Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.629e-7■□□□□ 9
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NIPBLQ6KC79 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.662e-6■□□□□ 8.9
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NIPBLQ6KC79 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-8■□□□□ 8.7
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NIPBLQ6KC79 IRF3-205ENST00000593337 633 ntTSL 315.26■□□□□ 0.031e-8■□□□□ 8.7
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NIPBLQ6KC79 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-8■□□□□ 8.7
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NIPBLQ6KC79 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.391e-8■□□□□ 8.7
NIPBLQ6KC79 IRF3-206ENST00000593818 924 ntTSL 211.98□□□□□ -0.491e-8■□□□□ 8.7
NIPBLQ6KC79 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-8■□□□□ 8.7
NIPBLQ6KC79 IRF3-229ENST00000601373 680 ntTSL 211.15□□□□□ -0.621e-8■□□□□ 8.7
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