Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 NEDD4L-201ENST00000256830 2920 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.978e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ANGEL1-205ENST00000557179 1427 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-9■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 GATAD2A-209ENST00000448576 271 ntTSL 326.3■■□□□ 1.84e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 RNF144A-205ENST00000467276 900 ntTSL 324.89■■□□□ 1.583e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SURF1-203ENST00000463965 493 ntTSL 324.83■■□□□ 1.573e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-279ENST00000515529 340 ntTSL 424.7■■□□□ 1.546e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.433e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.433e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)22.85■■□□□ 1.253e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)22.85■■□□□ 1.253e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.234e-10■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 UBTF-214ENST00000537550 1085 ntTSL 222.43■■□□□ 1.183e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.163e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 GNPTG-205ENST00000527168 1317 ntTSL 522.04■■□□□ 1.124e-10■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 LIMK2-206ENST00000462625 1042 ntTSL 221.86■■□□□ 1.091e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.083e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ARPC1B-218ENST00000484375 785 ntTSL 321.63■■□□□ 1.053e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.053e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ARPC1B-204ENST00000418347 563 ntTSL 421.58■■□□□ 1.053e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 GNPTG-207ENST00000529110 552 ntTSL 220.37■□□□□ 0.854e-10■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 GNPTG-208ENST00000529957 922 ntTSL 520.24■□□□□ 0.834e-10■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 GNPTG-209ENST00000534197 420 ntTSL 320.24■□□□□ 0.834e-10■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-212ENST00000486072 568 ntTSL 320.13■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.813e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-228ENST00000584074 625 ntTSL 320.03■□□□□ 0.83e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 GNPTG-206ENST00000527876 550 ntTSL 420.02■□□□□ 0.84e-10■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 FAM135A-213ENST00000508844 595 ntTSL 319.99■□□□□ 0.793e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 FAM135A-215ENST00000515280 546 ntTSL 519.89■□□□□ 0.773e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.753e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 FAM135A-216ENST00000515323 1926 ntTSL 519.71■□□□□ 0.753e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-255ENST00000504927 542 ntTSL 419.63■□□□□ 0.736e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-221ENST00000582240 578 ntTSL 419.61■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 FAM135A-212ENST00000507085 641 ntTSL 319.58■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ARPC1B-219ENST00000484600 582 ntTSL 219.21■□□□□ 0.673e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-222ENST00000507229 2582 ntTSL 219.18■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ARPC1B-207ENST00000431816 581 ntTSL 219.17■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ARPC1B-206ENST00000429246 348 ntTSL 519.17■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ARPC1B-203ENST00000417330 559 ntTSL 219.17■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ARPC1B-205ENST00000427217 545 ntTSL 319.17■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ARPC1B-213ENST00000458033 561 ntTSL 219.17■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ABCA7-204ENST00000524383 389 ntTSL 319.15■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ABCA7-215ENST00000531478 725 ntTSL 319.09■□□□□ 0.653e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ARPC1B-212ENST00000455009 580 ntTSL 319.08■□□□□ 0.643e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-274ENST00000513749 584 ntTSL 519.07■□□□□ 0.646e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-266ENST00000511510 547 ntTSL 519.07■□□□□ 0.646e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-259ENST00000507046 573 ntTSL 418.87■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-265ENST00000509639 615 ntTSL 418.87■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-229ENST00000514234 2562 ntTSL 218.82■□□□□ 0.64e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)18.75■□□□□ 0.593e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.583e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 IFT140-206ENST00000565298 4727 ntTSL 218.42■□□□□ 0.543e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SURF1-202ENST00000437995 813 ntTSL 518.4■□□□□ 0.543e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-280ENST00000515881 956 ntTSL 318.22■□□□□ 0.516e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-213ENST00000487053 3252 ntTSL 518.19■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.473e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SZRD1-205ENST00000472461 843 ntTSL 317.92■□□□□ 0.463e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 GNPTG-202ENST00000526820 572 ntTSL 317.89■□□□□ 0.454e-10■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 GALNT10-208ENST00000520647 4359 ntTSL 217.88■□□□□ 0.453e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.453e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-215ENST00000580182 582 ntTSL 317.62■□□□□ 0.413e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-241ENST00000460944 1248 ntTSL 517.51■□□□□ 0.396e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.383e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.344e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 517.2■□□□□ 0.343e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.344e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PSMB4-206ENST00000495288 986 ntTSL 217.09■□□□□ 0.333e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 FAM135A-214ENST00000514185 529 ntTSL 417.03■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.313e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-220ENST00000506488 2997 ntTSL 516.9■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ANAPC2-203ENST00000483432 793 ntTSL 216.72■□□□□ 0.273e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-243ENST00000482050 246 ntTSL 516.6■□□□□ 0.256e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-270ENST00000513043 604 ntTSL 416.6■□□□□ 0.256e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.183e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 BANP-209ENST00000439677 736 ntTSL 515.89■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.13e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-261ENST00000507901 562 ntTSL 415.6■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-227ENST00000592060 1952 ntTSL 1 (best)15.56■□□□□ 0.083e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-214ENST00000489635 3034 ntTSL 215.52■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-257ENST00000505534 673 ntTSL 415.49■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 CDK18-215ENST00000506215 435 ntTSL 1 (best)15.46■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 IQSEC1-202ENST00000473088 545 ntTSL 415.45■□□□□ 0.063e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 CSNK1D-212ENST00000580061 578 ntTSL 315.37■□□□□ 0.053e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ARPC1B-202ENST00000414376 572 ntTSL 415.36■□□□□ 0.053e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.053e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.043e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.043e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-230ENST00000412274 496 ntTSL 215.28■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 34.3
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