RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517294.5

CCDC160-202, Transcript of coiled-coil domain containing 160, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CCDC160, Length 1,790 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160-202ENST00000517294 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.25■■■■■ 7.24
CCDC160-202ENST00000517294 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.81■■■■■ 6.04
CCDC160-202ENST00000517294 ABCC9O60706 1549 aa50.68■■■■■ 5.7
CCDC160-202ENST00000517294 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.47■■■■■ 5.67
CCDC160-202ENST00000517294 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.09■■■■■ 5.61
CCDC160-202ENST00000517294 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.7■■■■■ 5.55
CCDC160-202ENST00000517294 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.34■■■■■ 5.49
CCDC160-202ENST00000517294 NACADO15069 1562 aa49.32■■■■■ 5.49
CCDC160-202ENST00000517294 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.09■■■■■ 5.45
CCDC160-202ENST00000517294 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.84■■■■■ 5.41
CCDC160-202ENST00000517294 SCRIBQ14160 1630 aa48.6■■■■■ 5.37
CCDC160-202ENST00000517294 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.22■■■■■ 5.31
CCDC160-202ENST00000517294 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.72■■■■■ 5.23
CCDC160-202ENST00000517294 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.69■■■■■ 5.22
CCDC160-202ENST00000517294 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.97■■■■■ 5.11
CCDC160-202ENST00000517294 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
CCDC160-202ENST00000517294 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.59■■■■■ 5.05
CCDC160-202ENST00000517294 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
CCDC160-202ENST00000517294 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.5■■■■■ 5.03
CCDC160-202ENST00000517294 SMARCA4P51532 1647 aa46.48■■■■■ 5.03
CCDC160-202ENST00000517294 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.3■■■■■ 5
CCDC160-202ENST00000517294 WIZO95785 1651 aa46.21■■■■■ 4.99
CCDC160-202ENST00000517294 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.87■■■■■ 4.93
CCDC160-202ENST00000517294 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.86■■■■■ 4.93
CCDC160-202ENST00000517294 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.82■■■■■ 4.93
CCDC160-202ENST00000517294 SMARCA2P51531 1590 aa45.76■■■■■ 4.92
CCDC160-202ENST00000517294 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.61■■■■■ 4.89
CCDC160-202ENST00000517294 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.56■■■■■ 4.88
CCDC160-202ENST00000517294 NCAPD3P42695 1498 aa45.54■■■■■ 4.88
CCDC160-202ENST00000517294 HMGXB3Q12766 1538 aa45.41■■■■■ 4.86
CCDC160-202ENST00000517294 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.38■■■■■ 4.85
CCDC160-202ENST00000517294 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.18■■■■■ 4.82
CCDC160-202ENST00000517294 CFTRP13569 1480 aa44.36■■■■■ 4.69
CCDC160-202ENST00000517294 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.35■■■■■ 4.69
CCDC160-202ENST00000517294 NESP48681 1621 aa44.31■■■■■ 4.68
CCDC160-202ENST00000517294 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.2■■■■■ 4.67
CCDC160-202ENST00000517294 PRDM2Q13029 1718 aa44.13■■■■■ 4.66
CCDC160-202ENST00000517294 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.11■■■■■ 4.65
CCDC160-202ENST00000517294 ABCC8Q09428 1581 aa44.08■■■■■ 4.65
CCDC160-202ENST00000517294 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.89■■■■■ 4.62
CCDC160-202ENST00000517294 TRIM41Q8WV44 630 aa43.78■■■■■ 4.6
CCDC160-202ENST00000517294 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.76■■■■■ 4.6
CCDC160-202ENST00000517294 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.76■■■■■ 4.6
CCDC160-202ENST00000517294 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.76■■■■■ 4.6
CCDC160-202ENST00000517294 SYNJ1O43426 1573 aa43.69■■■■■ 4.58
CCDC160-202ENST00000517294 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.66■■■■■ 4.58
CCDC160-202ENST00000517294 CUX1P39880 1505 aa43.6■■■■■ 4.57
CCDC160-202ENST00000517294 TOP2BQ02880 1626 aa43.49■■■■■ 4.55
CCDC160-202ENST00000517294 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.47■■■■■ 4.55
CCDC160-202ENST00000517294 ERCC6Q03468 1493 aa43.45■■■■■ 4.55
CCDC160-202ENST00000517294 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
CCDC160-202ENST00000517294 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.36■■■■■ 4.53
CCDC160-202ENST00000517294 TOPBP1Q92547 1522 aa43.35■■■■■ 4.53
CCDC160-202ENST00000517294 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.3■■■■■ 4.52
CCDC160-202ENST00000517294 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.21■■■■■ 4.51
CCDC160-202ENST00000517294 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
CCDC160-202ENST00000517294 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
CCDC160-202ENST00000517294 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
CCDC160-202ENST00000517294 WDR62O43379 1518 aa43.09■■■■■ 4.49
CCDC160-202ENST00000517294 SOGA1O94964 1423 aa43.09■■■■■ 4.49
CCDC160-202ENST00000517294 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.02■■■■■ 4.48
CCDC160-202ENST00000517294 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.01■■■■■ 4.48
CCDC160-202ENST00000517294 CUX2O14529 1486 aa42.84■■■■■ 4.45
CCDC160-202ENST00000517294 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
CCDC160-202ENST00000517294 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.75■■■■■ 4.43
CCDC160-202ENST00000517294 WDR97A6NE52 1622 aa42.74■■■■■ 4.43
CCDC160-202ENST00000517294 KIF27Q86VH2 1401 aa42.68■■■■■ 4.42
CCDC160-202ENST00000517294 EEA1Q15075 1411 aa42.66■■■■■ 4.42
CCDC160-202ENST00000517294 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.41
CCDC160-202ENST00000517294 IFT140Q96RY7 1462 aa42.63■■■■■ 4.41
CCDC160-202ENST00000517294 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.61■■■■■ 4.41
CCDC160-202ENST00000517294 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.6■■■■■ 4.41
CCDC160-202ENST00000517294 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.57■■■■■ 4.41
CCDC160-202ENST00000517294 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
CCDC160-202ENST00000517294 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.51■■■■■ 4.4
CCDC160-202ENST00000517294 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.48■■■■■ 4.39
CCDC160-202ENST00000517294 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.43■■■■■ 4.38
CCDC160-202ENST00000517294 IGF1RP08069 1367 aa42.42■■■■■ 4.38
CCDC160-202ENST00000517294 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
CCDC160-202ENST00000517294 PBRM1Q86U86 1689 aa42.3■■■■■ 4.36
CCDC160-202ENST00000517294 PRXQ9BXM0 1461 aa42.25■■■■■ 4.35
CCDC160-202ENST00000517294 KIF21BO75037 1637 aa42.25■■■■■ 4.35
CCDC160-202ENST00000517294 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.22■■■■■ 4.35
CCDC160-202ENST00000517294 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.22■■■■■ 4.35
CCDC160-202ENST00000517294 GRIN2BQ13224 1484 aa42.18■■■■■ 4.34
CCDC160-202ENST00000517294 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.18■■■■■ 4.34
CCDC160-202ENST00000517294 GOLGA3Q08378 1498 aa42.14■■■■■ 4.34
CCDC160-202ENST00000517294 CUL7Q14999 1698 aa42.12■■■■■ 4.33
CCDC160-202ENST00000517294 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.05■■■■■ 4.32
CCDC160-202ENST00000517294 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
CCDC160-202ENST00000517294 ADAMTS12P58397 1594 aa42.01■■■■■ 4.32
CCDC160-202ENST00000517294 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.93■■■■■ 4.3
CCDC160-202ENST00000517294 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
CCDC160-202ENST00000517294 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.86■■■■■ 4.29
CCDC160-202ENST00000517294 SYNJ2O15056 1496 aa41.75■■■■■ 4.27
CCDC160-202ENST00000517294 FBLN2P98095 1184 aa41.75■■■■■ 4.27
CCDC160-202ENST00000517294 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
CCDC160-202ENST00000517294 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
CCDC160-202ENST00000517294 GRIN2AQ12879 1464 aa41.69■■■■■ 4.27
CCDC160-202ENST00000517294 CEP162Q5TB80 1403 aa41.65■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms