RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588618.5

ACTN4-210, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTN4, Length 1,729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-210ENST00000588618 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.03■■■■■ 6.08
ACTN4-210ENST00000588618 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.64■■■■■ 5.06
ACTN4-210ENST00000588618 ABCC9O60706 1549 aa44.7■■■■■ 4.75
ACTN4-210ENST00000588618 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
ACTN4-210ENST00000588618 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.93■■■■■ 4.62
ACTN4-210ENST00000588618 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.85■■■■■ 4.61
ACTN4-210ENST00000588618 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.6■■■■■ 4.57
ACTN4-210ENST00000588618 NACADO15069 1562 aa43.55■■■■■ 4.56
ACTN4-210ENST00000588618 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.36■■■■■ 4.53
ACTN4-210ENST00000588618 SCRIBQ14160 1630 aa42.75■■■■■ 4.43
ACTN4-210ENST00000588618 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.66■■■■■ 4.42
ACTN4-210ENST00000588618 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.6■■■■■ 4.41
ACTN4-210ENST00000588618 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.15■■■■■ 4.34
ACTN4-210ENST00000588618 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.95■■■■■ 4.31
ACTN4-210ENST00000588618 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.29■■■■■ 4.2
ACTN4-210ENST00000588618 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
ACTN4-210ENST00000588618 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.96■■■■■ 4.15
ACTN4-210ENST00000588618 SMARCA4P51532 1647 aa40.95■■■■■ 4.15
ACTN4-210ENST00000588618 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
ACTN4-210ENST00000588618 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
ACTN4-210ENST00000588618 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
ACTN4-210ENST00000588618 WIZO95785 1651 aa40.6■■■■■ 4.09
ACTN4-210ENST00000588618 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.5■■■■■ 4.07
ACTN4-210ENST00000588618 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.48■■■■■ 4.07
ACTN4-210ENST00000588618 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.43■■■■■ 4.06
ACTN4-210ENST00000588618 SMARCA2P51531 1590 aa40.36■■■■■ 4.05
ACTN4-210ENST00000588618 NCAPD3P42695 1498 aa40.19■■■■■ 4.02
ACTN4-210ENST00000588618 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
ACTN4-210ENST00000588618 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.13■■■■■ 4.01
ACTN4-210ENST00000588618 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
ACTN4-210ENST00000588618 HMGXB3Q12766 1538 aa40.11■■■■■ 4.01
ACTN4-210ENST00000588618 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.7■■■■□ 3.95
ACTN4-210ENST00000588618 CFTRP13569 1480 aa39.1■■■■□ 3.85
ACTN4-210ENST00000588618 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.08■■■■□ 3.85
ACTN4-210ENST00000588618 NESP48681 1621 aa39.05■■■■□ 3.84
ACTN4-210ENST00000588618 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.96■■■■□ 3.83
ACTN4-210ENST00000588618 PRDM2Q13029 1718 aa38.96■■■■□ 3.83
ACTN4-210ENST00000588618 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.68■■■■□ 3.78
ACTN4-210ENST00000588618 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.67■■■■□ 3.78
ACTN4-210ENST00000588618 ABCC8Q09428 1581 aa38.65■■■■□ 3.78
ACTN4-210ENST00000588618 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.62■■■■□ 3.77
ACTN4-210ENST00000588618 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.54■■■■□ 3.76
ACTN4-210ENST00000588618 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.49■■■■□ 3.75
ACTN4-210ENST00000588618 ERCC6Q03468 1493 aa38.46■■■■□ 3.75
ACTN4-210ENST00000588618 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.42■■■■□ 3.74
ACTN4-210ENST00000588618 SYNJ1O43426 1573 aa38.38■■■■□ 3.74
ACTN4-210ENST00000588618 CUX1P39880 1505 aa38.35■■■■□ 3.73
ACTN4-210ENST00000588618 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
ACTN4-210ENST00000588618 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.26■■■■□ 3.72
ACTN4-210ENST00000588618 TOP2BQ02880 1626 aa38.26■■■■□ 3.72
ACTN4-210ENST00000588618 TRIM41Q8WV44 630 aa38.22■■■■□ 3.71
ACTN4-210ENST00000588618 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.22■■■■□ 3.71
ACTN4-210ENST00000588618 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.21■■■■□ 3.71
ACTN4-210ENST00000588618 TOPBP1Q92547 1522 aa38.2■■■■□ 3.71
ACTN4-210ENST00000588618 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
ACTN4-210ENST00000588618 WDR62O43379 1518 aa38.09■■■■□ 3.69
ACTN4-210ENST00000588618 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.02■■■■□ 3.68
ACTN4-210ENST00000588618 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
ACTN4-210ENST00000588618 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.82■■■■□ 3.64
ACTN4-210ENST00000588618 CUX2O14529 1486 aa37.8■■■■□ 3.64
ACTN4-210ENST00000588618 SOGA1O94964 1423 aa37.76■■■■□ 3.63
ACTN4-210ENST00000588618 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
ACTN4-210ENST00000588618 WDR97A6NE52 1622 aa37.71■■■■□ 3.63
ACTN4-210ENST00000588618 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.68■■■■□ 3.62
ACTN4-210ENST00000588618 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.66■■■■□ 3.62
ACTN4-210ENST00000588618 IFT140Q96RY7 1462 aa37.61■■■■□ 3.61
ACTN4-210ENST00000588618 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
ACTN4-210ENST00000588618 KIF27Q86VH2 1401 aa37.49■■■■□ 3.59
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
ACTN4-210ENST00000588618 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.48■■■■□ 3.59
ACTN4-210ENST00000588618 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
ACTN4-210ENST00000588618 EEA1Q15075 1411 aa37.43■■■■□ 3.58
ACTN4-210ENST00000588618 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.38■■■■□ 3.573e-8■■■■■ 53.1
ACTN4-210ENST00000588618 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
ACTN4-210ENST00000588618 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.36■■■■□ 3.57
ACTN4-210ENST00000588618 PBRM1Q86U86 1689 aa37.29■■■■□ 3.56
ACTN4-210ENST00000588618 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.29■■■■□ 3.56
ACTN4-210ENST00000588618 IGF1RP08069 1367 aa37.27■■■■□ 3.56
ACTN4-210ENST00000588618 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.2■■■■□ 3.55
ACTN4-210ENST00000588618 GRIN2BQ13224 1484 aa37.17■■■■□ 3.54
ACTN4-210ENST00000588618 PRXQ9BXM0 1461 aa37.11■■■■□ 3.53
ACTN4-210ENST00000588618 CUL7Q14999 1698 aa37.09■■■■□ 3.53
ACTN4-210ENST00000588618 KIF21BO75037 1637 aa37.08■■■■□ 3.53
ACTN4-210ENST00000588618 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.04■■■■□ 3.52
ACTN4-210ENST00000588618 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.04■■■■□ 3.52
ACTN4-210ENST00000588618 ADAMTS12P58397 1594 aa37.03■■■■□ 3.52
ACTN4-210ENST00000588618 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.02■■■■□ 3.52
ACTN4-210ENST00000588618 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.01■■■■□ 3.51
ACTN4-210ENST00000588618 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.01■■■■□ 3.51
ACTN4-210ENST00000588618 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
ACTN4-210ENST00000588618 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.92■■■■□ 3.5
ACTN4-210ENST00000588618 GOLGA3Q08378 1498 aa36.92■■■■□ 3.5
ACTN4-210ENST00000588618 SYNJ2O15056 1496 aa36.81■■■■□ 3.48
ACTN4-210ENST00000588618 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
ACTN4-210ENST00000588618 FBLN2P98095 1184 aa36.78■■■■□ 3.48
ACTN4-210ENST00000588618 GRIN2AQ12879 1464 aa36.74■■■■□ 3.47
ACTN4-210ENST00000588618 CHD1O14646 1710 aa36.73■■■■□ 3.47
ACTN4-210ENST00000588618 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
ACTN4-210ENST00000588618 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.64■■■■□ 3.46
ACTN4-210ENST00000588618 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.62■■■■□ 3.45
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