RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318753.12

LRRC75B-201, Transcript of leucine rich repeat containing 75B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC75B, Length 1,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC75B-201ENST00000318753 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.19■■■■■ 8.51
LRRC75B-201ENST00000318753 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.89■■■■■ 7.34
LRRC75B-201ENST00000318753 ABCC9O60706 1549 aa60.31■■■■■ 7.25
LRRC75B-201ENST00000318753 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.61■■■■■ 6.81
LRRC75B-201ENST00000318753 NACADO15069 1562 aa57.37■■■■■ 6.77
LRRC75B-201ENST00000318753 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.2■■■■■ 6.75
LRRC75B-201ENST00000318753 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.78■■■■■ 6.68
LRRC75B-201ENST00000318753 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.68■■■■■ 6.66
LRRC75B-201ENST00000318753 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.51■■■■■ 6.64
LRRC75B-201ENST00000318753 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.32■■■■■ 6.61
LRRC75B-201ENST00000318753 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.25■■■■■ 6.62e-6■■□□□ 13.1
LRRC75B-201ENST00000318753 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.08■■■■■ 6.57
LRRC75B-201ENST00000318753 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.06■■■■■ 6.56
LRRC75B-201ENST00000318753 SCRIBQ14160 1630 aa55.6■■■■■ 6.49
LRRC75B-201ENST00000318753 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.16■■■■■ 6.42
LRRC75B-201ENST00000318753 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.56■■■■■ 6.32
LRRC75B-201ENST00000318753 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.53■■■■■ 6.32
LRRC75B-201ENST00000318753 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.22■■■■■ 6.27
LRRC75B-201ENST00000318753 SMARCA4P51532 1647 aa53.09■■■■■ 6.09
LRRC75B-201ENST00000318753 NCAPD3P42695 1498 aa52.98■■■■■ 6.07
LRRC75B-201ENST00000318753 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.95■■■■■ 6.07
LRRC75B-201ENST00000318753 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.85■■■■■ 6.05
LRRC75B-201ENST00000318753 SMARCA2P51531 1590 aa52.76■■■■■ 6.04
LRRC75B-201ENST00000318753 HMGXB3Q12766 1538 aa52.66■■■■■ 6.02
LRRC75B-201ENST00000318753 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.62■■■■■ 6.01
LRRC75B-201ENST00000318753 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.55■■■■■ 6
LRRC75B-201ENST00000318753 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.43■■■■■ 5.98
LRRC75B-201ENST00000318753 NESP48681 1621 aa52.06■■■■■ 5.92
LRRC75B-201ENST00000318753 WIZO95785 1651 aa52.04■■■■■ 5.92
LRRC75B-201ENST00000318753 ERCC6Q03468 1493 aa51.92■■■■■ 5.9
LRRC75B-201ENST00000318753 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.72■■■■■ 5.87
LRRC75B-201ENST00000318753 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.68■■■■■ 5.86
LRRC75B-201ENST00000318753 CUX2O14529 1486 aa51.61■■■■■ 5.85
LRRC75B-201ENST00000318753 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.42■■■■■ 5.82
LRRC75B-201ENST00000318753 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.39■■■■■ 5.82
LRRC75B-201ENST00000318753 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.38■■■■■ 5.82
LRRC75B-201ENST00000318753 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.34■■■■■ 5.81
LRRC75B-201ENST00000318753 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.29■■■■■ 5.8
LRRC75B-201ENST00000318753 CFTRP13569 1480 aa50.97■■■■■ 5.75
LRRC75B-201ENST00000318753 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.88■■■■■ 5.74
LRRC75B-201ENST00000318753 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.87■■■■■ 5.73
LRRC75B-201ENST00000318753 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.83■■■■■ 5.73
LRRC75B-201ENST00000318753 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.8■■■■■ 5.72
LRRC75B-201ENST00000318753 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.78■■■■■ 5.72
LRRC75B-201ENST00000318753 WDR62O43379 1518 aa50.77■■■■■ 5.72
LRRC75B-201ENST00000318753 PRDM2Q13029 1718 aa50.56■■■■■ 5.68
LRRC75B-201ENST00000318753 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.44■■■■■ 5.67
LRRC75B-201ENST00000318753 TOPBP1Q92547 1522 aa49.96■■■■■ 5.59
LRRC75B-201ENST00000318753 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.86■■■■■ 5.57
LRRC75B-201ENST00000318753 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.83■■■■■ 5.57
LRRC75B-201ENST00000318753 ABCC8Q09428 1581 aa49.77■■■■■ 5.56
LRRC75B-201ENST00000318753 IFT140Q96RY7 1462 aa49.75■■■■■ 5.55
LRRC75B-201ENST00000318753 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.72■■■■■ 5.55
LRRC75B-201ENST00000318753 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.52■■■■■ 5.52
LRRC75B-201ENST00000318753 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.5■■■■■ 5.52
LRRC75B-201ENST00000318753 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.46■■■■■ 5.51
LRRC75B-201ENST00000318753 CUX1P39880 1505 aa49.39■■■■■ 5.5
LRRC75B-201ENST00000318753 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.35■■■■■ 5.49
LRRC75B-201ENST00000318753 OSCARQ8IYS5 282 aa49.33■■■■■ 5.49
LRRC75B-201ENST00000318753 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.31■■■■■ 5.481e-6■■■□□ 18.8
LRRC75B-201ENST00000318753 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.29■■■■■ 5.48
LRRC75B-201ENST00000318753 SOGA1O94964 1423 aa49.23■■■■■ 5.47
LRRC75B-201ENST00000318753 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.1■■■■■ 5.45
LRRC75B-201ENST00000318753 CHD1O14646 1710 aa49■■■■■ 5.43
LRRC75B-201ENST00000318753 WDR97A6NE52 1622 aa48.98■■■■■ 5.43
LRRC75B-201ENST00000318753 TRIM41Q8WV44 630 aa48.94■■■■■ 5.43
LRRC75B-201ENST00000318753 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.82■■■■■ 5.41
LRRC75B-201ENST00000318753 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.77■■■■■ 5.4
LRRC75B-201ENST00000318753 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.77■■■■■ 5.4
LRRC75B-201ENST00000318753 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.77■■■■■ 5.4
LRRC75B-201ENST00000318753 FBLN2P98095 1184 aa48.76■■■■■ 5.4
LRRC75B-201ENST00000318753 SYNJ1O43426 1573 aa48.76■■■■■ 5.4
LRRC75B-201ENST00000318753 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.76■■■■■ 5.4
LRRC75B-201ENST00000318753 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.73■■■■■ 5.39
LRRC75B-201ENST00000318753 TOP2BQ02880 1626 aa48.72■■■■■ 5.39
LRRC75B-201ENST00000318753 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.72■■■■■ 5.39
LRRC75B-201ENST00000318753 GRIN2BQ13224 1484 aa48.72■■■■■ 5.39
LRRC75B-201ENST00000318753 PBRM1Q86U86 1689 aa48.69■■■■■ 5.38
LRRC75B-201ENST00000318753 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.67■■■■■ 5.38
LRRC75B-201ENST00000318753 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.66■■■■■ 5.38
LRRC75B-201ENST00000318753 ARHGEF11O15085 1522 aa48.65■■■■■ 5.38
LRRC75B-201ENST00000318753 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.65■■■■■ 5.38
LRRC75B-201ENST00000318753 SYNJ2O15056 1496 aa48.49■■■■■ 5.35
LRRC75B-201ENST00000318753 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.48■■■■■ 5.35
LRRC75B-201ENST00000318753 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.42■■■■■ 5.34
LRRC75B-201ENST00000318753 ARAP1Q96P48 1450 aa48.24■■■■■ 5.31
LRRC75B-201ENST00000318753 ADAMTS12P58397 1594 aa48.24■■■■■ 5.31
LRRC75B-201ENST00000318753 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.19■■■■■ 5.3
LRRC75B-201ENST00000318753 GRIN2AQ12879 1464 aa48.14■■■■■ 5.3
LRRC75B-201ENST00000318753 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.12■■■■■ 5.29
LRRC75B-201ENST00000318753 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.04■■■■■ 5.28
LRRC75B-201ENST00000318753 CEP170Q5SW79 1584 aa48■■■■■ 5.27
LRRC75B-201ENST00000318753 NUP160Q12769 1436 aa47.96■■■■■ 5.27
LRRC75B-201ENST00000318753 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.8■■■■■ 5.24
LRRC75B-201ENST00000318753 KIF27Q86VH2 1401 aa47.71■■■■■ 5.23
LRRC75B-201ENST00000318753 SHROOM2Q13796 1616 aa47.7■■■■■ 5.23
LRRC75B-201ENST00000318753 IGF1RP08069 1367 aa47.68■■■■■ 5.22
LRRC75B-201ENST00000318753 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.56■■■■■ 5.2
LRRC75B-201ENST00000318753 CUL7Q14999 1698 aa47.54■■■■■ 5.2
LRRC75B-201ENST00000318753 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms