RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376572.7

KIAA2013-201, Transcript of KIAA2013, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KIAA2013, Length 2,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA2013-201ENST00000376572 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.07■■■■■ 5.77
KIAA2013-201ENST00000376572 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.05■■■■■ 4.64
KIAA2013-201ENST00000376572 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.17■■■■■ 4.5
KIAA2013-201ENST00000376572 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
KIAA2013-201ENST00000376572 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
KIAA2013-201ENST00000376572 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.09■■■■■ 4.49
KIAA2013-201ENST00000376572 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.59■■■■■ 4.25
KIAA2013-201ENST00000376572 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.58■■■■■ 4.25
KIAA2013-201ENST00000376572 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.42■■■■■ 4.22
KIAA2013-201ENST00000376572 SCRIBQ14160 1630 aa40.93■■■■■ 4.14
KIAA2013-201ENST00000376572 ABCC9O60706 1549 aa40.77■■■■■ 4.12
KIAA2013-201ENST00000376572 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.61■■■■■ 4.09
KIAA2013-201ENST00000376572 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
KIAA2013-201ENST00000376572 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.32■■■■■ 4.04
KIAA2013-201ENST00000376572 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.12■■■■■ 4.01
KIAA2013-201ENST00000376572 NACADO15069 1562 aa40.07■■■■■ 4.01
KIAA2013-201ENST00000376572 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.07■■■■■ 4
KIAA2013-201ENST00000376572 HRCP23327 699 aa39.94■■■■□ 3.98
KIAA2013-201ENST00000376572 TRIM41Q8WV44 630 aa39.94■■■■□ 3.98
KIAA2013-201ENST00000376572 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
KIAA2013-201ENST00000376572 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.86■■■■□ 3.97
KIAA2013-201ENST00000376572 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.85■■■■□ 3.97
KIAA2013-201ENST00000376572 WIZO95785 1651 aa39.63■■■■□ 3.93
KIAA2013-201ENST00000376572 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
KIAA2013-201ENST00000376572 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
KIAA2013-201ENST00000376572 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.18■■■■□ 3.86
KIAA2013-201ENST00000376572 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
KIAA2013-201ENST00000376572 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39■■■■□ 3.83
KIAA2013-201ENST00000376572 SMARCA4P51532 1647 aa38.9■■■■□ 3.82
KIAA2013-201ENST00000376572 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.83■■■■□ 3.81
KIAA2013-201ENST00000376572 ABCC8Q09428 1581 aa38.81■■■■□ 3.8
KIAA2013-201ENST00000376572 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
KIAA2013-201ENST00000376572 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
KIAA2013-201ENST00000376572 SMARCA2P51531 1590 aa38.66■■■■□ 3.78
KIAA2013-201ENST00000376572 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.59■■■■□ 3.77
KIAA2013-201ENST00000376572 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.45■■■■□ 3.75
KIAA2013-201ENST00000376572 SOGA1O94964 1423 aa38.45■■■■□ 3.75
KIAA2013-201ENST00000376572 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.32■■■■□ 3.72
KIAA2013-201ENST00000376572 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
KIAA2013-201ENST00000376572 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.13■■■■□ 3.69
KIAA2013-201ENST00000376572 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
KIAA2013-201ENST00000376572 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
KIAA2013-201ENST00000376572 CEP162Q5TB80 1403 aa38.06■■■■□ 3.68
KIAA2013-201ENST00000376572 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.03■■■■□ 3.68
KIAA2013-201ENST00000376572 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.02■■■■□ 3.685e-6■■■■■ 29.2
KIAA2013-201ENST00000376572 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.96■■■■□ 3.67
KIAA2013-201ENST00000376572 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
KIAA2013-201ENST00000376572 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.89■■■■□ 3.66
KIAA2013-201ENST00000376572 SYNJ1O43426 1573 aa37.85■■■■□ 3.65
KIAA2013-201ENST00000376572 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
KIAA2013-201ENST00000376572 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
KIAA2013-201ENST00000376572 EEA1Q15075 1411 aa37.76■■■■□ 3.64
KIAA2013-201ENST00000376572 GOLGA3Q08378 1498 aa37.69■■■■□ 3.62
KIAA2013-201ENST00000376572 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.46■■■■□ 3.59
KIAA2013-201ENST00000376572 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.44■■■■□ 3.58
KIAA2013-201ENST00000376572 CLIP1P30622 1438 aa37.39■■■■□ 3.58
KIAA2013-201ENST00000376572 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
KIAA2013-201ENST00000376572 KIF21BO75037 1637 aa37.3■■■■□ 3.56
KIAA2013-201ENST00000376572 TOP2BQ02880 1626 aa37.22■■■■□ 3.55
KIAA2013-201ENST00000376572 NCAPD3P42695 1498 aa37.21■■■■□ 3.55
KIAA2013-201ENST00000376572 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.1■■■■□ 3.53
KIAA2013-201ENST00000376572 APLP2Q06481 763 aa37.1■■■■□ 3.53
KIAA2013-201ENST00000376572 CUX1P39880 1505 aa37.07■■■■□ 3.52
KIAA2013-201ENST00000376572 HMGXB3Q12766 1538 aa37.06■■■■□ 3.52
KIAA2013-201ENST00000376572 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.01■■■■□ 3.51
KIAA2013-201ENST00000376572 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
KIAA2013-201ENST00000376572 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
KIAA2013-201ENST00000376572 CFTRP13569 1480 aa36.92■■■■□ 3.5
KIAA2013-201ENST00000376572 PRXQ9BXM0 1461 aa36.9■■■■□ 3.5
KIAA2013-201ENST00000376572 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
KIAA2013-201ENST00000376572 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
KIAA2013-201ENST00000376572 KIF27Q86VH2 1401 aa36.81■■■■□ 3.48
KIAA2013-201ENST00000376572 ARAP1Q96P48 1450 aa36.77■■■■□ 3.48
KIAA2013-201ENST00000376572 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.71■■■■□ 3.47
KIAA2013-201ENST00000376572 CUX2O14529 1486 aa36.62■■■■□ 3.45
KIAA2013-201ENST00000376572 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.62■■■■□ 3.45
KIAA2013-201ENST00000376572 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
KIAA2013-201ENST00000376572 NEUROD1Q13562 356 aa36.57■■■■□ 3.44
KIAA2013-201ENST00000376572 IGF1RP08069 1367 aa36.54■■■■□ 3.44
KIAA2013-201ENST00000376572 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.49■■■■□ 3.43
KIAA2013-201ENST00000376572 ITGAEP38570 1179 aa36.49■■■■□ 3.43
KIAA2013-201ENST00000376572 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.48■■■■□ 3.43
KIAA2013-201ENST00000376572 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.46■■■■□ 3.43
KIAA2013-201ENST00000376572 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
KIAA2013-201ENST00000376572 P3H3Q8IVL6 736 aa36.41■■■■□ 3.42
KIAA2013-201ENST00000376572 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.38■■■■□ 3.41
KIAA2013-201ENST00000376572 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.41
KIAA2013-201ENST00000376572 NESP48681 1621 aa36.3■■■■□ 3.4
KIAA2013-201ENST00000376572 PRDM2Q13029 1718 aa36.29■■■■□ 3.4
KIAA2013-201ENST00000376572 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.29■■■■□ 3.4
KIAA2013-201ENST00000376572 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
KIAA2013-201ENST00000376572 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.27■■■■□ 3.4
KIAA2013-201ENST00000376572 MIER1Q8N108 512 aa36.26■■■■□ 3.4
KIAA2013-201ENST00000376572 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
KIAA2013-201ENST00000376572 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.2■■■■□ 3.39
KIAA2013-201ENST00000376572 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.16■■■■□ 3.38
KIAA2013-201ENST00000376572 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
KIAA2013-201ENST00000376572 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa36.14■■■■□ 3.38
KIAA2013-201ENST00000376572 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
KIAA2013-201ENST00000376572 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms