Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.622e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 TJP2-201ENST00000348208 4058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.012e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 XRCC5-206ENST00000460284 2962 ntTSL 1 (best)6.46□□□□□ -1.384e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 YARS-206ENST00000478828 1044 ntTSL 213.87□□□□□ -0.193e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 YARS-208ENST00000487404 2197 ntTSL 212.56□□□□□ -0.43e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.191e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 CKB-207ENST00000554282 735 ntTSL 225.46■■□□□ 1.671e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 521.89■■□□□ 1.091e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 CKB-202ENST00000553528 1170 ntTSL 221.04■□□□□ 0.961e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 CKB-210ENST00000554989 625 ntTSL 219.56■□□□□ 0.721e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.068e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.832e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 EIF4A3-207ENST00000576547 553 ntTSL 323.76■■□□□ 1.391e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.621e-8■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 DDB1-206ENST00000535283 1220 ntTSL 212.1□□□□□ -0.476e-9■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.714e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.164e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 LAP3-208ENST00000512397 689 ntTSL 219.79■□□□□ 0.762e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 CAP1-215ENST00000446031 273 ntTSL 313.12□□□□□ -0.315e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 ACTN4-210ENST00000588618 1729 ntTSL 1 (best)28.02■■■□□ 2.082e-10■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 TOM1-212ENST00000456128 1133 ntTSL 519.43■□□□□ 0.72e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 TOM1-215ENST00000491987 852 ntTSL 518.56■□□□□ 0.562e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 DDB1-223ENST00000543658 571 ntTSL 414.74□□□□□ -0.052e-8■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.028e-10■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.78e-10■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.28e-10■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.298e-10■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.338e-10■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.675e-13■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 ETFB-202ENST00000354232 3551 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.435e-13■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 AARS-207ENST00000569825 871 ntTSL 221.28■■□□□ 12e-8■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 PAICS-203ENST00000504188 491 ntTSL 226.34■■□□□ 1.812e-15■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 PAICS-206ENST00000510584 557 ntTSL 213.5□□□□□ -0.252e-15■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 TYMS-205ENST00000581920 886 ntTSL 59.41□□□□□ -0.94e-8■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.992e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.912e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.832e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.472e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.392e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.382e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.262e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.172e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.618e-7■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.328e-7■■□□□ 14.1
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G3BP1Q13283 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.571e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-6■■□□□ 14.1
G3BP1Q13283 ACSS3-205ENST00000548387 741 ntTSL 29.85□□□□□ -0.836e-10■■□□□ 14.1
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G3BP1Q13283 TRAP1-209ENST00000574175 535 ntTSL 520.4■□□□□ 0.861e-6■■□□□ 14
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G3BP1Q13283 KDM5C-214ENST00000497100 1403 ntTSL 522.57■■□□□ 1.27e-7■■□□□ 14
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G3BP1Q13283 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.737e-7■■□□□ 14
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G3BP1Q13283 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.617e-7■■□□□ 14
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G3BP1Q13283 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.017e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.037e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 EXT2-201ENST00000343631 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.097e-7■■□□□ 14
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G3BP1Q13283 SEM1-204ENST00000417009 350 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.427e-7■■□□□ 14
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G3BP1Q13283 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.477e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 STAT3-204ENST00000462269 698 ntTSL 211.67□□□□□ -0.547e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SEM1-210ENST00000488005 775 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.557e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 STAT3-208ENST00000491272 725 ntTSL 211.48□□□□□ -0.577e-7■■□□□ 14
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G3BP1Q13283 KDM5C-209ENST00000465402 720 ntTSL 311.22□□□□□ -0.617e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 EXT2-203ENST00000395673 3454 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.647e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SEM1-223ENST00000623498 582 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.647e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SEM1-203ENST00000413065 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.77e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SEM1-224ENST00000623693 729 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.717e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SNRK-206ENST00000468628 470 ntTSL 310.18□□□□□ -0.787e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SEM1-207ENST00000466986 507 ntTSL 29.41□□□□□ -0.97e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SEM1-219ENST00000618105 544 ntTSL 26.23□□□□□ -1.417e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SEM1-217ENST00000617133 591 ntTSL 25.08□□□□□ -1.67e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SEM1-220ENST00000619259 462 ntTSL 25.08□□□□□ -1.67e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SNRK-207ENST00000481892 511 ntTSL 34.66□□□□□ -1.667e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 MYL12A-203ENST00000577510 567 ntTSL 23.44□□□□□ -1.867e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SEM1-209ENST00000482389 2773 ntTSL 22.28□□□□□ -2.047e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 KIAA0100-208ENST00000579924 477 ntTSL 35.26□□□□□ -1.571e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.429e-9■■□□□ 14
G3BP1Q13283 XPO5-206ENST00000455285 758 ntTSL 313.36□□□□□ -0.274e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 XPO5-209ENST00000488195 868 ntTSL 411.45□□□□□ -0.584e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 XPO5-207ENST00000455854 3629 ntTSL 210.25□□□□□ -0.774e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 XPO5-208ENST00000486936 601 ntTSL 39.59□□□□□ -0.874e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 TMEM214-211ENST00000475258 927 ntTSL 215.83■□□□□ 0.129e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.378e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 GOT2-201ENST00000245206 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.118e-7■■□□□ 14
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