RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415017.1

CNN3-203, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-203ENST00000415017 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.61■■■□□ 2.65
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CNN3-203ENST00000415017 ABCC9O60706 1549 aa26.62■■□□□ 1.85
CNN3-203ENST00000415017 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CNN3-203ENST00000415017 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.27■■□□□ 1.8
CNN3-203ENST00000415017 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.19■■□□□ 1.78
CNN3-203ENST00000415017 NACADO15069 1562 aa26.07■■□□□ 1.76
CNN3-203ENST00000415017 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.94■■□□□ 1.74
CNN3-203ENST00000415017 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.89■■□□□ 1.74
CNN3-203ENST00000415017 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.48■■□□□ 1.67
CNN3-203ENST00000415017 SCRIBQ14160 1630 aa25.37■■□□□ 1.65
CNN3-203ENST00000415017 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.22■■□□□ 1.63
CNN3-203ENST00000415017 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.07■■□□□ 1.6
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CNN3-203ENST00000415017 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.52■■□□□ 1.52
CNN3-203ENST00000415017 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CNN3-203ENST00000415017 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CNN3-203ENST00000415017 SMARCA4P51532 1647 aa24.42■■□□□ 1.5
CNN3-203ENST00000415017 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.35■■□□□ 1.49
CNN3-203ENST00000415017 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CNN3-203ENST00000415017 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.25■■□□□ 1.47
CNN3-203ENST00000415017 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.2■■□□□ 1.46
CNN3-203ENST00000415017 WIZO95785 1651 aa24.12■■□□□ 1.45
CNN3-203ENST00000415017 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.12■■□□□ 1.45
CNN3-203ENST00000415017 SMARCA2P51531 1590 aa24.12■■□□□ 1.45
CNN3-203ENST00000415017 NCAPD3P42695 1498 aa24.07■■□□□ 1.44
CNN3-203ENST00000415017 HMGXB3Q12766 1538 aa24■■□□□ 1.43
CNN3-203ENST00000415017 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24■■□□□ 1.43
CNN3-203ENST00000415017 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
CNN3-203ENST00000415017 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
CNN3-203ENST00000415017 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CNN3-203ENST00000415017 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.59■■□□□ 1.37
CNN3-203ENST00000415017 CFTRP13569 1480 aa23.36■■□□□ 1.33
CNN3-203ENST00000415017 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.33■■□□□ 1.33
CNN3-203ENST00000415017 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.33■■□□□ 1.33
CNN3-203ENST00000415017 PRDM2Q13029 1718 aa23.3■■□□□ 1.32
CNN3-203ENST00000415017 NESP48681 1621 aa23.25■■□□□ 1.31
CNN3-203ENST00000415017 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.08■■□□□ 1.28
CNN3-203ENST00000415017 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.05■■□□□ 1.28
CNN3-203ENST00000415017 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.04■■□□□ 1.28
CNN3-203ENST00000415017 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.95■■□□□ 1.26
CNN3-203ENST00000415017 ABCC8Q09428 1581 aa22.86■■□□□ 1.25
CNN3-203ENST00000415017 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CNN3-203ENST00000415017 ERCC6Q03468 1493 aa22.85■■□□□ 1.25
CNN3-203ENST00000415017 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.83■■□□□ 1.25
CNN3-203ENST00000415017 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CNN3-203ENST00000415017 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.82■■□□□ 1.24
CNN3-203ENST00000415017 CUX1P39880 1505 aa22.81■■□□□ 1.24
CNN3-203ENST00000415017 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
CNN3-203ENST00000415017 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.8■■□□□ 1.24
CNN3-203ENST00000415017 WDR62O43379 1518 aa22.8■■□□□ 1.24
CNN3-203ENST00000415017 TOP2BQ02880 1626 aa22.79■■□□□ 1.24
CNN3-203ENST00000415017 SYNJ1O43426 1573 aa22.79■■□□□ 1.24
CNN3-203ENST00000415017 TOPBP1Q92547 1522 aa22.77■■□□□ 1.24
CNN3-203ENST00000415017 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.71■■□□□ 1.23
CNN3-203ENST00000415017 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CNN3-203ENST00000415017 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.6■■□□□ 1.21
CNN3-203ENST00000415017 CUX2O14529 1486 aa22.58■■□□□ 1.2
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CNN3-203ENST00000415017 TRIM41Q8WV44 630 aa22.54■■□□□ 1.2
CNN3-203ENST00000415017 WDR97A6NE52 1622 aa22.52■■□□□ 1.2
CNN3-203ENST00000415017 SOGA1O94964 1423 aa22.48■■□□□ 1.19
CNN3-203ENST00000415017 IFT140Q96RY7 1462 aa22.47■■□□□ 1.19
CNN3-203ENST00000415017 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.47■■□□□ 1.19
CNN3-203ENST00000415017 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.46■■□□□ 1.19
CNN3-203ENST00000415017 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.36■■□□□ 1.17
CNN3-203ENST00000415017 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CNN3-203ENST00000415017 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CNN3-203ENST00000415017 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.28■■□□□ 1.16
CNN3-203ENST00000415017 KIF27Q86VH2 1401 aa22.28■■□□□ 1.16
CNN3-203ENST00000415017 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CNN3-203ENST00000415017 EEA1Q15075 1411 aa22.25■■□□□ 1.15
CNN3-203ENST00000415017 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.24■■□□□ 1.15
CNN3-203ENST00000415017 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
CNN3-203ENST00000415017 PBRM1Q86U86 1689 aa22.23■■□□□ 1.15
CNN3-203ENST00000415017 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.21■■□□□ 1.15
CNN3-203ENST00000415017 GRIN2BQ13224 1484 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-203ENST00000415017 IGF1RP08069 1367 aa22.17■■□□□ 1.14
CNN3-203ENST00000415017 CUL7Q14999 1698 aa22.11■■□□□ 1.13
CNN3-203ENST00000415017 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.09■■□□□ 1.13
CNN3-203ENST00000415017 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CNN3-203ENST00000415017 PRXQ9BXM0 1461 aa22.08■■□□□ 1.12
CNN3-203ENST00000415017 ADAMTS12P58397 1594 aa22.07■■□□□ 1.12
CNN3-203ENST00000415017 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.04■■□□□ 1.12
CNN3-203ENST00000415017 KIF21BO75037 1637 aa22.03■■□□□ 1.12
CNN3-203ENST00000415017 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.01■■□□□ 1.11
CNN3-203ENST00000415017 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.99■■□□□ 1.11
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CNN3-203ENST00000415017 CHD1O14646 1710 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-203ENST00000415017 GRIN2AQ12879 1464 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-203ENST00000415017 GOLGA3Q08378 1498 aa21.86■■□□□ 1.09
CNN3-203ENST00000415017 NUP160Q12769 1436 aa21.82■■□□□ 1.08
CNN3-203ENST00000415017 CEP170Q5SW79 1584 aa21.8■■□□□ 1.08
CNN3-203ENST00000415017 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CNN3-203ENST00000415017 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.79■■□□□ 1.08
CNN3-203ENST00000415017 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-203ENST00000415017 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.72■■□□□ 1.07
CNN3-203ENST00000415017 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.71■■□□□ 1.07
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