00000389395 IGF1RP08069 1367 aa41.31■■■■■ 4.2
MFSD12-202ENST00000389395 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.31■■■■■ 4.2
MFSD12-202ENST00000389395 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.3■■■■■ 4.2
MFSD12-202ENST00000389395 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
MFSD12-202ENST00000389395 PRXQ9BXM0 1461 aa41.12■■■■■ 4.17
MFSD12-202ENST00000389395 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.1■■■■■ 4.17
MFSD12-202ENST00000389395 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.08■■■■■ 4.17
MFSD12-202ENST00000389395 GRIN2BQ13224 1484 aa41.07■■■■■ 4.17
MFSD12-202ENST00000389395 KIF21BO75037 1637 aa41.07■■■■■ 4.16
MFSD12-202ENST00000389395 PBRM1Q86U86 1689 aa41.06■■■■■ 4.16
MFSD12-202ENST00000389395 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.06■■■■■ 4.16
MFSD12-202ENST00000389395 GOLGA3Q08378 1498 aa41■■■■■ 4.15
MFSD12-202ENST00000389395 CUL7Q14999 1698 aa40.95■■■■■ 4.15
MFSD12-202ENST00000389395 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
MFSD12-202ENST00000389395 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.9■■■■■ 4.14
MFSD12-202ENST00000389395 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.83■■■■■ 4.13
MFSD12-202ENST00000389395 ADAMTS12P58397 1594 aa40.82■■■■■ 4.13
MFSD12-202ENST00000389395 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
MFSD12-202ENST00000389395 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.76■■■■■ 4.12
MFSD12-202ENST00000389395 FBLN2P98095 1184 aa40.67■■■■■ 4.1
MFSD12-202ENST00000389395 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
MFSD12-202ENST00000389395 SYNJ2O15056 1496 aa40.65■■■■■ 4.1
MFSD12-202ENST00000389395 GRIN2AQ12879 1464 aa40.57■■■■■ 4.09
MFSD12-202ENST00000389395 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
MFSD12-202ENST00000389395 CEP162Q5TB80 1403 aa40.52■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms