RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269720.6

MISP3-201, Transcript of MISP family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MISP3, Length 1,424 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISP3-201ENST00000269720 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.19■■■■■ 8.03
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MISP3-201ENST00000269720 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.58■■■■■ 6.33
MISP3-201ENST00000269720 NACADO15069 1562 aa54.53■■■■■ 6.32
MISP3-201ENST00000269720 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.52■■■■■ 6.32
MISP3-201ENST00000269720 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.29■■■■■ 6.28
MISP3-201ENST00000269720 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.2■■■■■ 6.27
MISP3-201ENST00000269720 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.94■■■■■ 6.22
MISP3-201ENST00000269720 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.22■■■■■ 6.11
MISP3-201ENST00000269720 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.13■■■■■ 6.1
MISP3-201ENST00000269720 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.95■■■■■ 6.07
MISP3-201ENST00000269720 SCRIBQ14160 1630 aa52.86■■■■■ 6.05
MISP3-201ENST00000269720 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.41■■■■■ 5.98
MISP3-201ENST00000269720 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.3■■■■■ 5.96
MISP3-201ENST00000269720 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.56■■■■■ 5.85
MISP3-201ENST00000269720 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.36■■■■■ 5.81
MISP3-201ENST00000269720 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.08■■■■■ 5.77
MISP3-201ENST00000269720 SMARCA4P51532 1647 aa50.55■■■■■ 5.68
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MISP3-201ENST00000269720 NCAPD3P42695 1498 aa50.36■■■■■ 5.65
MISP3-201ENST00000269720 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.36■■■■■ 5.65
MISP3-201ENST00000269720 SMARCA2P51531 1590 aa50.26■■■■■ 5.64
MISP3-201ENST00000269720 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.23■■■■■ 5.63
MISP3-201ENST00000269720 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.09■■■■■ 5.61
MISP3-201ENST00000269720 HMGXB3Q12766 1538 aa50.06■■■■■ 5.6
MISP3-201ENST00000269720 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.92■■■■■ 5.58
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MISP3-201ENST00000269720 WIZO95785 1651 aa49.63■■■■■ 5.54
MISP3-201ENST00000269720 NESP48681 1621 aa49.15■■■■■ 5.46
MISP3-201ENST00000269720 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.13■■■■■ 5.46
MISP3-201ENST00000269720 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.99■■■■■ 5.43
MISP3-201ENST00000269720 ERCC6Q03468 1493 aa48.98■■■■■ 5.43
MISP3-201ENST00000269720 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.9■■■■■ 5.42
MISP3-201ENST00000269720 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.71■■■■■ 5.39
MISP3-201ENST00000269720 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.59■■■■■ 5.37
MISP3-201ENST00000269720 CFTRP13569 1480 aa48.58■■■■■ 5.37
MISP3-201ENST00000269720 CUX2O14529 1486 aa48.51■■■■■ 5.36
MISP3-201ENST00000269720 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.46■■■■■ 5.35
MISP3-201ENST00000269720 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.38■■■■■ 5.34
MISP3-201ENST00000269720 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.32■■■■■ 5.33
MISP3-201ENST00000269720 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.31■■■■■ 5.32
MISP3-201ENST00000269720 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.24■■■■■ 5.31
MISP3-201ENST00000269720 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.2■■■■■ 5.31
MISP3-201ENST00000269720 WDR62O43379 1518 aa48.03■■■■■ 5.28
MISP3-201ENST00000269720 PRDM2Q13029 1718 aa48.01■■■■■ 5.28
MISP3-201ENST00000269720 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.82■■■■■ 5.25
MISP3-201ENST00000269720 TOPBP1Q92547 1522 aa47.51■■■■■ 5.2
MISP3-201ENST00000269720 ABCC8Q09428 1581 aa47.5■■■■■ 5.19
MISP3-201ENST00000269720 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.43■■■■■ 5.18
MISP3-201ENST00000269720 IFT140Q96RY7 1462 aa47.25■■■■■ 5.15
MISP3-201ENST00000269720 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.17■■■■■ 5.14
MISP3-201ENST00000269720 CUX1P39880 1505 aa47.13■■■■■ 5.13
MISP3-201ENST00000269720 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.12■■■■■ 5.13
MISP3-201ENST00000269720 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.05■■■■■ 5.12
MISP3-201ENST00000269720 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.98■■■■■ 5.11
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MISP3-201ENST00000269720 SOGA1O94964 1423 aa46.94■■■■■ 5.1
MISP3-201ENST00000269720 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.92■■■■■ 5.1
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MISP3-201ENST00000269720 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.07
MISP3-201ENST00000269720 TOP2BQ02880 1626 aa46.67■■■■■ 5.06
MISP3-201ENST00000269720 SYNJ1O43426 1573 aa46.65■■■■■ 5.06
MISP3-201ENST00000269720 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.64■■■■■ 5.06
MISP3-201ENST00000269720 WDR97A6NE52 1622 aa46.59■■■■■ 5.05
MISP3-201ENST00000269720 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.54■■■■■ 5.04
MISP3-201ENST00000269720 OSCARQ8IYS5 282 aa46.52■■■■■ 5.04
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MISP3-201ENST00000269720 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.33■■■■■ 5.01
MISP3-201ENST00000269720 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.31■■■■■ 5
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MISP3-201ENST00000269720 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.11■■■■■ 4.97
MISP3-201ENST00000269720 SYNJ2O15056 1496 aa46.1■■■■■ 4.97
MISP3-201ENST00000269720 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.96■■■■■ 4.95
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MISP3-201ENST00000269720 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.76■■■■■ 4.92
MISP3-201ENST00000269720 ARHGEF11O15085 1522 aa45.72■■■■■ 4.91
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MISP3-201ENST00000269720 TRIM41Q8WV44 630 aa45.66■■■■■ 4.9
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MISP3-201ENST00000269720 CEP170Q5SW79 1584 aa45.54■■■■■ 4.88
MISP3-201ENST00000269720 CUL7Q14999 1698 aa45.47■■■■■ 4.87
MISP3-201ENST00000269720 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.42■■■■■ 4.86
MISP3-201ENST00000269720 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.39■■■■■ 4.86
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MISP3-201ENST00000269720 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.35■■■■■ 4.85
MISP3-201ENST00000269720 SHROOM2Q13796 1616 aa45.2■■■■■ 4.83
MISP3-201ENST00000269720 JPH4Q96JJ6 628 aa45.16■■■■■ 4.82
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