RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595358.5

CCDC61-204, Transcript of coiled-coil domain containing 61, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC61, Length 1,817 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61-204ENST00000595358 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.36■■■■■ 6.77
CCDC61-204ENST00000595358 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.02■■■■■ 5.6
CCDC61-204ENST00000595358 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.19■■■■■ 5.31
CCDC61-204ENST00000595358 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.46■■■■■ 5.19
CCDC61-204ENST00000595358 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.28■■■■■ 5.16
CCDC61-204ENST00000595358 ABCC9O60706 1549 aa47.22■■■■■ 5.15
CCDC61-204ENST00000595358 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.89■■■■■ 5.1
CCDC61-204ENST00000595358 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.73■■■■■ 5.07
CCDC61-204ENST00000595358 NACADO15069 1562 aa46.58■■■■■ 5.05
CCDC61-204ENST00000595358 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.16■■■■■ 4.98
CCDC61-204ENST00000595358 SCRIBQ14160 1630 aa45.96■■■■■ 4.95
CCDC61-204ENST00000595358 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.29■■■■■ 4.84
CCDC61-204ENST00000595358 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
CCDC61-204ENST00000595358 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.79■■■■■ 4.76
CCDC61-204ENST00000595358 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.56■■■■■ 4.72
CCDC61-204ENST00000595358 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.54■■■■■ 4.72
CCDC61-204ENST00000595358 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
CCDC61-204ENST00000595358 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.31■■■■■ 4.68
CCDC61-204ENST00000595358 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.28■■■■■ 4.68
CCDC61-204ENST00000595358 SMARCA4P51532 1647 aa44.09■■■■■ 4.65
CCDC61-204ENST00000595358 WIZO95785 1651 aa43.96■■■■■ 4.63
CCDC61-204ENST00000595358 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.58■■■■■ 4.57
CCDC61-204ENST00000595358 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
CCDC61-204ENST00000595358 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
CCDC61-204ENST00000595358 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.35■■■■■ 4.53
CCDC61-204ENST00000595358 SMARCA2P51531 1590 aa43.33■■■■■ 4.53
CCDC61-204ENST00000595358 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.11■■■■■ 4.49
CCDC61-204ENST00000595358 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
CCDC61-204ENST00000595358 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.05■■■■■ 4.48
CCDC61-204ENST00000595358 NCAPD3P42695 1498 aa42.99■■■■■ 4.47
CCDC61-204ENST00000595358 HMGXB3Q12766 1538 aa42.93■■■■■ 4.46
CCDC61-204ENST00000595358 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.78■■■■■ 4.44
CCDC61-204ENST00000595358 TRIM41Q8WV44 630 aa42.31■■■■■ 4.36
CCDC61-204ENST00000595358 ABCC8Q09428 1581 aa42.13■■■■■ 4.34
CCDC61-204ENST00000595358 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.05■■■■■ 4.32
CCDC61-204ENST00000595358 CFTRP13569 1480 aa42.04■■■■■ 4.32
CCDC61-204ENST00000595358 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.88■■■■■ 4.3
CCDC61-204ENST00000595358 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.87■■■■■ 4.29
CCDC61-204ENST00000595358 PRDM2Q13029 1718 aa41.87■■■■■ 4.29
CCDC61-204ENST00000595358 SYNJ1O43426 1573 aa41.71■■■■■ 4.27
CCDC61-204ENST00000595358 TOP2BQ02880 1626 aa41.56■■■■■ 4.24
CCDC61-204ENST00000595358 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.52■■■■■ 4.24
CCDC61-204ENST00000595358 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.52■■■■■ 4.24
CCDC61-204ENST00000595358 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
CCDC61-204ENST00000595358 NESP48681 1621 aa41.49■■■■■ 4.23
CCDC61-204ENST00000595358 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.44■■■■■ 4.22
CCDC61-204ENST00000595358 CUX1P39880 1505 aa41.43■■■■■ 4.22
CCDC61-204ENST00000595358 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.41■■■■■ 4.22
CCDC61-204ENST00000595358 SOGA1O94964 1423 aa41.35■■■■■ 4.21
CCDC61-204ENST00000595358 EEA1Q15075 1411 aa41.3■■■■■ 4.2
CCDC61-204ENST00000595358 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.2■■■■■ 4.19
CCDC61-204ENST00000595358 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.18■■■■■ 4.18
CCDC61-204ENST00000595358 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.14■■■■■ 4.18
CCDC61-204ENST00000595358 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.06■■■■■ 4.16
CCDC61-204ENST00000595358 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.05■■■■■ 4.16
CCDC61-204ENST00000595358 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.02■■■■■ 4.16
CCDC61-204ENST00000595358 TOPBP1Q92547 1522 aa40.97■■■■■ 4.15
CCDC61-204ENST00000595358 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.96■■■■■ 4.15
CCDC61-204ENST00000595358 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
CCDC61-204ENST00000595358 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.88■■■■■ 4.14
CCDC61-204ENST00000595358 KIF27Q86VH2 1401 aa40.81■■■■■ 4.12
CCDC61-204ENST00000595358 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
CCDC61-204ENST00000595358 KIF21BO75037 1637 aa40.77■■■■■ 4.12
CCDC61-204ENST00000595358 GOLGA3Q08378 1498 aa40.71■■■■■ 4.11
CCDC61-204ENST00000595358 CUX2O14529 1486 aa40.69■■■■■ 4.1
CCDC61-204ENST00000595358 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.65■■■■■ 4.1
CCDC61-204ENST00000595358 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.62■■■■■ 4.09
CCDC61-204ENST00000595358 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.62■■■■■ 4.09
CCDC61-204ENST00000595358 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.6■■■■■ 4.09
CCDC61-204ENST00000595358 PRXQ9BXM0 1461 aa40.56■■■■■ 4.08
CCDC61-204ENST00000595358 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.52■■■■■ 4.08
CCDC61-204ENST00000595358 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.07
CCDC61-204ENST00000595358 WDR97A6NE52 1622 aa40.5■■■■■ 4.07
CCDC61-204ENST00000595358 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.5■■■■■ 4.07
CCDC61-204ENST00000595358 ERCC6Q03468 1493 aa40.49■■■■■ 4.07
CCDC61-204ENST00000595358 IGF1RP08069 1367 aa40.46■■■■■ 4.07
CCDC61-204ENST00000595358 WDR62O43379 1518 aa40.45■■■■■ 4.07
CCDC61-204ENST00000595358 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
CCDC61-204ENST00000595358 CEP162Q5TB80 1403 aa40.37■■■■■ 4.05
CCDC61-204ENST00000595358 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
CCDC61-204ENST00000595358 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.29■■■■■ 4.04
CCDC61-204ENST00000595358 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.25■■■■■ 4.03
CCDC61-204ENST00000595358 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
CCDC61-204ENST00000595358 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.19■■■■■ 4.02
CCDC61-204ENST00000595358 IFT140Q96RY7 1462 aa40.17■■■■■ 4.02
CCDC61-204ENST00000595358 CUL7Q14999 1698 aa40.16■■■■■ 4.02
CCDC61-204ENST00000595358 CLIP1P30622 1438 aa40.05■■■■■ 4
CCDC61-204ENST00000595358 PBRM1Q86U86 1689 aa39.99■■■■□ 3.99
CCDC61-204ENST00000595358 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.991e-6■■■■■ 30.5
CCDC61-204ENST00000595358 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
CCDC61-204ENST00000595358 GRIN2BQ13224 1484 aa39.87■■■■□ 3.97
CCDC61-204ENST00000595358 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
CCDC61-204ENST00000595358 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
CCDC61-204ENST00000595358 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.76■■■■□ 3.96
CCDC61-204ENST00000595358 ADAMTS12P58397 1594 aa39.75■■■■□ 3.95
CCDC61-204ENST00000595358 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.72■■■■□ 3.95
CCDC61-204ENST00000595358 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.72■■■■□ 3.95
CCDC61-204ENST00000595358 ARAP1Q96P48 1450 aa39.68■■■■□ 3.94
CCDC61-204ENST00000595358 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.67■■■■□ 3.94
CCDC61-204ENST00000595358 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.6■■■■□ 3.93
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