RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604200.1

CAHM-201, Transcript of colon adenocarcinoma hypermethylated, humanhuman

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Gene CAHM, Length 896 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAHM-201ENST00000604200 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.34■■■■■ 8.37
CAHM-201ENST00000604200 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.89■■■■■ 7.18
CAHM-201ENST00000604200 ABCC9O60706 1549 aa59.25■■■■■ 7.08
CAHM-201ENST00000604200 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.65■■■■■ 6.66
CAHM-201ENST00000604200 NACADO15069 1562 aa56.5■■■■■ 6.64
CAHM-201ENST00000604200 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.49■■■■■ 6.63
CAHM-201ENST00000604200 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.05■■■■■ 6.56
CAHM-201ENST00000604200 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.98■■■■■ 6.55
CAHM-201ENST00000604200 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.64■■■■■ 6.5
CAHM-201ENST00000604200 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.39■■■■■ 6.46
CAHM-201ENST00000604200 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.33■■■■■ 6.45
CAHM-201ENST00000604200 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.1■■■■■ 6.41
CAHM-201ENST00000604200 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.03■■■■■ 6.4
CAHM-201ENST00000604200 SCRIBQ14160 1630 aa54.7■■■■■ 6.35
CAHM-201ENST00000604200 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.32■■■■■ 6.29
CAHM-201ENST00000604200 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.61■■■■■ 6.17
CAHM-201ENST00000604200 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.51■■■■■ 6.16
CAHM-201ENST00000604200 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.26■■■■■ 6.12
CAHM-201ENST00000604200 SMARCA4P51532 1647 aa52.28■■■■■ 5.96
CAHM-201ENST00000604200 NCAPD3P42695 1498 aa52.26■■■■■ 5.96
CAHM-201ENST00000604200 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.21■■■■■ 5.95
CAHM-201ENST00000604200 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.13■■■■■ 5.94
CAHM-201ENST00000604200 SMARCA2P51531 1590 aa52■■■■■ 5.92
CAHM-201ENST00000604200 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.93■■■■■ 5.9
CAHM-201ENST00000604200 HMGXB3Q12766 1538 aa51.84■■■■■ 5.89
CAHM-201ENST00000604200 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.8■■■■■ 5.88
CAHM-201ENST00000604200 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.67■■■■■ 5.86
CAHM-201ENST00000604200 WIZO95785 1651 aa51.27■■■■■ 5.8
CAHM-201ENST00000604200 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.2■■■■■ 5.79
CAHM-201ENST00000604200 NESP48681 1621 aa51.17■■■■■ 5.78
CAHM-201ENST00000604200 ERCC6Q03468 1493 aa51■■■■■ 5.75
CAHM-201ENST00000604200 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.82■■■■■ 5.73
CAHM-201ENST00000604200 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.71■■■■■ 5.71
CAHM-201ENST00000604200 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.67■■■■■ 5.7
CAHM-201ENST00000604200 CUX2O14529 1486 aa50.65■■■■■ 5.7
CAHM-201ENST00000604200 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.55■■■■■ 5.68
CAHM-201ENST00000604200 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.38■■■■■ 5.66
CAHM-201ENST00000604200 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.38■■■■■ 5.66
CAHM-201ENST00000604200 CFTRP13569 1480 aa50.3■■■■■ 5.64
CAHM-201ENST00000604200 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.19■■■■■ 5.62
CAHM-201ENST00000604200 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.08■■■■■ 5.61
CAHM-201ENST00000604200 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.07■■■■■ 5.61
CAHM-201ENST00000604200 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.01■■■■■ 5.6
CAHM-201ENST00000604200 WDR62O43379 1518 aa49.9■■■■■ 5.58
CAHM-201ENST00000604200 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.81■■■■■ 5.56
CAHM-201ENST00000604200 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.66■■■■■ 5.54
CAHM-201ENST00000604200 PRDM2Q13029 1718 aa49.6■■■■■ 5.53
CAHM-201ENST00000604200 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.54■■■■■ 5.52
CAHM-201ENST00000604200 TOPBP1Q92547 1522 aa49.24■■■■■ 5.47
CAHM-201ENST00000604200 ABCC8Q09428 1581 aa49.12■■■■■ 5.45
CAHM-201ENST00000604200 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.07■■■■■ 5.45
CAHM-201ENST00000604200 IFT140Q96RY7 1462 aa49.01■■■■■ 5.44
CAHM-201ENST00000604200 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.93■■■■■ 5.42
CAHM-201ENST00000604200 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.8■■■■■ 5.4
CAHM-201ENST00000604200 CUX1P39880 1505 aa48.73■■■■■ 5.39
CAHM-201ENST00000604200 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.72■■■■■ 5.39
CAHM-201ENST00000604200 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.65■■■■■ 5.38
CAHM-201ENST00000604200 SOGA1O94964 1423 aa48.61■■■■■ 5.37
CAHM-201ENST00000604200 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.61■■■■■ 5.37
CAHM-201ENST00000604200 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.6■■■■■ 5.37
CAHM-201ENST00000604200 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.57■■■■■ 5.37
CAHM-201ENST00000604200 OSCARQ8IYS5 282 aa48.56■■■■■ 5.36
CAHM-201ENST00000604200 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.45■■■■■ 5.35
CAHM-201ENST00000604200 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.2■■■■■ 5.31
CAHM-201ENST00000604200 WDR97A6NE52 1622 aa48.18■■■■■ 5.3
CAHM-201ENST00000604200 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.11■■■■■ 5.29
CAHM-201ENST00000604200 SYNJ1O43426 1573 aa48.1■■■■■ 5.29
CAHM-201ENST00000604200 TOP2BQ02880 1626 aa48.1■■■■■ 5.29
CAHM-201ENST00000604200 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.07■■■■■ 5.29
CAHM-201ENST00000604200 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.06■■■■■ 5.28
CAHM-201ENST00000604200 GRIN2BQ13224 1484 aa48.05■■■■■ 5.28
CAHM-201ENST00000604200 FBLN2P98095 1184 aa48.05■■■■■ 5.28
CAHM-201ENST00000604200 GAPVD1Q14C86 1478 aa48■■■■■ 5.27
CAHM-201ENST00000604200 CHD1O14646 1710 aa48■■■■■ 5.27
CAHM-201ENST00000604200 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.93■■■■■ 5.26
CAHM-201ENST00000604200 TRIM41Q8WV44 630 aa47.91■■■■■ 5.26
CAHM-201ENST00000604200 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.9■■■■■ 5.26
CAHM-201ENST00000604200 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.85■■■■■ 5.25
CAHM-201ENST00000604200 SYNJ2O15056 1496 aa47.78■■■■■ 5.24
CAHM-201ENST00000604200 PBRM1Q86U86 1689 aa47.78■■■■■ 5.24
CAHM-201ENST00000604200 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.75■■■■■ 5.23
CAHM-201ENST00000604200 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.75■■■■■ 5.23
CAHM-201ENST00000604200 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.75■■■■■ 5.23
CAHM-201ENST00000604200 ARHGEF11O15085 1522 aa47.73■■■■■ 5.23
CAHM-201ENST00000604200 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.58■■■■■ 5.21
CAHM-201ENST00000604200 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.47■■■■■ 5.19
CAHM-201ENST00000604200 ADAMTS12P58397 1594 aa47.47■■■■■ 5.19
CAHM-201ENST00000604200 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.43■■■■■ 5.18
CAHM-201ENST00000604200 GRIN2AQ12879 1464 aa47.43■■■■■ 5.18
CAHM-201ENST00000604200 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.39■■■■■ 5.18
CAHM-201ENST00000604200 ARAP1Q96P48 1450 aa47.36■■■■■ 5.17
CAHM-201ENST00000604200 NUP160Q12769 1436 aa47.29■■■■■ 5.16
CAHM-201ENST00000604200 CEP170Q5SW79 1584 aa47.22■■■■■ 5.15
CAHM-201ENST00000604200 IGF1RP08069 1367 aa47.21■■■■■ 5.15
CAHM-201ENST00000604200 KIF27Q86VH2 1401 aa47.21■■■■■ 5.15
CAHM-201ENST00000604200 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.97■■■■■ 5.11
CAHM-201ENST00000604200 SHROOM2Q13796 1616 aa46.9■■■■■ 5.1
CAHM-201ENST00000604200 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.86■■■■■ 5.09
CAHM-201ENST00000604200 CUL7Q14999 1698 aa46.85■■■■■ 5.09
CAHM-201ENST00000604200 JPH4Q96JJ6 628 aa46.85■■■■■ 5.09
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