RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359574.7

LFNG-203, Transcript of LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LFNG, Length 1,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LFNG-203ENST00000359574 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69,35■■■■■ 8,69
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LFNG-203ENST00000359574 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58,81■■■■■ 7,01
LFNG-203ENST00000359574 NACADO15069 1562 aa58,52■■■■■ 6,96
LFNG-203ENST00000359574 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58,41■■■■■ 6,94
LFNG-203ENST00000359574 MYO15BQ96JP2 1530 aa57,87■■■■■ 6,85
LFNG-203ENST00000359574 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57,57■■■■■ 6,81
LFNG-203ENST00000359574 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57,57■■■■■ 6,81
LFNG-203ENST00000359574 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP57,57■■■■■ 6,81
LFNG-203ENST00000359574 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57,37■■■■■ 6,77
LFNG-203ENST00000359574 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57,28■■■■■ 6,76
LFNG-203ENST00000359574 BICRAQ9NZM4 1560 aa57,12■■■■■ 6,74
LFNG-203ENST00000359574 SCRIBQ14160 1630 aa56,56■■■■■ 6,64
LFNG-203ENST00000359574 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56,37■■■■■ 6,61
LFNG-203ENST00000359574 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55,69■■■■■ 6,51
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LFNG-203ENST00000359574 CECR2Q9BXF3 1484 aa55,52■■■■■ 6,48
LFNG-203ENST00000359574 NCAPD3P42695 1498 aa54,08■■■■■ 6,25
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LFNG-203ENST00000359574 SMARCA4P51532 1647 aa53,97■■■■■ 6,23
LFNG-203ENST00000359574 SMARCA2P51531 1590 aa53,8■■■■■ 6,2
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LFNG-203ENST00000359574 MROH2BQ7Z745 1585 aa53,47■■■■■ 6,15
LFNG-203ENST00000359574 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53,46■■■■■ 6,15
LFNG-203ENST00000359574 PEG3Q9GZU2 1588 aa53,45■■■■■ 6,15
LFNG-203ENST00000359574 ERCC6Q03468 1493 aa53,22■■■■■ 6,11
LFNG-203ENST00000359574 NESP48681 1621 aa53,13■■■■■ 6,1
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LFNG-203ENST00000359574 WIZO95785 1651 aa52,78■■■■■ 6,04
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LFNG-203ENST00000359574 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52,51■■■■■ 6
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LFNG-203ENST00000359574 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52,43■■■■■ 5,98
LFNG-203ENST00000359574 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52,32■■■■■ 5,97
LFNG-203ENST00000359574 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52,18■■■■■ 5,94
LFNG-203ENST00000359574 MRC2Q9UBG0 1479 aa52■■■■■ 5,91
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LFNG-203ENST00000359574 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51,88■■■■■ 5,89
LFNG-203ENST00000359574 CEP164Q9UPV0 1460 aa51,86■■■■■ 5,89
LFNG-203ENST00000359574 WDR62O43379 1518 aa51,83■■■■■ 5,89
LFNG-203ENST00000359574 CCDC88BA6NC98 1476 aa51,62■■■■■ 5,85
LFNG-203ENST00000359574 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51,42■■■■■ 5,82
LFNG-203ENST00000359574 PRDM2Q13029 1718 aa51,25■■■■■ 5,79
LFNG-203ENST00000359574 TOPBP1Q92547 1522 aa50,93■■■■■ 5,74
LFNG-203ENST00000359574 IFT140Q96RY7 1462 aa50,82■■■■■ 5,73
LFNG-203ENST00000359574 ABCC8Q09428 1581 aa50,78■■■■■ 5,72
LFNG-203ENST00000359574 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50,74■■■■■ 5,71
LFNG-203ENST00000359574 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50,74■■■■■ 5,71
LFNG-203ENST00000359574 OSCARQ8IYS5 282 aa50,65■■■■■ 5,7
LFNG-203ENST00000359574 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50,55■■■■■ 5,68
LFNG-203ENST00000359574 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50,44■■■■■ 5,67
LFNG-203ENST00000359574 TRIM41Q8WV44 630 aa50,41■■■■■ 5,66
LFNG-203ENST00000359574 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50,4■■■■■ 5,66
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LFNG-203ENST00000359574 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50,18■■■■■ 5,62
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LFNG-203ENST00000359574 CHD1O14646 1710 aa49,87■■■■■ 5,57
LFNG-203ENST00000359574 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49,87■■■■■ 5,57
LFNG-203ENST00000359574 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49,87■■■■■ 5,57
LFNG-203ENST00000359574 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49,87■■■■■ 5,57
LFNG-203ENST00000359574 WDR97A6NE52 1622 aa49,86■■■■■ 5,57
LFNG-203ENST00000359574 ARHGEF11O15085 1522 aa49,82■■■■■ 5,57
LFNG-203ENST00000359574 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49,82■■■■■ 5,57
LFNG-203ENST00000359574 GRIN2BQ13224 1484 aa49,73■■■■■ 5,55
LFNG-203ENST00000359574 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49,67■■■■■ 5,54
LFNG-203ENST00000359574 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49,63■■■■■ 5,54
LFNG-203ENST00000359574 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49,61■■■■■ 5,53
LFNG-203ENST00000359574 GAPVD1Q14C86 1478 aa49,61■■■■■ 5,53
LFNG-203ENST00000359574 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49,53■■■■■ 5,52
LFNG-203ENST00000359574 SYNJ2O15056 1496 aa49,51■■■■■ 5,52
LFNG-203ENST00000359574 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49,47■■■■■ 5,51
LFNG-203ENST00000359574 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49,47■■■■■ 5,51
LFNG-203ENST00000359574 TOP2BQ02880 1626 aa49,46■■■■■ 5,51
LFNG-203ENST00000359574 SYNJ1O43426 1573 aa49,45■■■■■ 5,51
LFNG-203ENST00000359574 PBRM1Q86U86 1689 aa49,43■■■■■ 5,5
LFNG-203ENST00000359574 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49,42■■■■■ 5,5
LFNG-203ENST00000359574 CLASP1Q7Z460 1538 aa49,42■■■■■ 5,5
LFNG-203ENST00000359574 ARAP1Q96P48 1450 aa49,38■■■■■ 5,5
LFNG-203ENST00000359574 GRIN2AQ12879 1464 aa49,09■■■■■ 5,45
LFNG-203ENST00000359574 ADAMTS12P58397 1594 aa49,09■■■■■ 5,45
LFNG-203ENST00000359574 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49■■■■■ 5,43
LFNG-203ENST00000359574 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48,99■■■■■ 5,43
LFNG-203ENST00000359574 NUP160Q12769 1436 aa48,93■■■■■ 5,42
LFNG-203ENST00000359574 CEP170Q5SW79 1584 aa48,87■■■■■ 5,41
LFNG-203ENST00000359574 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48,77■■■■■ 5,4
LFNG-203ENST00000359574 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48,71■■■■■ 5,39
LFNG-203ENST00000359574 SHROOM2Q13796 1616 aa48,59■■■■■ 5,37
LFNG-203ENST00000359574 KIF27Q86VH2 1401 aa48,55■■■■■ 5,36
LFNG-203ENST00000359574 IGF1RP08069 1367 aa48,54■■■■■ 5,36
LFNG-203ENST00000359574 JPH4Q96JJ6 628 aa48,44■■■■■ 5,35
LFNG-203ENST00000359574 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48,44■■■■■ 5,34
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