RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598108.5

IRF3-220, Transcript of interferon regulatory factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene IRF3, Length 1,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3-220ENST00000598108 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.55■■■■■ 6.48
IRF3-220ENST00000598108 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.23■■■■■ 5.47
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IRF3-220ENST00000598108 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.63■■■■■ 5.06
IRF3-220ENST00000598108 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.49■■■■■ 5.03
IRF3-220ENST00000598108 NACADO15069 1562 aa46.43■■■■■ 5.02
IRF3-220ENST00000598108 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.22■■■■■ 4.99
IRF3-220ENST00000598108 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.11■■■■■ 4.97
IRF3-220ENST00000598108 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.88■■■■■ 4.94
IRF3-220ENST00000598108 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.47■■■■■ 4.873e-7■□□□□ 10.7
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IRF3-220ENST00000598108 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.17■■■■■ 4.82
IRF3-220ENST00000598108 SCRIBQ14160 1630 aa45.06■■■■■ 4.8
IRF3-220ENST00000598108 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.86■■■■■ 4.77
IRF3-220ENST00000598108 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.56■■■■■ 4.72
IRF3-220ENST00000598108 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
IRF3-220ENST00000598108 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.81■■■■■ 4.6
IRF3-220ENST00000598108 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.61■■■■■ 4.57
IRF3-220ENST00000598108 SMARCA4P51532 1647 aa43.05■■■■■ 4.48
IRF3-220ENST00000598108 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
IRF3-220ENST00000598108 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.96■■■■■ 4.47
IRF3-220ENST00000598108 NCAPD3P42695 1498 aa42.94■■■■■ 4.47
IRF3-220ENST00000598108 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.85■■■■■ 4.45
IRF3-220ENST00000598108 SMARCA2P51531 1590 aa42.79■■■■■ 4.44
IRF3-220ENST00000598108 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.63■■■■■ 4.41
IRF3-220ENST00000598108 HMGXB3Q12766 1538 aa42.61■■■■■ 4.41
IRF3-220ENST00000598108 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
IRF3-220ENST00000598108 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
IRF3-220ENST00000598108 WIZO95785 1651 aa42.31■■■■■ 4.36
IRF3-220ENST00000598108 NESP48681 1621 aa41.99■■■■■ 4.31
IRF3-220ENST00000598108 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
IRF3-220ENST00000598108 ERCC6Q03468 1493 aa41.79■■■■■ 4.28
IRF3-220ENST00000598108 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.72■■■■■ 4.27
IRF3-220ENST00000598108 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.71■■■■■ 4.27
IRF3-220ENST00000598108 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.53■■■■■ 4.24
IRF3-220ENST00000598108 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.46■■■■■ 4.23
IRF3-220ENST00000598108 CFTRP13569 1480 aa41.41■■■■■ 4.22
IRF3-220ENST00000598108 CUX2O14529 1486 aa41.35■■■■■ 4.21
IRF3-220ENST00000598108 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.29■■■■■ 4.2
IRF3-220ENST00000598108 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
IRF3-220ENST00000598108 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
IRF3-220ENST00000598108 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.2■■■■■ 4.19
IRF3-220ENST00000598108 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.11■■■■■ 4.17
IRF3-220ENST00000598108 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.09■■■■■ 4.17
IRF3-220ENST00000598108 WDR62O43379 1518 aa40.93■■■■■ 4.14
IRF3-220ENST00000598108 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
IRF3-220ENST00000598108 PRDM2Q13029 1718 aa40.79■■■■■ 4.12
IRF3-220ENST00000598108 TOPBP1Q92547 1522 aa40.52■■■■■ 4.08
IRF3-220ENST00000598108 ABCC8Q09428 1581 aa40.44■■■■■ 4.06
IRF3-220ENST00000598108 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.41■■■■■ 4.06
IRF3-220ENST00000598108 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.39■■■■■ 4.06
IRF3-220ENST00000598108 IFT140Q96RY7 1462 aa40.27■■■■■ 4.04
IRF3-220ENST00000598108 CUX1P39880 1505 aa40.19■■■■■ 4.02
IRF3-220ENST00000598108 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
IRF3-220ENST00000598108 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
IRF3-220ENST00000598108 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.07■■■■■ 4
IRF3-220ENST00000598108 SOGA1O94964 1423 aa40.06■■■■■ 4
IRF3-220ENST00000598108 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.06■■■■■ 4
IRF3-220ENST00000598108 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
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IRF3-220ENST00000598108 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.89■■■■□ 3.98
IRF3-220ENST00000598108 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
IRF3-220ENST00000598108 OSCARQ8IYS5 282 aa39.76■■■■□ 3.96
IRF3-220ENST00000598108 SYNJ1O43426 1573 aa39.76■■■■□ 3.95
IRF3-220ENST00000598108 TOP2BQ02880 1626 aa39.73■■■■□ 3.95
IRF3-220ENST00000598108 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.66■■■■□ 3.94
IRF3-220ENST00000598108 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.65■■■■□ 3.94
IRF3-220ENST00000598108 WDR97A6NE52 1622 aa39.58■■■■□ 3.93
IRF3-220ENST00000598108 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.55■■■■□ 3.92
IRF3-220ENST00000598108 GRIN2BQ13224 1484 aa39.54■■■■□ 3.92
IRF3-220ENST00000598108 FBLN2P98095 1184 aa39.53■■■■□ 3.92
IRF3-220ENST00000598108 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.52■■■■□ 3.92
IRF3-220ENST00000598108 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.42■■■■□ 3.9
IRF3-220ENST00000598108 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
IRF3-220ENST00000598108 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
IRF3-220ENST00000598108 CHD1O14646 1710 aa39.34■■■■□ 3.89
IRF3-220ENST00000598108 SYNJ2O15056 1496 aa39.29■■■■□ 3.88
IRF3-220ENST00000598108 PBRM1Q86U86 1689 aa39.29■■■■□ 3.88
IRF3-220ENST00000598108 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.13■■■■□ 3.85
IRF3-220ENST00000598108 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.08■■■■□ 3.85
IRF3-220ENST00000598108 ADAMTS12P58397 1594 aa39.07■■■■□ 3.84
IRF3-220ENST00000598108 KIF27Q86VH2 1401 aa39.05■■■■□ 3.84
IRF3-220ENST00000598108 TRIM41Q8WV44 630 aa39.04■■■■□ 3.84
IRF3-220ENST00000598108 GRIN2AQ12879 1464 aa39.03■■■■□ 3.84
IRF3-220ENST00000598108 IGF1RP08069 1367 aa39.02■■■■□ 3.84
IRF3-220ENST00000598108 ARHGEF11O15085 1522 aa39.02■■■■□ 3.84
IRF3-220ENST00000598108 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.01■■■■□ 3.84
IRF3-220ENST00000598108 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.99■■■■□ 3.83
IRF3-220ENST00000598108 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.99■■■■□ 3.83
IRF3-220ENST00000598108 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.99■■■■□ 3.83
IRF3-220ENST00000598108 NUP160Q12769 1436 aa38.89■■■■□ 3.82
IRF3-220ENST00000598108 CEP170Q5SW79 1584 aa38.82■■■■□ 3.81
IRF3-220ENST00000598108 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.81■■■■□ 3.8
IRF3-220ENST00000598108 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.77■■■■□ 3.8
IRF3-220ENST00000598108 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.74■■■■□ 3.79
IRF3-220ENST00000598108 ARAP1Q96P48 1450 aa38.73■■■■□ 3.79
IRF3-220ENST00000598108 CUL7Q14999 1698 aa38.66■■■■□ 3.78
IRF3-220ENST00000598108 JPH4Q96JJ6 628 aa38.6■■■■□ 3.77
IRF3-220ENST00000598108 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.54■■■■□ 3.76
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