RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253968.10

BARX1-201, Transcript of BARX homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BARX1, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1-201ENST00000253968 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.72■■■■■ 7.47
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BARX1-201ENST00000253968 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.1■■■■■ 5.77
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BARX1-201ENST00000253968 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.91■■■■■ 5.74
BARX1-201ENST00000253968 SCRIBQ14160 1630 aa49.84■■■■■ 5.57
BARX1-201ENST00000253968 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.81■■■■■ 5.56
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BARX1-201ENST00000253968 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.59■■■■■ 5.21
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BARX1-201ENST00000253968 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.24■■■■■ 5.15
BARX1-201ENST00000253968 SMARCA2P51531 1590 aa47.23■■■■■ 5.15
BARX1-201ENST00000253968 WIZO95785 1651 aa47.14■■■■■ 5.14
BARX1-201ENST00000253968 NCAPD3P42695 1498 aa47.08■■■■■ 5.13
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BARX1-201ENST00000253968 NESP48681 1621 aa45.74■■■■■ 4.91
BARX1-201ENST00000253968 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.73■■■■■ 4.91
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BARX1-201ENST00000253968 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.37■■■■■ 4.85
BARX1-201ENST00000253968 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.26■■■■■ 4.84
BARX1-201ENST00000253968 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.24■■■■■ 4.83
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BARX1-201ENST00000253968 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.12■■■■■ 4.81
BARX1-201ENST00000253968 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.88■■■■■ 4.78
BARX1-201ENST00000253968 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
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BARX1-201ENST00000253968 WDR62O43379 1518 aa44.71■■■■■ 4.75
BARX1-201ENST00000253968 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.65■■■■■ 4.74
BARX1-201ENST00000253968 TOPBP1Q92547 1522 aa44.62■■■■■ 4.73
BARX1-201ENST00000253968 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.61■■■■■ 4.73
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BARX1-201ENST00000253968 SYNJ1O43426 1573 aa44.49■■■■■ 4.71
BARX1-201ENST00000253968 TOP2BQ02880 1626 aa44.44■■■■■ 4.71
BARX1-201ENST00000253968 CUX2O14529 1486 aa44.44■■■■■ 4.7
BARX1-201ENST00000253968 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.44■■■■■ 4.7
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BARX1-201ENST00000253968 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.12■■■■■ 4.65
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BARX1-201ENST00000253968 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.1■■■■■ 4.65
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BARX1-201ENST00000253968 WDR97A6NE52 1622 aa43.93■■■■■ 4.62
BARX1-201ENST00000253968 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.93■■■■■ 4.62
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BARX1-201ENST00000253968 KIF27Q86VH2 1401 aa43.61■■■■■ 4.57
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BARX1-201ENST00000253968 EEA1Q15075 1411 aa43.32■■■■■ 4.53
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BARX1-201ENST00000253968 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.13■■■■■ 4.5
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BARX1-201ENST00000253968 CEP170Q5SW79 1584 aa42.73■■■■■ 4.43
BARX1-201ENST00000253968 OSCARQ8IYS5 282 aa42.73■■■■■ 4.43
BARX1-201ENST00000253968 NUP160Q12769 1436 aa42.73■■■■■ 4.43
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BARX1-201ENST00000253968 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.6■■■■■ 4.41
BARX1-201ENST00000253968 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.58■■■■■ 4.41
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