RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.87■■■■■ 8.14
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TPGS1-201ENST00000359315 ABCC9O60706 1549 aa57.5■■■■■ 6.79
TPGS1-201ENST00000359315 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.1■■■■■ 6.41
TPGS1-201ENST00000359315 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.1■■■■■ 6.41
TPGS1-201ENST00000359315 NACADO15069 1562 aa55.02■■■■■ 6.4
TPGS1-201ENST00000359315 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.88■■■■■ 6.38
TPGS1-201ENST00000359315 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.65■■■■■ 6.34
TPGS1-201ENST00000359315 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.41■■■■■ 6.3
TPGS1-201ENST00000359315 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.85■■■■■ 6.21
TPGS1-201ENST00000359315 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.76■■■■■ 6.2
TPGS1-201ENST00000359315 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.57■■■■■ 6.17
TPGS1-201ENST00000359315 SCRIBQ14160 1630 aa53.5■■■■■ 6.16
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.94■■■■■ 6.07
TPGS1-201ENST00000359315 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.83■■■■■ 6.05
TPGS1-201ENST00000359315 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.13■■■■■ 5.93
TPGS1-201ENST00000359315 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.93■■■■■ 5.9
TPGS1-201ENST00000359315 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.62■■■■■ 5.85
TPGS1-201ENST00000359315 SMARCA4P51532 1647 aa51.11■■■■■ 5.77
TPGS1-201ENST00000359315 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.01■■■■■ 5.76
TPGS1-201ENST00000359315 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.9■■■■■ 5.74
TPGS1-201ENST00000359315 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.84■■■■■ 5.73
TPGS1-201ENST00000359315 NCAPD3P42695 1498 aa50.84■■■■■ 5.73
TPGS1-201ENST00000359315 SMARCA2P51531 1590 aa50.72■■■■■ 5.71
TPGS1-201ENST00000359315 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.58■■■■■ 5.69
TPGS1-201ENST00000359315 HMGXB3Q12766 1538 aa50.55■■■■■ 5.68
TPGS1-201ENST00000359315 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.44■■■■■ 5.66
TPGS1-201ENST00000359315 WIZO95785 1651 aa50.23■■■■■ 5.63
TPGS1-201ENST00000359315 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.21■■■■■ 5.63
TPGS1-201ENST00000359315 NESP48681 1621 aa49.76■■■■■ 5.56
TPGS1-201ENST00000359315 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.68■■■■■ 5.54
TPGS1-201ENST00000359315 ERCC6Q03468 1493 aa49.47■■■■■ 5.51
TPGS1-201ENST00000359315 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.45■■■■■ 5.51
TPGS1-201ENST00000359315 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.37■■■■■ 5.49
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.13■■■■■ 5.46
TPGS1-201ENST00000359315 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.13■■■■■ 5.46
TPGS1-201ENST00000359315 CFTRP13569 1480 aa49.06■■■■■ 5.44
TPGS1-201ENST00000359315 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.03■■■■■ 5.44
TPGS1-201ENST00000359315 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.94■■■■■ 5.43
TPGS1-201ENST00000359315 CUX2O14529 1486 aa48.94■■■■■ 5.43
TPGS1-201ENST00000359315 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.89■■■■■ 5.42
TPGS1-201ENST00000359315 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.82■■■■■ 5.41
TPGS1-201ENST00000359315 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.74■■■■■ 5.39
TPGS1-201ENST00000359315 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.7■■■■■ 5.39
TPGS1-201ENST00000359315 WDR62O43379 1518 aa48.54■■■■■ 5.36
TPGS1-201ENST00000359315 PRDM2Q13029 1718 aa48.49■■■■■ 5.35
TPGS1-201ENST00000359315 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.38■■■■■ 5.34
TPGS1-201ENST00000359315 TOPBP1Q92547 1522 aa48.04■■■■■ 5.28
TPGS1-201ENST00000359315 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.92■■■■■ 5.26
TPGS1-201ENST00000359315 ABCC8Q09428 1581 aa47.87■■■■■ 5.25
TPGS1-201ENST00000359315 IFT140Q96RY7 1462 aa47.71■■■■■ 5.23
TPGS1-201ENST00000359315 CUX1P39880 1505 aa47.68■■■■■ 5.22
TPGS1-201ENST00000359315 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.65■■■■■ 5.22
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.62■■■■■ 5.21
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.59■■■■■ 5.21
TPGS1-201ENST00000359315 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.52■■■■■ 5.2
TPGS1-201ENST00000359315 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
TPGS1-201ENST00000359315 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.49■■■■■ 5.19
TPGS1-201ENST00000359315 SOGA1O94964 1423 aa47.4■■■■■ 5.18
TPGS1-201ENST00000359315 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.34■■■■■ 5.17
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TPGS1-201ENST00000359315 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.3■■■■■ 5.16
TPGS1-201ENST00000359315 SYNJ1O43426 1573 aa47.24■■■■■ 5.15
TPGS1-201ENST00000359315 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.23■■■■■ 5.15
TPGS1-201ENST00000359315 TOP2BQ02880 1626 aa47.16■■■■■ 5.14
TPGS1-201ENST00000359315 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.14■■■■■ 5.14
TPGS1-201ENST00000359315 WDR97A6NE52 1622 aa47.06■■■■■ 5.12
TPGS1-201ENST00000359315 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.01■■■■■ 5.12
TPGS1-201ENST00000359315 OSCARQ8IYS5 282 aa46.9■■■■■ 5.1
TPGS1-201ENST00000359315 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.87■■■■■ 5.09
TPGS1-201ENST00000359315 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.85■■■■■ 5.09
TPGS1-201ENST00000359315 GRIN2BQ13224 1484 aa46.84■■■■■ 5.09
TPGS1-201ENST00000359315 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.83■■■■■ 5.09
TPGS1-201ENST00000359315 FBLN2P98095 1184 aa46.72■■■■■ 5.07
TPGS1-201ENST00000359315 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.7■■■■■ 5.07
TPGS1-201ENST00000359315 CHD1O14646 1710 aa46.7■■■■■ 5.07
TPGS1-201ENST00000359315 PBRM1Q86U86 1689 aa46.68■■■■■ 5.06
TPGS1-201ENST00000359315 SYNJ2O15056 1496 aa46.55■■■■■ 5.04
TPGS1-201ENST00000359315 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.53■■■■■ 5.04
TPGS1-201ENST00000359315 ADAMTS12P58397 1594 aa46.41■■■■■ 5.02
TPGS1-201ENST00000359315 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.39■■■■■ 5.02
TPGS1-201ENST00000359315 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.3■■■■■ 5
TPGS1-201ENST00000359315 KIF27Q86VH2 1401 aa46.28■■■■■ 5
TPGS1-201ENST00000359315 GRIN2AQ12879 1464 aa46.27■■■■■ 5
TPGS1-201ENST00000359315 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.27■■■■■ 5
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGEF11O15085 1522 aa46.22■■■■■ 4.99
TPGS1-201ENST00000359315 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.21■■■■■ 4.99
TPGS1-201ENST00000359315 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.21■■■■■ 4.99
TPGS1-201ENST00000359315 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.21■■■■■ 4.99
TPGS1-201ENST00000359315 IGF1RP08069 1367 aa46.17■■■■■ 4.98
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM41Q8WV44 630 aa46.09■■■■■ 4.97
TPGS1-201ENST00000359315 NUP160Q12769 1436 aa46.09■■■■■ 4.97
TPGS1-201ENST00000359315 CEP170Q5SW79 1584 aa46.09■■■■■ 4.97
TPGS1-201ENST00000359315 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46■■■■■ 4.95
TPGS1-201ENST00000359315 CUL7Q14999 1698 aa45.92■■■■■ 4.94
TPGS1-201ENST00000359315 ARAP1Q96P48 1450 aa45.89■■■■■ 4.94
TPGS1-201ENST00000359315 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.85■■■■■ 4.93
TPGS1-201ENST00000359315 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.8■■■■■ 4.92
TPGS1-201ENST00000359315 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.72■■■■■ 4.91
TPGS1-201ENST00000359315 SHROOM2Q13796 1616 aa45.69■■■■■ 4.9
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