RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592991.1

LDLRAD4-218, Transcript of low density lipoprotein receptor class A domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LDLRAD4, Length 1,640 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD4-218ENST00000592991 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.39■■■■■ 7.1
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LDLRAD4-218ENST00000592991 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.34■■■■■ 5.33
LDLRAD4-218ENST00000592991 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.14■■■■■ 5.3
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LDLRAD4-218ENST00000592991 SMARCA2P51531 1590 aa45.1■■■■■ 4.81
LDLRAD4-218ENST00000592991 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.07■■■■■ 4.81
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LDLRAD4-218ENST00000592991 NESP48681 1621 aa43.59■■■■■ 4.57
LDLRAD4-218ENST00000592991 PRDM2Q13029 1718 aa43.52■■■■■ 4.56
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LDLRAD4-218ENST00000592991 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.22■■■■■ 4.51
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LDLRAD4-218ENST00000592991 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.08■■■■■ 4.49
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LDLRAD4-218ENST00000592991 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.88■■■■■ 4.46
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LDLRAD4-218ENST00000592991 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.32■■■■■ 4.21
LDLRAD4-218ENST00000592991 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
LDLRAD4-218ENST00000592991 CEP162Q5TB80 1403 aa41.13■■■■■ 4.18
LDLRAD4-218ENST00000592991 SYNJ2O15056 1496 aa41.12■■■■■ 4.17
LDLRAD4-218ENST00000592991 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
LDLRAD4-218ENST00000592991 GRIN2AQ12879 1464 aa41.07■■■■■ 4.17
LDLRAD4-218ENST00000592991 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.06■■■■■ 4.16
LDLRAD4-218ENST00000592991 FBLN2P98095 1184 aa41.05■■■■■ 4.16
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