RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.04■■■■■ 4.16
GNPTAB-201ENST00000299314 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
GNPTAB-201ENST00000299314 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
GNPTAB-201ENST00000299314 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.52■■■■□ 3.76
GNPTAB-201ENST00000299314 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.44■■■■□ 3.74
GNPTAB-201ENST00000299314 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.39■■■■□ 3.74
GNPTAB-201ENST00000299314 APLP2Q06481 763 aa37.7■■■■□ 3.63
GNPTAB-201ENST00000299314 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.42■■■■□ 3.58
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
GNPTAB-201ENST00000299314 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ERICH6Q7L0X2 663 aa37.05■■■■□ 3.52
GNPTAB-201ENST00000299314 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
GNPTAB-201ENST00000299314 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
GNPTAB-201ENST00000299314 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM41Q8WV44 630 aa36.47■■■■□ 3.43
GNPTAB-201ENST00000299314 MYT1Q01538 1121 aa36.33■■■■□ 3.41
GNPTAB-201ENST00000299314 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
GNPTAB-201ENST00000299314 NEFLP07196 543 aa36.27■■■■□ 3.4
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
GNPTAB-201ENST00000299314 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
GNPTAB-201ENST00000299314 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
GNPTAB-201ENST00000299314 HRCP23327 699 aa35.56■■■■□ 3.28
GNPTAB-201ENST00000299314 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGAEP38570 1179 aa35.12■■■■□ 3.21
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.07■■■■□ 3.2
GNPTAB-201ENST00000299314 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.01■■■■□ 3.19
GNPTAB-201ENST00000299314 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
GNPTAB-201ENST00000299314 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.82■■■■□ 3.16
GNPTAB-201ENST00000299314 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
GNPTAB-201ENST00000299314 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
GNPTAB-201ENST00000299314 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
GNPTAB-201ENST00000299314 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.68■■■■□ 3.14
GNPTAB-201ENST00000299314 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.11
GNPTAB-201ENST00000299314 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.37■■■■□ 3.09
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa34.21■■■■□ 3.07
GNPTAB-201ENST00000299314 BCANQ96GW7 911 aa34.17■■■■□ 3.06
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
GNPTAB-201ENST00000299314 NEUROD1Q13562 356 aa34.04■■■■□ 3.04
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM52Q96A61 297 aa34■■■■□ 3.03
GNPTAB-201ENST00000299314 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
GNPTAB-201ENST00000299314 ANP32CO43423 234 aa33.92■■■■□ 3.02
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
GNPTAB-201ENST00000299314 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
GNPTAB-201ENST00000299314 CANXP27824 592 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
GNPTAB-201ENST00000299314 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
GNPTAB-201ENST00000299314 BCL11AQ9H165 835 aa33.27■■■□□ 2.92
GNPTAB-201ENST00000299314 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
GNPTAB-201ENST00000299314 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.22■■■□□ 2.91
GNPTAB-201ENST00000299314 FKBP8Q14318 412 aa33.13■■■□□ 2.89
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC24A1O60721 1099 aa33.11■■■□□ 2.89
GNPTAB-201ENST00000299314 NEFMP07197 916 aa33.1■■■□□ 2.89
GNPTAB-201ENST00000299314 P3H3Q8IVL6 736 aa33.03■■■□□ 2.88
GNPTAB-201ENST00000299314 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33■■■□□ 2.87
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCC9O60706 1549 aa32.97■■■□□ 2.87
GNPTAB-201ENST00000299314 FBLN2P98095 1184 aa32.96■■■□□ 2.87
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
GNPTAB-201ENST00000299314 ARID3CA6NKF2 412 aa32.93■■■□□ 2.86
GNPTAB-201ENST00000299314 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
GNPTAB-201ENST00000299314 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP32.86■■■□□ 2.85
GNPTAB-201ENST00000299314 TONSLQ96HA7 1378 aa32.82■■■□□ 2.84
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
GNPTAB-201ENST00000299314 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM9BQ8IZU0 186 aa32.76■■■□□ 2.83
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
GNPTAB-201ENST00000299314 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
GNPTAB-201ENST00000299314 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.71■■■□□ 2.83
GNPTAB-201ENST00000299314 NBR1Q14596 966 aa32.63■■■□□ 2.81
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC136Q96JN2 1154 aa32.6■■■□□ 2.81
GNPTAB-201ENST00000299314 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
GNPTAB-201ENST00000299314 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa32.54■■■□□ 2.8
GNPTAB-201ENST00000299314 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
GNPTAB-201ENST00000299314 TMC1Q8TDI8 760 aa32.46■■■□□ 2.79
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
GNPTAB-201ENST00000299314 CHGAP10645 457 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
GNPTAB-201ENST00000299314 MIER1Q8N108 512 aa32.38■■■□□ 2.77
GNPTAB-201ENST00000299314 ARXQ96QS3 562 aa32.37■■■□□ 2.77
GNPTAB-201ENST00000299314 MRS2Q9HD23 443 aa32.36■■■□□ 2.77
GNPTAB-201ENST00000299314 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP32.31■■■□□ 2.76
GNPTAB-201ENST00000299314 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.29■■■□□ 2.76
GNPTAB-201ENST00000299314 STAG3Q9UJ98 1225 aa32.24■■■□□ 2.75
GNPTAB-201ENST00000299314 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
GNPTAB-201ENST00000299314 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.13■■■□□ 2.73
GNPTAB-201ENST00000299314 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
GNPTAB-201ENST00000299314 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa32.11■■■□□ 2.73
GNPTAB-201ENST00000299314 SCRIBQ14160 1630 aa32.09■■■□□ 2.73
GNPTAB-201ENST00000299314 DDRGK1Q96HY6 314 aa32.07■■■□□ 2.72
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP32.01■■■□□ 2.71
GNPTAB-201ENST00000299314 MYH16Q9H6N6 1097 aa32■■■□□ 2.71
GNPTAB-201ENST00000299314 BECN1Q14457 450 aa31.98■■■□□ 2.71
GNPTAB-201ENST00000299314 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.96■■■□□ 2.71
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPY4P0CV99 314 aa31.92■■■□□ 2.7
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPY10P0CW01 314 aa31.92■■■□□ 2.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ANP32EQ9BTT0 268 aa31.91■■■□□ 2.7
GNPTAB-201ENST00000299314 CLIP1P30622 1438 aa31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms