RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614025.4

LANCL3-203, Transcript of LanC like 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LANCL3, Length 1,469 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL3-203ENST00000614025 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.88■■■■■ 7.98
LANCL3-203ENST00000614025 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.66■■■■■ 6.82
LANCL3-203ENST00000614025 ABCC9O60706 1549 aa56.43■■■■■ 6.62
LANCL3-203ENST00000614025 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.27■■■■■ 6.28
LANCL3-203ENST00000614025 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.23■■■■■ 6.27
LANCL3-203ENST00000614025 NACADO15069 1562 aa54.22■■■■■ 6.27
LANCL3-203ENST00000614025 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.04■■■■■ 6.24
LANCL3-203ENST00000614025 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.9■■■■■ 6.22
LANCL3-203ENST00000614025 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.68■■■■■ 6.18
LANCL3-203ENST00000614025 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.09■■■■■ 6.09
LANCL3-203ENST00000614025 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.75■■■■■ 6.04
LANCL3-203ENST00000614025 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.66■■■■■ 6.02
LANCL3-203ENST00000614025 SCRIBQ14160 1630 aa52.62■■■■■ 6.01
LANCL3-203ENST00000614025 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.05■■■■■ 5.92
LANCL3-203ENST00000614025 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.84■■■■■ 5.89
LANCL3-203ENST00000614025 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.25■■■■■ 5.79
LANCL3-203ENST00000614025 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.04■■■■■ 5.76
LANCL3-203ENST00000614025 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.7■■■■■ 5.71
LANCL3-203ENST00000614025 SMARCA4P51532 1647 aa50.34■■■■■ 5.65
LANCL3-203ENST00000614025 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.27■■■■■ 5.64
LANCL3-203ENST00000614025 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.07■■■■■ 5.61
LANCL3-203ENST00000614025 NCAPD3P42695 1498 aa50.05■■■■■ 5.6
LANCL3-203ENST00000614025 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.01■■■■■ 5.6
LANCL3-203ENST00000614025 SMARCA2P51531 1590 aa50■■■■■ 5.59
LANCL3-203ENST00000614025 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.85■■■■■ 5.57
LANCL3-203ENST00000614025 HMGXB3Q12766 1538 aa49.78■■■■■ 5.56
LANCL3-203ENST00000614025 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.64■■■■■ 5.54
LANCL3-203ENST00000614025 WIZO95785 1651 aa49.48■■■■■ 5.51
LANCL3-203ENST00000614025 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.45■■■■■ 5.51
LANCL3-203ENST00000614025 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.92■■■■■ 5.42
LANCL3-203ENST00000614025 NESP48681 1621 aa48.85■■■■■ 5.41
LANCL3-203ENST00000614025 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.71■■■■■ 5.39
LANCL3-203ENST00000614025 ERCC6Q03468 1493 aa48.61■■■■■ 5.37
LANCL3-203ENST00000614025 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.59■■■■■ 5.37
LANCL3-203ENST00000614025 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.38■■■■■ 5.34
LANCL3-203ENST00000614025 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.38■■■■■ 5.33
LANCL3-203ENST00000614025 CFTRP13569 1480 aa48.31■■■■■ 5.32
LANCL3-203ENST00000614025 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.27■■■■■ 5.32
LANCL3-203ENST00000614025 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.22■■■■■ 5.31
LANCL3-203ENST00000614025 CUX2O14529 1486 aa48.1■■■■■ 5.29
LANCL3-203ENST00000614025 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.08■■■■■ 5.29
LANCL3-203ENST00000614025 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.02■■■■■ 5.28
LANCL3-203ENST00000614025 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.94■■■■■ 5.26
LANCL3-203ENST00000614025 PRDM2Q13029 1718 aa47.93■■■■■ 5.26
LANCL3-203ENST00000614025 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.87■■■■■ 5.25
LANCL3-203ENST00000614025 WDR62O43379 1518 aa47.72■■■■■ 5.23
LANCL3-203ENST00000614025 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.55■■■■■ 5.2
LANCL3-203ENST00000614025 TOPBP1Q92547 1522 aa47.26■■■■■ 5.16
LANCL3-203ENST00000614025 ABCC8Q09428 1581 aa47.25■■■■■ 5.15
LANCL3-203ENST00000614025 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.19■■■■■ 5.15
LANCL3-203ENST00000614025 IFT140Q96RY7 1462 aa46.95■■■■■ 5.11
LANCL3-203ENST00000614025 CUX1P39880 1505 aa46.91■■■■■ 5.1
LANCL3-203ENST00000614025 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.86■■■■■ 5.09
LANCL3-203ENST00000614025 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
LANCL3-203ENST00000614025 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.75■■■■■ 5.07
LANCL3-203ENST00000614025 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.74■■■■■ 5.07
LANCL3-203ENST00000614025 SOGA1O94964 1423 aa46.68■■■■■ 5.06
LANCL3-203ENST00000614025 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.67■■■■■ 5.06
LANCL3-203ENST00000614025 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.66■■■■■ 5.06
LANCL3-203ENST00000614025 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.61■■■■■ 5.05
LANCL3-203ENST00000614025 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
LANCL3-203ENST00000614025 TOP2BQ02880 1626 aa46.51■■■■■ 5.04
LANCL3-203ENST00000614025 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.51■■■■■ 5.04
LANCL3-203ENST00000614025 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.5■■■■■ 5.03
LANCL3-203ENST00000614025 SYNJ1O43426 1573 aa46.5■■■■■ 5.03
LANCL3-203ENST00000614025 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
LANCL3-203ENST00000614025 WDR97A6NE52 1622 aa46.36■■■■■ 5.01
LANCL3-203ENST00000614025 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.3■■■■■ 5
LANCL3-203ENST00000614025 OSCARQ8IYS5 282 aa46.16■■■■■ 4.98
LANCL3-203ENST00000614025 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.13■■■■■ 4.98
LANCL3-203ENST00000614025 GRIN2BQ13224 1484 aa46.11■■■■■ 4.97
LANCL3-203ENST00000614025 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.1■■■■■ 4.97
LANCL3-203ENST00000614025 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.04■■■■■ 4.96
LANCL3-203ENST00000614025 PBRM1Q86U86 1689 aa46.02■■■■■ 4.96
LANCL3-203ENST00000614025 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.99■■■■■ 4.95
LANCL3-203ENST00000614025 CHD1O14646 1710 aa45.98■■■■■ 4.95
LANCL3-203ENST00000614025 FBLN2P98095 1184 aa45.93■■■■■ 4.94
LANCL3-203ENST00000614025 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
LANCL3-203ENST00000614025 SYNJ2O15056 1496 aa45.81■■■■■ 4.92
LANCL3-203ENST00000614025 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.73■■■■■ 4.91
LANCL3-203ENST00000614025 ADAMTS12P58397 1594 aa45.65■■■■■ 4.9
LANCL3-203ENST00000614025 KIF27Q86VH2 1401 aa45.63■■■■■ 4.9
LANCL3-203ENST00000614025 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.59■■■■■ 4.89
LANCL3-203ENST00000614025 TRIM41Q8WV44 630 aa45.53■■■■■ 4.88
LANCL3-203ENST00000614025 GRIN2AQ12879 1464 aa45.52■■■■■ 4.88
LANCL3-203ENST00000614025 IGF1RP08069 1367 aa45.48■■■■■ 4.87
LANCL3-203ENST00000614025 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.47■■■■■ 4.87
LANCL3-203ENST00000614025 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.39■■■■■ 4.86
LANCL3-203ENST00000614025 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.39■■■■■ 4.86
LANCL3-203ENST00000614025 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.39■■■■■ 4.86
LANCL3-203ENST00000614025 ARHGEF11O15085 1522 aa45.38■■■■■ 4.85
LANCL3-203ENST00000614025 NUP160Q12769 1436 aa45.32■■■■■ 4.85
LANCL3-203ENST00000614025 CUL7Q14999 1698 aa45.31■■■■■ 4.84
LANCL3-203ENST00000614025 CEP170Q5SW79 1584 aa45.3■■■■■ 4.84
LANCL3-203ENST00000614025 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.26■■■■■ 4.84
LANCL3-203ENST00000614025 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.19■■■■■ 4.82
LANCL3-203ENST00000614025 ARAP1Q96P48 1450 aa45.02■■■■■ 4.8
LANCL3-203ENST00000614025 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.01■■■■■ 4.8
LANCL3-203ENST00000614025 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.99■■■■■ 4.79
LANCL3-203ENST00000614025 SHROOM2Q13796 1616 aa44.99■■■■■ 4.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms