RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371935.6

REXO4-201, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene REXO4, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-201ENST00000371935 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.27■■■■■ 6.6
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REXO4-201ENST00000371935 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.76■■■■■ 4.92
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REXO4-201ENST00000371935 SCRIBQ14160 1630 aa45.05■■■■■ 4.8
REXO4-201ENST00000371935 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.9■■■■■ 4.78
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REXO4-201ENST00000371935 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.6■■■■■ 4.57
REXO4-201ENST00000371935 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.52■■■■■ 4.56
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REXO4-201ENST00000371935 SMARCA4P51532 1647 aa43.2■■■■■ 4.51
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REXO4-201ENST00000371935 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
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REXO4-201ENST00000371935 SMARCA2P51531 1590 aa42.38■■■■■ 4.38
REXO4-201ENST00000371935 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.34■■■■■ 4.37
REXO4-201ENST00000371935 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.3■■■■■ 4.36
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REXO4-201ENST00000371935 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
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REXO4-201ENST00000371935 ABCC8Q09428 1581 aa41.61■■■■■ 4.25
REXO4-201ENST00000371935 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.5■■■■■ 4.23
REXO4-201ENST00000371935 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.37■■■■■ 4.21
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REXO4-201ENST00000371935 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
REXO4-201ENST00000371935 SYNJ1O43426 1573 aa41.1■■■■■ 4.17
REXO4-201ENST00000371935 CFTRP13569 1480 aa41.08■■■■■ 4.17
REXO4-201ENST00000371935 PRDM2Q13029 1718 aa41■■■■■ 4.15
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REXO4-201ENST00000371935 TOP2BQ02880 1626 aa40.87■■■■■ 4.13
REXO4-201ENST00000371935 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.85■■■■■ 4.13
REXO4-201ENST00000371935 EEA1Q15075 1411 aa40.83■■■■■ 4.13
REXO4-201ENST00000371935 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.82■■■■■ 4.13
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REXO4-201ENST00000371935 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.73■■■■■ 4.11
REXO4-201ENST00000371935 CUX1P39880 1505 aa40.67■■■■■ 4.1
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REXO4-201ENST00000371935 CUX2O14529 1486 aa39.94■■■■□ 3.98
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REXO4-201ENST00000371935 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.76■■■■□ 3.96
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REXO4-201ENST00000371935 PBRM1Q86U86 1689 aa39.14■■■■□ 3.86
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REXO4-201ENST00000371935 IFT140Q96RY7 1462 aa39.09■■■■□ 3.85
REXO4-201ENST00000371935 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.83
REXO4-201ENST00000371935 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.99■■■■□ 3.833e-6■■■■□ 22.7
REXO4-201ENST00000371935 APLP2Q06481 763 aa38.93■■■■□ 3.82
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