RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442447.5

RBM39-215, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 644 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-215ENST00000442447 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.78■■■■□ 3.96
RBM39-215ENST00000442447 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.46■■■■□ 3.27
RBM39-215ENST00000442447 ABCC9O60706 1549 aa35.01■■■■□ 3.19
RBM39-215ENST00000442447 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.51■■■□□ 2.96
RBM39-215ENST00000442447 NACADO15069 1562 aa33.4■■■□□ 2.94
RBM39-215ENST00000442447 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.38■■■□□ 2.93
RBM39-215ENST00000442447 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.09■■■□□ 2.89
RBM39-215ENST00000442447 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
RBM39-215ENST00000442447 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.87■■■□□ 2.85
RBM39-215ENST00000442447 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.75■■■□□ 2.83
RBM39-215ENST00000442447 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.68■■■□□ 2.82
RBM39-215ENST00000442447 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.53■■■□□ 2.8
RBM39-215ENST00000442447 SCRIBQ14160 1630 aa32.4■■■□□ 2.78
RBM39-215ENST00000442447 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.36■■■□□ 2.77
RBM39-215ENST00000442447 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.11■■■□□ 2.73
RBM39-215ENST00000442447 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
RBM39-215ENST00000442447 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.63■■■□□ 2.65
RBM39-215ENST00000442447 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.46■■■□□ 2.63
RBM39-215ENST00000442447 SMARCA4P51532 1647 aa30.93■■■□□ 2.54
RBM39-215ENST00000442447 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
RBM39-215ENST00000442447 NCAPD3P42695 1498 aa30.83■■■□□ 2.53
RBM39-215ENST00000442447 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.83■■■□□ 2.53
RBM39-215ENST00000442447 SMARCA2P51531 1590 aa30.76■■■□□ 2.52
RBM39-215ENST00000442447 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.67■■■□□ 2.5
RBM39-215ENST00000442447 HMGXB3Q12766 1538 aa30.66■■■□□ 2.5
RBM39-215ENST00000442447 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.6■■■□□ 2.49
RBM39-215ENST00000442447 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
RBM39-215ENST00000442447 WIZO95785 1651 aa30.33■■■□□ 2.45
RBM39-215ENST00000442447 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
RBM39-215ENST00000442447 NESP48681 1621 aa30.22■■■□□ 2.43
RBM39-215ENST00000442447 ERCC6Q03468 1493 aa30.19■■■□□ 2.42
RBM39-215ENST00000442447 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.06■■■□□ 2.4
RBM39-215ENST00000442447 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
RBM39-215ENST00000442447 CUX2O14529 1486 aa29.93■■■□□ 2.38
RBM39-215ENST00000442447 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.93■■■□□ 2.38
RBM39-215ENST00000442447 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.88■■■□□ 2.37
RBM39-215ENST00000442447 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.83■■■□□ 2.37
RBM39-215ENST00000442447 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
RBM39-215ENST00000442447 CFTRP13569 1480 aa29.7■■■□□ 2.35
RBM39-215ENST00000442447 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.64■■■□□ 2.34
RBM39-215ENST00000442447 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.61■■■□□ 2.33
RBM39-215ENST00000442447 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.61■■■□□ 2.33
RBM39-215ENST00000442447 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.59■■■□□ 2.33
RBM39-215ENST00000442447 WDR62O43379 1518 aa29.5■■■□□ 2.31
RBM39-215ENST00000442447 PRDM2Q13029 1718 aa29.42■■■□□ 2.3
RBM39-215ENST00000442447 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
RBM39-215ENST00000442447 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.32■■■□□ 2.28
RBM39-215ENST00000442447 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
RBM39-215ENST00000442447 TOPBP1Q92547 1522 aa29.1■■■□□ 2.25
RBM39-215ENST00000442447 ABCC8Q09428 1581 aa29.04■■■□□ 2.24
RBM39-215ENST00000442447 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.04■■■□□ 2.24
RBM39-215ENST00000442447 IFT140Q96RY7 1462 aa28.97■■■□□ 2.23
RBM39-215ENST00000442447 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
RBM39-215ENST00000442447 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
RBM39-215ENST00000442447 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
RBM39-215ENST00000442447 CUX1P39880 1505 aa28.79■■■□□ 2.2
RBM39-215ENST00000442447 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
RBM39-215ENST00000442447 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.73■■■□□ 2.19
RBM39-215ENST00000442447 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.73■■■□□ 2.19
RBM39-215ENST00000442447 SOGA1O94964 1423 aa28.71■■■□□ 2.19
RBM39-215ENST00000442447 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.183e-11■■■■□ 22.5
RBM39-215ENST00000442447 OSCARQ8IYS5 282 aa28.64■■■□□ 2.18
RBM39-215ENST00000442447 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
RBM39-215ENST00000442447 WDR97A6NE52 1622 aa28.52■■■□□ 2.16
RBM39-215ENST00000442447 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
RBM39-215ENST00000442447 SYNJ1O43426 1573 aa28.45■■■□□ 2.15
RBM39-215ENST00000442447 TOP2BQ02880 1626 aa28.45■■■□□ 2.14
RBM39-215ENST00000442447 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.45■■■□□ 2.14
RBM39-215ENST00000442447 CHD1O14646 1710 aa28.43■■■□□ 2.14
RBM39-215ENST00000442447 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.43■■■□□ 2.14
RBM39-215ENST00000442447 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.43■■■□□ 2.14
RBM39-215ENST00000442447 FBLN2P98095 1184 aa28.41■■■□□ 2.14
RBM39-215ENST00000442447 GRIN2BQ13224 1484 aa28.4■■■□□ 2.14
RBM39-215ENST00000442447 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.38■■■□□ 2.13
RBM39-215ENST00000442447 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
RBM39-215ENST00000442447 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.34■■■□□ 2.13
RBM39-215ENST00000442447 PBRM1Q86U86 1689 aa28.32■■■□□ 2.12
RBM39-215ENST00000442447 TRIM41Q8WV44 630 aa28.3■■■□□ 2.12
RBM39-215ENST00000442447 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
RBM39-215ENST00000442447 SYNJ2O15056 1496 aa28.24■■■□□ 2.11
RBM39-215ENST00000442447 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.24■■■□□ 2.11
RBM39-215ENST00000442447 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.24■■■□□ 2.11
RBM39-215ENST00000442447 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.24■■■□□ 2.11
RBM39-215ENST00000442447 ARHGEF11O15085 1522 aa28.2■■■□□ 2.1
RBM39-215ENST00000442447 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.13■■■□□ 2.09
RBM39-215ENST00000442447 ADAMTS12P58397 1594 aa28.11■■■□□ 2.09
RBM39-215ENST00000442447 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.08■■■□□ 2.08
RBM39-215ENST00000442447 GRIN2AQ12879 1464 aa28.04■■■□□ 2.08
RBM39-215ENST00000442447 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.03■■■□□ 2.08
RBM39-215ENST00000442447 ARAP1Q96P48 1450 aa27.97■■■□□ 2.07
RBM39-215ENST00000442447 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.96■■■□□ 2.07
RBM39-215ENST00000442447 CEP170Q5SW79 1584 aa27.93■■■□□ 2.06
RBM39-215ENST00000442447 NUP160Q12769 1436 aa27.92■■■□□ 2.06
RBM39-215ENST00000442447 KIF27Q86VH2 1401 aa27.92■■■□□ 2.06
RBM39-215ENST00000442447 IGF1RP08069 1367 aa27.84■■■□□ 2.05
RBM39-215ENST00000442447 CUL7Q14999 1698 aa27.77■■■□□ 2.04
RBM39-215ENST00000442447 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.74■■■□□ 2.03
RBM39-215ENST00000442447 SHROOM2Q13796 1616 aa27.73■■■□□ 2.03
RBM39-215ENST00000442447 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.69■■■□□ 2.02
RBM39-215ENST00000442447 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms