RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515529.4

DDR1-279, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene DDR1, Length 340 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-279ENST00000515529 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.47■■■■■ 7.59
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DDR1-279ENST00000515529 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.3■■■■■ 5.96
DDR1-279ENST00000515529 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.17■■■■■ 5.94
DDR1-279ENST00000515529 NACADO15069 1562 aa52.13■■■■■ 5.94
DDR1-279ENST00000515529 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.07■■■■■ 5.93
DDR1-279ENST00000515529 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.84■■■■■ 5.89
DDR1-279ENST00000515529 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.68■■■■■ 5.86
DDR1-279ENST00000515529 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.86■■■■■ 5.73
DDR1-279ENST00000515529 SCRIBQ14160 1630 aa50.67■■■■■ 5.7
DDR1-279ENST00000515529 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.65■■■■■ 5.7
DDR1-279ENST00000515529 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.47■■■■■ 5.67
DDR1-279ENST00000515529 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.05■■■■■ 5.6
DDR1-279ENST00000515529 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.44■■■■■ 5.51
DDR1-279ENST00000515529 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.19■■■■■ 5.47
DDR1-279ENST00000515529 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.95■■■■■ 5.43
DDR1-279ENST00000515529 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.64■■■■■ 5.38
DDR1-279ENST00000515529 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.45■■■■■ 5.35
DDR1-279ENST00000515529 SMARCA4P51532 1647 aa48.44■■■■■ 5.35
DDR1-279ENST00000515529 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.14■■■■■ 5.3
DDR1-279ENST00000515529 SMARCA2P51531 1590 aa48.13■■■■■ 5.3
DDR1-279ENST00000515529 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.13■■■■■ 5.3
DDR1-279ENST00000515529 NCAPD3P42695 1498 aa48.07■■■■■ 5.29
DDR1-279ENST00000515529 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.92■■■■■ 5.26
DDR1-279ENST00000515529 HMGXB3Q12766 1538 aa47.87■■■■■ 5.25
DDR1-279ENST00000515529 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.82■■■■■ 5.25
DDR1-279ENST00000515529 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.66■■■■■ 5.22
DDR1-279ENST00000515529 WIZO95785 1651 aa47.63■■■■■ 5.21
DDR1-279ENST00000515529 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.17■■■■■ 5.14
DDR1-279ENST00000515529 NESP48681 1621 aa46.87■■■■■ 5.09
DDR1-279ENST00000515529 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.81■■■■■ 5.08
DDR1-279ENST00000515529 ERCC6Q03468 1493 aa46.75■■■■■ 5.07
DDR1-279ENST00000515529 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
DDR1-279ENST00000515529 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.73■■■■■ 5.07
DDR1-279ENST00000515529 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.61■■■■■ 5.05
DDR1-279ENST00000515529 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.54■■■■■ 5.04
DDR1-279ENST00000515529 CFTRP13569 1480 aa46.45■■■■■ 5.03
DDR1-279ENST00000515529 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.31■■■■■ 5
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DDR1-279ENST00000515529 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.14■■■■■ 4.98
DDR1-279ENST00000515529 CUX2O14529 1486 aa46.11■■■■■ 4.97
DDR1-279ENST00000515529 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.09■■■■■ 4.97
DDR1-279ENST00000515529 PRDM2Q13029 1718 aa46.09■■■■■ 4.97
DDR1-279ENST00000515529 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.03■■■■■ 4.96
DDR1-279ENST00000515529 WDR62O43379 1518 aa45.82■■■■■ 4.92
DDR1-279ENST00000515529 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.67■■■■■ 4.9
DDR1-279ENST00000515529 ABCC8Q09428 1581 aa45.51■■■■■ 4.88
DDR1-279ENST00000515529 TOPBP1Q92547 1522 aa45.46■■■■■ 4.87
DDR1-279ENST00000515529 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.43■■■■■ 4.86
DDR1-279ENST00000515529 IFT140Q96RY7 1462 aa45.17■■■■■ 4.82
DDR1-279ENST00000515529 CUX1P39880 1505 aa45.16■■■■■ 4.82
DDR1-279ENST00000515529 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.08■■■■■ 4.81
DDR1-279ENST00000515529 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.02■■■■■ 4.8
DDR1-279ENST00000515529 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.01■■■■■ 4.8
DDR1-279ENST00000515529 SOGA1O94964 1423 aa44.94■■■■■ 4.79
DDR1-279ENST00000515529 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.89■■■■■ 4.78
DDR1-279ENST00000515529 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.89■■■■■ 4.78
DDR1-279ENST00000515529 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
DDR1-279ENST00000515529 TOP2BQ02880 1626 aa44.83■■■■■ 4.77
DDR1-279ENST00000515529 SYNJ1O43426 1573 aa44.82■■■■■ 4.76
DDR1-279ENST00000515529 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.81■■■■■ 4.76
DDR1-279ENST00000515529 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.73■■■■■ 4.75
DDR1-279ENST00000515529 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.69■■■■■ 4.742e-7■■■■■ 31.6
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DDR1-279ENST00000515529 WDR97A6NE52 1622 aa44.61■■■■■ 4.73
DDR1-279ENST00000515529 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.58■■■■■ 4.73
DDR1-279ENST00000515529 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.46■■■■■ 4.71
DDR1-279ENST00000515529 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.42■■■■■ 4.7
DDR1-279ENST00000515529 GRIN2BQ13224 1484 aa44.4■■■■■ 4.7
DDR1-279ENST00000515529 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.35■■■■■ 4.69
DDR1-279ENST00000515529 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.3■■■■■ 4.68
DDR1-279ENST00000515529 OSCARQ8IYS5 282 aa44.28■■■■■ 4.68
DDR1-279ENST00000515529 PBRM1Q86U86 1689 aa44.27■■■■■ 4.68
DDR1-279ENST00000515529 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.26■■■■■ 4.68
DDR1-279ENST00000515529 FBLN2P98095 1184 aa44.24■■■■■ 4.67
DDR1-279ENST00000515529 TRIM41Q8WV44 630 aa44.14■■■■■ 4.66
DDR1-279ENST00000515529 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.66
DDR1-279ENST00000515529 CHD1O14646 1710 aa44.13■■■■■ 4.65
DDR1-279ENST00000515529 SYNJ2O15056 1496 aa44.08■■■■■ 4.65
DDR1-279ENST00000515529 KIF27Q86VH2 1401 aa44.07■■■■■ 4.65
DDR1-279ENST00000515529 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.06■■■■■ 4.64
DDR1-279ENST00000515529 ADAMTS12P58397 1594 aa43.94■■■■■ 4.62
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DDR1-279ENST00000515529 IGF1RP08069 1367 aa43.8■■■■■ 4.6
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DDR1-279ENST00000515529 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.64■■■■■ 4.58
DDR1-279ENST00000515529 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.63■■■■■ 4.58
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DDR1-279ENST00000515529 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.6■■■■■ 4.57
DDR1-279ENST00000515529 NUP160Q12769 1436 aa43.56■■■■■ 4.56
DDR1-279ENST00000515529 CEP170Q5SW79 1584 aa43.54■■■■■ 4.56
DDR1-279ENST00000515529 ARHGEF11O15085 1522 aa43.49■■■■■ 4.55
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DDR1-279ENST00000515529 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.36■■■■■ 4.53
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DDR1-279ENST00000515529 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.27■■■■■ 4.52
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