RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545111.6

SV2B-203, Transcript of synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SV2B, Length 2,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2B-203ENST00000545111 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.44■■■■■ 6.79
SV2B-203ENST00000545111 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.07■■■■■ 5.61
SV2B-203ENST00000545111 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.23■■■■■ 5.31
SV2B-203ENST00000545111 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.52■■■■■ 5.2
SV2B-203ENST00000545111 ABCC9O60706 1549 aa47.48■■■■■ 5.19
SV2B-203ENST00000545111 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.47■■■■■ 5.19
SV2B-203ENST00000545111 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.94■■■■■ 5.1
SV2B-203ENST00000545111 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.84■■■■■ 5.09
SV2B-203ENST00000545111 NACADO15069 1562 aa46.68■■■■■ 5.06
SV2B-203ENST00000545111 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.29■■■■■ 5
SV2B-203ENST00000545111 SCRIBQ14160 1630 aa46.07■■■■■ 4.97
SV2B-203ENST00000545111 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.35■■■■■ 4.85
SV2B-203ENST00000545111 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.05■■■■■ 4.8
SV2B-203ENST00000545111 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.92■■■■■ 4.78
SV2B-203ENST00000545111 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.79■■■■■ 4.76
SV2B-203ENST00000545111 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.66■■■■■ 4.74
SV2B-203ENST00000545111 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
SV2B-203ENST00000545111 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.38■■■■■ 4.7
SV2B-203ENST00000545111 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
SV2B-203ENST00000545111 SMARCA4P51532 1647 aa44.15■■■■■ 4.66
SV2B-203ENST00000545111 WIZO95785 1651 aa44.01■■■■■ 4.64
SV2B-203ENST00000545111 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.62■■■■■ 4.57
SV2B-203ENST00000545111 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
SV2B-203ENST00000545111 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
SV2B-203ENST00000545111 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.47■■■■■ 4.55
SV2B-203ENST00000545111 SMARCA2P51531 1590 aa43.42■■■■■ 4.54
SV2B-203ENST00000545111 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
SV2B-203ENST00000545111 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.12■■■■■ 4.49
SV2B-203ENST00000545111 NCAPD3P42695 1498 aa43.11■■■■■ 4.49
SV2B-203ENST00000545111 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.08■■■■■ 4.49
SV2B-203ENST00000545111 HMGXB3Q12766 1538 aa43.02■■■■■ 4.48
SV2B-203ENST00000545111 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.95■■■■■ 4.47
SV2B-203ENST00000545111 TRIM41Q8WV44 630 aa42.35■■■■■ 4.37
SV2B-203ENST00000545111 ABCC8Q09428 1581 aa42.19■■■■■ 4.34
SV2B-203ENST00000545111 CFTRP13569 1480 aa42.14■■■■■ 4.34
SV2B-203ENST00000545111 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.01■■■■■ 4.32
SV2B-203ENST00000545111 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.98■■■■■ 4.31
SV2B-203ENST00000545111 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.93■■■■■ 4.3
SV2B-203ENST00000545111 PRDM2Q13029 1718 aa41.84■■■■■ 4.29
SV2B-203ENST00000545111 SYNJ1O43426 1573 aa41.74■■■■■ 4.27
SV2B-203ENST00000545111 NESP48681 1621 aa41.67■■■■■ 4.26
SV2B-203ENST00000545111 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.63■■■■■ 4.26
SV2B-203ENST00000545111 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
SV2B-203ENST00000545111 TOP2BQ02880 1626 aa41.58■■■■■ 4.25
SV2B-203ENST00000545111 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.54■■■■■ 4.24
SV2B-203ENST00000545111 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.52■■■■■ 4.24
SV2B-203ENST00000545111 CUX1P39880 1505 aa41.49■■■■■ 4.23
SV2B-203ENST00000545111 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.45■■■■■ 4.23
SV2B-203ENST00000545111 SOGA1O94964 1423 aa41.4■■■■■ 4.22
SV2B-203ENST00000545111 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.34■■■■■ 4.21
SV2B-203ENST00000545111 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.28■■■■■ 4.2
SV2B-203ENST00000545111 EEA1Q15075 1411 aa41.27■■■■■ 4.2
SV2B-203ENST00000545111 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.25■■■■■ 4.19
SV2B-203ENST00000545111 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.13■■■■■ 4.17
SV2B-203ENST00000545111 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.12■■■■■ 4.17
SV2B-203ENST00000545111 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.1■■■■■ 4.17
SV2B-203ENST00000545111 TOPBP1Q92547 1522 aa41.07■■■■■ 4.17
SV2B-203ENST00000545111 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.06■■■■■ 4.16
SV2B-203ENST00000545111 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
SV2B-203ENST00000545111 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.01■■■■■ 4.16
SV2B-203ENST00000545111 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.14
SV2B-203ENST00000545111 KIF27Q86VH2 1401 aa40.88■■■■■ 4.13
SV2B-203ENST00000545111 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.79■■■■■ 4.12
SV2B-203ENST00000545111 CUX2O14529 1486 aa40.79■■■■■ 4.12
SV2B-203ENST00000545111 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.75■■■■■ 4.11
SV2B-203ENST00000545111 KIF21BO75037 1637 aa40.72■■■■■ 4.11
SV2B-203ENST00000545111 ERCC6Q03468 1493 aa40.71■■■■■ 4.11
SV2B-203ENST00000545111 GOLGA3Q08378 1498 aa40.7■■■■■ 4.11
SV2B-203ENST00000545111 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.69■■■■■ 4.1
SV2B-203ENST00000545111 PRXQ9BXM0 1461 aa40.58■■■■■ 4.09
SV2B-203ENST00000545111 WDR62O43379 1518 aa40.58■■■■■ 4.09
SV2B-203ENST00000545111 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.58■■■■■ 4.09
SV2B-203ENST00000545111 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
SV2B-203ENST00000545111 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.55■■■■■ 4.08
SV2B-203ENST00000545111 IGF1RP08069 1367 aa40.54■■■■■ 4.08
SV2B-203ENST00000545111 WDR97A6NE52 1622 aa40.53■■■■■ 4.08
SV2B-203ENST00000545111 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.48■■■■■ 4.07
SV2B-203ENST00000545111 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
SV2B-203ENST00000545111 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
SV2B-203ENST00000545111 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
SV2B-203ENST00000545111 CEP162Q5TB80 1403 aa40.35■■■■■ 4.05
SV2B-203ENST00000545111 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.34■■■■■ 4.05
SV2B-203ENST00000545111 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.33■■■■■ 4.05
SV2B-203ENST00000545111 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.3■■■■■ 4.04
SV2B-203ENST00000545111 IFT140Q96RY7 1462 aa40.29■■■■■ 4.04
SV2B-203ENST00000545111 CUL7Q14999 1698 aa40.18■■■■■ 4.02
SV2B-203ENST00000545111 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.13■■■■■ 4.02
SV2B-203ENST00000545111 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
SV2B-203ENST00000545111 CLIP1P30622 1438 aa40.06■■■■■ 4
SV2B-203ENST00000545111 PBRM1Q86U86 1689 aa40.03■■■■■ 4
SV2B-203ENST00000545111 GRIN2BQ13224 1484 aa39.98■■■■□ 3.99
SV2B-203ENST00000545111 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
SV2B-203ENST00000545111 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
SV2B-203ENST00000545111 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.86■■■■□ 3.97
SV2B-203ENST00000545111 ADAMTS12P58397 1594 aa39.82■■■■□ 3.97
SV2B-203ENST00000545111 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.73■■■■□ 3.95
SV2B-203ENST00000545111 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.71■■■■□ 3.95
SV2B-203ENST00000545111 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.69■■■■□ 3.94
SV2B-203ENST00000545111 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.69■■■■□ 3.94
SV2B-203ENST00000545111 ARAP1Q96P48 1450 aa39.67■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms