Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.263e-6■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.383e-6■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.393e-6■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.938e-8■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)12.82□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 SRRM2-225ENST00000576076 914 nt16.25■□□□□ 0.191e-7■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 RPS13-207ENST00000531008 594 ntTSL 24.39□□□□□ -1.714e-51■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.034e-51■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 DYNC1H1-203ENST00000554854 721 ntTSL 38.46□□□□□ -1.062e-7■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 XIST-211ENST00000635841 1734 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.076e-15■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 HNRNPA2B1-203ENST00000360787 1724 ntTSL 513.33□□□□□ -0.281e-6■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 212.32□□□□□ -0.441e-6■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.891e-6■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.31e-6■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 HNRNPA2B1-207ENST00000495810 482 ntTSL 210.39□□□□□ -0.758e-20■□□□□ 10.2
TRA2AQ13595 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.324e-26■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 23.65□□□□□ -1.834e-26■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.414e-26■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 12e-15■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-15■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 RPLP2-208ENST00000532004 353 ntTSL 315.07■□□□□ 02e-15■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 RPLP2-206ENST00000530398 313 ntTSL 311.44□□□□□ -0.582e-15■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 RPLP2-203ENST00000525722 489 ntTSL 211.08□□□□□ -0.642e-15■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 RPLP2-204ENST00000526222 350 ntTSL 211.08□□□□□ -0.642e-15■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 RPLP2-205ENST00000527517 646 ntTSL 210.95□□□□□ -0.662e-15■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 NUSAP1-201ENST00000260359 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 NUSAP1-203ENST00000450592 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.082e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 NUSAP1-212ENST00000560747 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.12e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 NUSAP1-205ENST00000558123 1934 ntTSL 57.89□□□□□ -1.152e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 NUSAP1-210ENST00000560177 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.192e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.382e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.972e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.451e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 USP36-214ENST00000589225 5885 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.331e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 USP36-210ENST00000588086 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.91□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.391e-6■□□□□ 10.1
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TRA2AQ13595 STT3B-207ENST00000488151 436 ntTSL 22.52□□□□□ -2.011e-6■□□□□ 10.1
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TRA2AQ13595 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.577e-16■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 RPL3-203ENST00000402527 1205 ntTSL 517.86■□□□□ 0.452e-30■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-30■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.172e-30■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 RPL3-211ENST00000465618 2108 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.232e-30■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.374e-29■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 HMGB2-204ENST00000506267 629 ntTSL 322.1■■□□□ 1.131e-17■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.24e-19■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNHG5-203ENST00000420199 1002 ntTSL 315.2■□□□□ 0.024e-19■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNHG5-215ENST00000623163 851 ntTSL 514.4□□□□□ -0.14e-19■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNHG5-209ENST00000435947 696 ntTSL 213.74□□□□□ -0.214e-19■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.424e-19■□□□□ 10.1
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TRA2AQ13595 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.534e-19■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNHG5-207ENST00000431043 998 ntTSL 211.71□□□□□ -0.534e-19■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNHG5-212ENST00000589187 568 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.664e-19■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-272ENST00000641991 1360 nt10.81□□□□□ -0.682e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC10.39□□□□□ -0.752e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-247ENST00000641642 1107 nt9.95□□□□□ -0.822e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNHG5-202ENST00000414002 430 ntTSL 29.73□□□□□ -0.854e-19■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-230ENST00000641421 1530 ntBASIC9.7□□□□□ -0.862e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-235ENST00000641496 1154 nt9.44□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-263ENST00000641880 1404 nt8.81□□□□□ -12e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-273ENST00000642010 925 nt8.56□□□□□ -1.042e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNHG5-220ENST00000624128 672 ntTSL 28.43□□□□□ -1.064e-19■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-254ENST00000641719 1443 nt8.3□□□□□ -1.082e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-214ENST00000641171 1493 nt8.01□□□□□ -1.132e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.134e-19■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNHG5-217ENST00000623650 886 ntTSL 57.78□□□□□ -1.164e-19■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-252ENST00000641704 1313 nt7.78□□□□□ -1.162e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-216ENST00000641179 1140 nt7.67□□□□□ -1.182e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-266ENST00000641934 1050 nt7.56□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-240ENST00000641578 1061 nt7.26□□□□□ -1.252e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-218ENST00000641218 1522 nt7.22□□□□□ -1.252e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-257ENST00000641786 816 nt7.18□□□□□ -1.262e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-250ENST00000641696 886 nt7.1□□□□□ -1.272e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-211ENST00000641106 1184 nt7.04□□□□□ -1.282e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-239ENST00000641547 915 nt6.93□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC6.93□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-224ENST00000641362 1146 nt6.93□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-276ENST00000642077 993 nt6.93□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC6.93□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-220ENST00000641298 974 nt6.93□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-207ENST00000641029 1047 nt6.92□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC6.92□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-244ENST00000641604 1251 nt6.9□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-283ENST00000642134 870 nt6.77□□□□□ -1.332e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC6.58□□□□□ -1.362e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.46□□□□□ -1.382e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-253ENST00000641706 818 nt6.41□□□□□ -1.382e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC6.29□□□□□ -1.42e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-249ENST00000641681 871 nt6.25□□□□□ -1.412e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.25□□□□□ -1.412e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.22□□□□□ -1.412e-6■□□□□ 10.1
TRA2AQ13595 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.424e-19■□□□□ 10.1
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