Protein–RNA interactions for Protein: P51686

CCR9, C-C chemokine receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR9P51686 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR9P51686 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR9P51686 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR9P51686 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR9P51686 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR9P51686 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR9P51686 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR9P51686 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR9P51686 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR9P51686 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR9P51686 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR9P51686 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR9P51686 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR9P51686 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR9P51686 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR9P51686 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR9P51686 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR9P51686 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR9P51686 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR9P51686 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR9P51686 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR9P51686 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR9P51686 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR9P51686 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR9P51686 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR9P51686 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR9P51686 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR9P51686 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR9P51686 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR9P51686 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR9P51686 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR9P51686 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR9P51686 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR9P51686 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR9P51686 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR9P51686 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR9P51686 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR9P51686 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR9P51686 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR9P51686 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR9P51686 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR9P51686 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR9P51686 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR9P51686 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR9P51686 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR9P51686 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR9P51686 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR9P51686 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCR9P51686 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR9P51686 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR9P51686 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR9P51686 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR9P51686 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR9P51686 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR9P51686 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR9P51686 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR9P51686 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR9P51686 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR9P51686 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR9P51686 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR9P51686 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR9P51686 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR9P51686 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR9P51686 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR9P51686 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR9P51686 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR9P51686 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR9P51686 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR9P51686 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR9P51686 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR9P51686 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR9P51686 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR9P51686 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR9P51686 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR9P51686 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCR9P51686 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCR9P51686 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR9P51686 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR9P51686 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR9P51686 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR9P51686 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR9P51686 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR9P51686 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR9P51686 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR9P51686 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR9P51686 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR9P51686 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR9P51686 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR9P51686 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR9P51686 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR9P51686 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR9P51686 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR9P51686 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR9P51686 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR9P51686 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR9P51686 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR9P51686 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR9P51686 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR9P51686 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR9P51686 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms