RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636968.1

FASN-210, Transcript of fatty acid synthase, humanhuman

TSL 5

Gene FASN, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FASN-210ENST00000636968 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.75■■■■■ 4.27
FASN-210ENST00000636968 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.25■■■■□ 3.55
FASN-210ENST00000636968 ABCC9O60706 1549 aa36.85■■■■□ 3.49
FASN-210ENST00000636968 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.19■■■■□ 3.22
FASN-210ENST00000636968 NACADO15069 1562 aa35.06■■■■□ 3.2
FASN-210ENST00000636968 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.94■■■■□ 3.18
FASN-210ENST00000636968 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
FASN-210ENST00000636968 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.71■■■■□ 3.15
FASN-210ENST00000636968 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.58■■■■□ 3.13
FASN-210ENST00000636968 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.47■■■■□ 3.11
FASN-210ENST00000636968 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.37■■■■□ 3.09
FASN-210ENST00000636968 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.31■■■■□ 3.08
FASN-210ENST00000636968 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.23■■■■□ 3.07
FASN-210ENST00000636968 SCRIBQ14160 1630 aa34.04■■■■□ 3.04
FASN-210ENST00000636968 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.69■■■□□ 2.98
FASN-210ENST00000636968 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
FASN-210ENST00000636968 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.31■■■□□ 2.92
FASN-210ENST00000636968 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.1■■■□□ 2.89
FASN-210ENST00000636968 SMARCA4P51532 1647 aa32.5■■■□□ 2.79
FASN-210ENST00000636968 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.39■■■□□ 2.78
FASN-210ENST00000636968 NCAPD3P42695 1498 aa32.38■■■□□ 2.77
FASN-210ENST00000636968 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
FASN-210ENST00000636968 SMARCA2P51531 1590 aa32.26■■■□□ 2.75
FASN-210ENST00000636968 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.24■■■□□ 2.75
FASN-210ENST00000636968 HMGXB3Q12766 1538 aa32.2■■■□□ 2.74
FASN-210ENST00000636968 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.15■■■□□ 2.74
FASN-210ENST00000636968 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
FASN-210ENST00000636968 WIZO95785 1651 aa31.89■■■□□ 2.7
FASN-210ENST00000636968 NESP48681 1621 aa31.85■■■□□ 2.69
FASN-210ENST00000636968 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
FASN-210ENST00000636968 ERCC6Q03468 1493 aa31.68■■■□□ 2.66
FASN-210ENST00000636968 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.57■■■□□ 2.64
FASN-210ENST00000636968 CUX2O14529 1486 aa31.47■■■□□ 2.63
FASN-210ENST00000636968 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
FASN-210ENST00000636968 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.44■■■□□ 2.62
FASN-210ENST00000636968 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
FASN-210ENST00000636968 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.41■■■□□ 2.62
FASN-210ENST00000636968 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.32■■■□□ 2.6
FASN-210ENST00000636968 CFTRP13569 1480 aa31.18■■■□□ 2.58
FASN-210ENST00000636968 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.1■■■□□ 2.57
FASN-210ENST00000636968 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.09■■■□□ 2.57
FASN-210ENST00000636968 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.08■■■□□ 2.57
FASN-210ENST00000636968 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.05■■■□□ 2.56
FASN-210ENST00000636968 WDR62O43379 1518 aa31.04■■■□□ 2.56
FASN-210ENST00000636968 PRDM2Q13029 1718 aa30.94■■■□□ 2.54
FASN-210ENST00000636968 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.94■■■□□ 2.54
FASN-210ENST00000636968 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
FASN-210ENST00000636968 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
FASN-210ENST00000636968 TOPBP1Q92547 1522 aa30.57■■■□□ 2.48
FASN-210ENST00000636968 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.48■■■□□ 2.47
FASN-210ENST00000636968 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
FASN-210ENST00000636968 IFT140Q96RY7 1462 aa30.39■■■□□ 2.46
FASN-210ENST00000636968 ABCC8Q09428 1581 aa30.39■■■□□ 2.46
FASN-210ENST00000636968 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
FASN-210ENST00000636968 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
FASN-210ENST00000636968 CUX1P39880 1505 aa30.27■■■□□ 2.44
FASN-210ENST00000636968 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
FASN-210ENST00000636968 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.21■■■□□ 2.43
FASN-210ENST00000636968 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.17■■■□□ 2.42
FASN-210ENST00000636968 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.16■■■□□ 2.423e-26■■■■■ 34.2
FASN-210ENST00000636968 SOGA1O94964 1423 aa30.1■■■□□ 2.41
FASN-210ENST00000636968 OSCARQ8IYS5 282 aa30.06■■■□□ 2.4
FASN-210ENST00000636968 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
FASN-210ENST00000636968 WDR97A6NE52 1622 aa30■■■□□ 2.39
FASN-210ENST00000636968 CHD1O14646 1710 aa29.96■■■□□ 2.39
FASN-210ENST00000636968 SYNJ1O43426 1573 aa29.9■■■□□ 2.38
FASN-210ENST00000636968 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.87■■■□□ 2.37
FASN-210ENST00000636968 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.87■■■□□ 2.37
FASN-210ENST00000636968 TOP2BQ02880 1626 aa29.85■■■□□ 2.37
FASN-210ENST00000636968 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.84■■■□□ 2.37
FASN-210ENST00000636968 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.82■■■□□ 2.36
FASN-210ENST00000636968 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.8■■■□□ 2.36
FASN-210ENST00000636968 PBRM1Q86U86 1689 aa29.79■■■□□ 2.36
FASN-210ENST00000636968 TRIM41Q8WV44 630 aa29.79■■■□□ 2.36
FASN-210ENST00000636968 GRIN2BQ13224 1484 aa29.78■■■□□ 2.36
FASN-210ENST00000636968 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.78■■■□□ 2.36
FASN-210ENST00000636968 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.78■■■□□ 2.36
FASN-210ENST00000636968 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.78■■■□□ 2.36
FASN-210ENST00000636968 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.76■■■□□ 2.35
FASN-210ENST00000636968 FBLN2P98095 1184 aa29.76■■■□□ 2.35
FASN-210ENST00000636968 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
FASN-210ENST00000636968 ARHGEF11O15085 1522 aa29.71■■■□□ 2.35
FASN-210ENST00000636968 SYNJ2O15056 1496 aa29.64■■■□□ 2.34
FASN-210ENST00000636968 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.61■■■□□ 2.33
FASN-210ENST00000636968 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
FASN-210ENST00000636968 ADAMTS12P58397 1594 aa29.54■■■□□ 2.32
FASN-210ENST00000636968 ARAP1Q96P48 1450 aa29.48■■■□□ 2.31
FASN-210ENST00000636968 GRIN2AQ12879 1464 aa29.44■■■□□ 2.3
FASN-210ENST00000636968 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.43■■■□□ 2.3
FASN-210ENST00000636968 CEP170Q5SW79 1584 aa29.39■■■□□ 2.29
FASN-210ENST00000636968 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.38■■■□□ 2.29
FASN-210ENST00000636968 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.37■■■□□ 2.29
FASN-210ENST00000636968 NUP160Q12769 1436 aa29.33■■■□□ 2.29
FASN-210ENST00000636968 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.26■■■□□ 2.28
FASN-210ENST00000636968 KIF27Q86VH2 1401 aa29.2■■■□□ 2.26
FASN-210ENST00000636968 IGF1RP08069 1367 aa29.19■■■□□ 2.26
FASN-210ENST00000636968 SHROOM2Q13796 1616 aa29.19■■■□□ 2.26
FASN-210ENST00000636968 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.11■■■□□ 2.25
FASN-210ENST00000636968 CUL7Q14999 1698 aa29.1■■■□□ 2.25
FASN-210ENST00000636968 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
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