RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		37.92	■■■■□ 3.66
MIB2-231	ENST00000518681	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.48	■■■□□ 2.95
MIB2-231	ENST00000518681	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.86
MIB2-231	ENST00000518681	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.44	■■■□□ 2.78
MIB2-231	ENST00000518681	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
MIB2-231	ENST00000518681	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.76	■■■□□ 2.68
MIB2-231	ENST00000518681	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		31.76	■■■□□ 2.67
MIB2-231	ENST00000518681	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MIB2-231	ENST00000518681	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MIB2-231	ENST00000518681	HRC	P23327	699 aa		31.23	■■■□□ 2.59
MIB2-231	ENST00000518681	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.21	■■■□□ 2.59
MIB2-231	ENST00000518681	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
MIB2-231	ENST00000518681	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		30.7	■■■□□ 2.5
MIB2-231	ENST00000518681	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		30.66	■■■□□ 2.5
MIB2-231	ENST00000518681	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	30.59	■■■□□ 2.49
MIB2-231	ENST00000518681	SCRIB	Q14160	1630 aa		30.46	■■■□□ 2.47
MIB2-231	ENST00000518681	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.37	■■■□□ 2.45
MIB2-231	ENST00000518681	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	30.32	■■■□□ 2.44
MIB2-231	ENST00000518681	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.3	■■■□□ 2.44
MIB2-231	ENST00000518681	ABCC9	O60706	1549 aa		30.28	■■■□□ 2.44
MIB2-231	ENST00000518681	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		30.1	■■■□□ 2.41
MIB2-231	ENST00000518681	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		29.92	■■■□□ 2.38
MIB2-231	ENST00000518681	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.71	■■■□□ 2.35
MIB2-231	ENST00000518681	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
MIB2-231	ENST00000518681	WIZ	O95785	1651 aa		29.58	■■■□□ 2.33
MIB2-231	ENST00000518681	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	29.55	■■■□□ 2.32
MIB2-231	ENST00000518681	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	29.49	■■■□□ 2.31
MIB2-231	ENST00000518681	NACAD	O15069	1562 aa		29.4	■■■□□ 2.3
MIB2-231	ENST00000518681	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
MIB2-231	ENST00000518681	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.2	■■■□□ 2.27
MIB2-231	ENST00000518681	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
MIB2-231	ENST00000518681	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.1	■■■□□ 2.25
MIB2-231	ENST00000518681	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
MIB2-231	ENST00000518681	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	29.06	■■■□□ 2.24	1e-6	■■□□□ 11.7
MIB2-231	ENST00000518681	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
MIB2-231	ENST00000518681	SOGA1	O94964	1423 aa		29.01	■■■□□ 2.23
MIB2-231	ENST00000518681	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
MIB2-231	ENST00000518681	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MIB2-231	ENST00000518681	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.88	■■■□□ 2.21
MIB2-231	ENST00000518681	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
MIB2-231	ENST00000518681	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-231	ENST00000518681	SMARCA4	P51532	1647 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-231	ENST00000518681	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-231	ENST00000518681	SMARCA2	P51531	1590 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-231	ENST00000518681	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
MIB2-231	ENST00000518681	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.76	■■■□□ 2.19
MIB2-231	ENST00000518681	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
MIB2-231	ENST00000518681	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
MIB2-231	ENST00000518681	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MIB2-231	ENST00000518681	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		28.6	■■■□□ 2.17
MIB2-231	ENST00000518681	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.57	■■■□□ 2.16
MIB2-231	ENST00000518681	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
MIB2-231	ENST00000518681	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MIB2-231	ENST00000518681	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.43	■■■□□ 2.14
MIB2-231	ENST00000518681	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
MIB2-231	ENST00000518681	EEA1	Q15075	1411 aa		28.34	■■■□□ 2.13
MIB2-231	ENST00000518681	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.31	■■■□□ 2.12
MIB2-231	ENST00000518681	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
MIB2-231	ENST00000518681	APLP2	Q06481	763 aa		28.29	■■■□□ 2.12
MIB2-231	ENST00000518681	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		28.29	■■■□□ 2.12
MIB2-231	ENST00000518681	CLIP1	P30622	1438 aa		28.28	■■■□□ 2.12
MIB2-231	ENST00000518681	MIER1	Q8N108	512 aa		28.21	■■■□□ 2.11
MIB2-231	ENST00000518681	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.2	■■■□□ 2.1
MIB2-231	ENST00000518681	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.19	■■■□□ 2.1
MIB2-231	ENST00000518681	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
MIB2-231	ENST00000518681	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		28.1	■■■□□ 2.09
MIB2-231	ENST00000518681	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MIB2-231	ENST00000518681	ITGAE	P38570	1179 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MIB2-231	ENST00000518681	KIF21B	O75037	1637 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MIB2-231	ENST00000518681	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.07
MIB2-231	ENST00000518681	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MIB2-231	ENST00000518681	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MIB2-231	ENST00000518681	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MIB2-231	ENST00000518681	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
MIB2-231	ENST00000518681	PRX	Q9BXM0	1461 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MIB2-231	ENST00000518681	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
MIB2-231	ENST00000518681	CUX1	P39880	1505 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MIB2-231	ENST00000518681	P3H3	Q8IVL6	736 aa		27.56	■■■□□ 2
MIB2-231	ENST00000518681	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.52	■■■□□ 2
MIB2-231	ENST00000518681	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.48	■■□□□ 1.99
MIB2-231	ENST00000518681	KCNH8	Q96L42	1107 aa		27.45	■■□□□ 1.98
MIB2-231	ENST00000518681	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.44	■■□□□ 1.98
MIB2-231	ENST00000518681	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		27.43	■■□□□ 1.98
MIB2-231	ENST00000518681	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		27.42	■■□□□ 1.98
MIB2-231	ENST00000518681	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
MIB2-231	ENST00000518681	CUX2	O14529	1486 aa		27.37	■■□□□ 1.97
MIB2-231	ENST00000518681	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	27.35	■■□□□ 1.97
MIB2-231	ENST00000518681	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		27.34	■■□□□ 1.97
MIB2-231	ENST00000518681	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	27.34	■■□□□ 1.97
MIB2-231	ENST00000518681	NCAPD3	P42695	1498 aa		27.34	■■□□□ 1.97
MIB2-231	ENST00000518681	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		27.33	■■□□□ 1.97
MIB2-231	ENST00000518681	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		27.32	■■□□□ 1.96
MIB2-231	ENST00000518681	IGF1R	P08069	1367 aa		27.28	■■□□□ 1.96
MIB2-231	ENST00000518681	CFTR	P13569	1480 aa		27.28	■■□□□ 1.96
MIB2-231	ENST00000518681	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
MIB2-231	ENST00000518681	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.22	■■□□□ 1.95
MIB2-231	ENST00000518681	HMGXB3	Q12766	1538 aa		27.21	■■□□□ 1.95
MIB2-231	ENST00000518681	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		27.21	■■□□□ 1.95
MIB2-231	ENST00000518681	BCAN	Q96GW7	911 aa		27.2	■■□□□ 1.95

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