RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.77■■■■□ 3.64
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USP12-201ENST00000282344 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.2■■■■□ 3.38
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USP12-201ENST00000282344 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.75■■■■□ 3.15
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USP12-201ENST00000282344 TRIM41Q8WV44 630 aa33.79■■■■□ 3
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USP12-201ENST00000282344 HRCP23327 699 aa33.47■■■□□ 2.95
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USP12-201ENST00000282344 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.42■■■□□ 2.94
USP12-201ENST00000282344 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
USP12-201ENST00000282344 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.32■■■□□ 2.92
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USP12-201ENST00000282344 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
USP12-201ENST00000282344 ITGAEP38570 1179 aa32.06■■■□□ 2.72
USP12-201ENST00000282344 ERICH6Q7L0X2 663 aa32.03■■■□□ 2.72
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USP12-201ENST00000282344 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.28■■■□□ 2.6
USP12-201ENST00000282344 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
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USP12-201ENST00000282344 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.27■■■□□ 2.6
USP12-201ENST00000282344 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
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USP12-201ENST00000282344 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.17■■■□□ 2.58
USP12-201ENST00000282344 NEUROD1Q13562 356 aa31.11■■■□□ 2.57
USP12-201ENST00000282344 BCANQ96GW7 911 aa31.04■■■□□ 2.56
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USP12-201ENST00000282344 TRIM52Q96A61 297 aa30.77■■■□□ 2.52
USP12-201ENST00000282344 ANP32CO43423 234 aa30.71■■■□□ 2.51
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USP12-201ENST00000282344 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.57■■■□□ 2.48
USP12-201ENST00000282344 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.56■■■□□ 2.48
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USP12-201ENST00000282344 CEP162Q5TB80 1403 aa30.19■■■□□ 2.42
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USP12-201ENST00000282344 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.17■■■□□ 2.42
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USP12-201ENST00000282344 TONSLQ96HA7 1378 aa30.09■■■□□ 2.41
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USP12-201ENST00000282344 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.92■■■□□ 2.38
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USP12-201ENST00000282344 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.9■■■□□ 2.38
USP12-201ENST00000282344 EEA1Q15075 1411 aa29.9■■■□□ 2.38
USP12-201ENST00000282344 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.89■■■□□ 2.37
USP12-201ENST00000282344 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.86■■■□□ 2.37
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USP12-201ENST00000282344 MRS2Q9HD23 443 aa29.64■■■□□ 2.34
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USP12-201ENST00000282344 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.41■■■□□ 2.3
USP12-201ENST00000282344 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.38■■■□□ 2.29
USP12-201ENST00000282344 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.38■■■□□ 2.29
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