RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343938.8

CPTP-201, Transcript of ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CPTP, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTP-201ENST00000343938 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.51■■■■■ 6.64
CPTP-201ENST00000343938 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.38■■■■■ 5.49
CPTP-201ENST00000343938 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
CPTP-201ENST00000343938 ABCC9O60706 1549 aa47.28■■■■■ 5.16
CPTP-201ENST00000343938 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.03■■■■■ 5.12
CPTP-201ENST00000343938 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.54■■■■■ 5.04
CPTP-201ENST00000343938 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.17■■■■■ 4.98
CPTP-201ENST00000343938 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.07■■■■■ 4.97
CPTP-201ENST00000343938 NACADO15069 1562 aa46.04■■■■■ 4.96
CPTP-201ENST00000343938 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.79■■■■■ 4.92
CPTP-201ENST00000343938 SCRIBQ14160 1630 aa45.62■■■■■ 4.89
CPTP-201ENST00000343938 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.13■■■■■ 4.81
CPTP-201ENST00000343938 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.56■■■■■ 4.72
CPTP-201ENST00000343938 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.56■■■■■ 4.72
CPTP-201ENST00000343938 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
CPTP-201ENST00000343938 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.11■■■■■ 4.65
CPTP-201ENST00000343938 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.77■■■■■ 4.6
CPTP-201ENST00000343938 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
CPTP-201ENST00000343938 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
CPTP-201ENST00000343938 SMARCA4P51532 1647 aa43.58■■■■■ 4.57
CPTP-201ENST00000343938 WIZO95785 1651 aa43.46■■■■■ 4.55
CPTP-201ENST00000343938 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
CPTP-201ENST00000343938 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.93■■■■■ 4.46
CPTP-201ENST00000343938 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.91■■■■■ 4.46
CPTP-201ENST00000343938 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
CPTP-201ENST00000343938 SMARCA2P51531 1590 aa42.79■■■■■ 4.44
CPTP-201ENST00000343938 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.72■■■■■ 4.43
CPTP-201ENST00000343938 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
CPTP-201ENST00000343938 NCAPD3P42695 1498 aa42.51■■■■■ 4.4
CPTP-201ENST00000343938 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.49■■■■■ 4.39
CPTP-201ENST00000343938 HMGXB3Q12766 1538 aa42.43■■■■■ 4.38
CPTP-201ENST00000343938 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.43■■■■■ 4.38
CPTP-201ENST00000343938 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.1■■■■■ 4.33
CPTP-201ENST00000343938 ABCC8Q09428 1581 aa41.59■■■■■ 4.25
CPTP-201ENST00000343938 CFTRP13569 1480 aa41.52■■■■■ 4.24
CPTP-201ENST00000343938 NESP48681 1621 aa41.44■■■■■ 4.22
CPTP-201ENST00000343938 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.44■■■■■ 4.22
CPTP-201ENST00000343938 TRIM41Q8WV44 630 aa41.37■■■■■ 4.21
CPTP-201ENST00000343938 PRDM2Q13029 1718 aa41.36■■■■■ 4.21
CPTP-201ENST00000343938 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.16■■■■■ 4.18
CPTP-201ENST00000343938 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.15■■■■■ 4.18
CPTP-201ENST00000343938 SYNJ1O43426 1573 aa41.13■■■■■ 4.18
CPTP-201ENST00000343938 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.05■■■■■ 4.16
CPTP-201ENST00000343938 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.95■■■■■ 4.15
CPTP-201ENST00000343938 CUX1P39880 1505 aa40.93■■■■■ 4.14
CPTP-201ENST00000343938 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.93■■■■■ 4.14
CPTP-201ENST00000343938 TOP2BQ02880 1626 aa40.87■■■■■ 4.13
CPTP-201ENST00000343938 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
CPTP-201ENST00000343938 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.83■■■■■ 4.13
CPTP-201ENST00000343938 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.82■■■■■ 4.12
CPTP-201ENST00000343938 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.81■■■■■ 4.12
CPTP-201ENST00000343938 SOGA1O94964 1423 aa40.66■■■■■ 4.1
CPTP-201ENST00000343938 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
CPTP-201ENST00000343938 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.6■■■■■ 4.09
CPTP-201ENST00000343938 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.58■■■■■ 4.09
CPTP-201ENST00000343938 TOPBP1Q92547 1522 aa40.58■■■■■ 4.09
CPTP-201ENST00000343938 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.52■■■■■ 4.08
CPTP-201ENST00000343938 ERCC6Q03468 1493 aa40.48■■■■■ 4.07
CPTP-201ENST00000343938 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.46■■■■■ 4.07
CPTP-201ENST00000343938 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
CPTP-201ENST00000343938 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.38■■■■■ 4.05
CPTP-201ENST00000343938 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.32■■■■■ 4.05
CPTP-201ENST00000343938 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
CPTP-201ENST00000343938 WDR62O43379 1518 aa40.19■■■■■ 4.02
CPTP-201ENST00000343938 CUX2O14529 1486 aa40.18■■■■■ 4.02
CPTP-201ENST00000343938 EEA1Q15075 1411 aa40.17■■■■■ 4.02
CPTP-201ENST00000343938 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.16■■■■■ 4.02
CPTP-201ENST00000343938 KIF27Q86VH2 1401 aa40.09■■■■■ 4.01
CPTP-201ENST00000343938 WDR97A6NE52 1622 aa40.07■■■■■ 4
CPTP-201ENST00000343938 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.05■■■■■ 4
CPTP-201ENST00000343938 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
CPTP-201ENST00000343938 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
CPTP-201ENST00000343938 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.88■■■■□ 3.97
CPTP-201ENST00000343938 KIF21BO75037 1637 aa39.84■■■■□ 3.97
CPTP-201ENST00000343938 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.83■■■■□ 3.97
CPTP-201ENST00000343938 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.83■■■■□ 3.97
CPTP-201ENST00000343938 IGF1RP08069 1367 aa39.82■■■■□ 3.97
CPTP-201ENST00000343938 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
CPTP-201ENST00000343938 IFT140Q96RY7 1462 aa39.78■■■■□ 3.96
CPTP-201ENST00000343938 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.76■■■■□ 3.96
CPTP-201ENST00000343938 GOLGA3Q08378 1498 aa39.76■■■■□ 3.96
CPTP-201ENST00000343938 PRXQ9BXM0 1461 aa39.76■■■■□ 3.96
CPTP-201ENST00000343938 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.75■■■■□ 3.95
CPTP-201ENST00000343938 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
CPTP-201ENST00000343938 PBRM1Q86U86 1689 aa39.65■■■■□ 3.94
CPTP-201ENST00000343938 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
CPTP-201ENST00000343938 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
CPTP-201ENST00000343938 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.61■■■■□ 3.93
CPTP-201ENST00000343938 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.59■■■■□ 3.93
CPTP-201ENST00000343938 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.59■■■■□ 3.93
CPTP-201ENST00000343938 CUL7Q14999 1698 aa39.51■■■■□ 3.92
CPTP-201ENST00000343938 CEP162Q5TB80 1403 aa39.47■■■■□ 3.91
CPTP-201ENST00000343938 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
CPTP-201ENST00000343938 GRIN2BQ13224 1484 aa39.43■■■■□ 3.9
CPTP-201ENST00000343938 ADAMTS12P58397 1594 aa39.34■■■■□ 3.89
CPTP-201ENST00000343938 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.34■■■■□ 3.89
CPTP-201ENST00000343938 HRCP23327 699 aa39.31■■■■□ 3.88
CPTP-201ENST00000343938 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.23■■■■□ 3.87
CPTP-201ENST00000343938 CLIP1P30622 1438 aa39.17■■■■□ 3.86
CPTP-201ENST00000343938 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.14■■■■□ 3.86
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