Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 CCHCR1-225ENST00000507892 479 ntTSL 421.05■□□□□ 0.968e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-210ENST00000455992 908 ntTSL 521■□□□□ 0.958e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.98e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-217ENST00000503420 580 ntTSL 420.14■□□□□ 0.818e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.68e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CD58-204ENST00000464088 874 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.588e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-202ENST00000395656 1540 ntTSL 218.66■□□□□ 0.588e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-206ENST00000448141 664 ntTSL 318.57■□□□□ 0.568e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.551e-20■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-209ENST00000455279 676 ntTSL 418.31■□□□□ 0.528e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-224ENST00000507829 589 ntTSL 418.25■□□□□ 0.518e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.58e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-226ENST00000508683 567 ntTSL 418.09■□□□□ 0.498e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-207ENST00000448162 699 ntTSL 517.93■□□□□ 0.468e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-230ENST00000513222 511 ntTSL 417.73■□□□□ 0.438e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.438e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-204ENST00000426967 838 ntTSL 217.39■□□□□ 0.378e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-218ENST00000503934 560 ntTSL 517.39■□□□□ 0.378e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 C21orf59-206ENST00000440966 1082 ntTSL 317.22■□□□□ 0.358e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-223ENST00000507751 588 ntTSL 216.82■□□□□ 0.288e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 EXOSC10-209ENST00000485606 459 ntTSL 316.69■□□□□ 0.268e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 RIOK1-203ENST00000475351 960 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.238e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 GGNBP2-214ENST00000616019 695 ntTSL 216.32■□□□□ 0.28e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 C21orf59-202ENST00000300260 1243 ntTSL 216.2■□□□□ 0.188e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.188e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.168e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-216ENST00000502557 662 ntTSL 316.05■□□□□ 0.168e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-221ENST00000507226 544 ntTSL 416.05■□□□□ 0.168e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-213ENST00000520472 912 ntTSL 515.8■□□□□ 0.128e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.118e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CDK11A-215ENST00000478901 931 ntTSL 515.53■□□□□ 0.088e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CACUL1-206ENST00000493518 3217 ntTSL 1 (best)15.17■□□□□ 0.022e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 RNPS1-206ENST00000562205 2223 ntTSL 215.07■□□□□ 04e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-221ENST00000522458 623 ntTSL 415.03■□□□□ -08e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CDK11A-212ENST00000468397 836 ntTSL 215.01□□□□□ -0.018e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.018e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.028e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 FPGS-205ENST00000423577 677 ntTSL 514.8□□□□□ -0.048e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 SLC25A13-203ENST00000472162 568 ntTSL 414.79□□□□□ -0.048e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.068e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 FAM160B2-206ENST00000474579 431 ntTSL 314.69□□□□□ -0.068e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CDK11A-210ENST00000463652 1028 ntTSL 514.51□□□□□ -0.098e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-208ENST00000519211 620 ntTSL 314.45□□□□□ -0.18e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.18e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.18e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.18e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-206ENST00000518775 920 ntTSL 514.3□□□□□ -0.128e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 FKBP4-206ENST00000543769 425 ntTSL 513.99□□□□□ -0.178e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.188e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-203ENST00000517568 692 ntTSL 413.64□□□□□ -0.238e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CDK11A-219ENST00000491311 626 ntTSL 513.48□□□□□ -0.258e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-229ENST00000512418 565 ntTSL 413.46□□□□□ -0.258e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.278e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 C21orf59-208ENST00000483315 1872 ntTSL 213.3□□□□□ -0.288e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-222ENST00000522644 1027 ntTSL 513.18□□□□□ -0.38e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.358e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-222ENST00000507459 582 ntTSL 512.83□□□□□ -0.368e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-219ENST00000521729 1068 ntTSL 212.77□□□□□ -0.378e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-208ENST00000432893 1014 ntTSL 512.62□□□□□ -0.398e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-227ENST00000508852 589 ntTSL 412.57□□□□□ -0.48e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 FPGS-214ENST00000479375 690 ntTSL 512.55□□□□□ -0.48e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 C21orf59-204ENST00000425336 873 ntTSL 212.28□□□□□ -0.448e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-212ENST00000519903 648 ntTSL 412.22□□□□□ -0.458e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.478e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 NPRL2-215ENST00000492805 786 ntTSL 211.91□□□□□ -0.58e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 RNPS1-213ENST00000565243 3337 ntTSL 211.8□□□□□ -0.524e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.548e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LARS-213ENST00000511505 1089 ntTSL 511.66□□□□□ -0.548e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-205ENST00000428174 470 ntTSL 311.58□□□□□ -0.568e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.588e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 METTL4-203ENST00000574538 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.638e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 RPN2-208ENST00000470352 511 ntTSL 211□□□□□ -0.651e-8■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-228ENST00000610773 1905 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.668e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-215ENST00000488920 715 ntTSL 310.86□□□□□ -0.678e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-208ENST00000638422 1776 ntTSL 510.77□□□□□ -0.688e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-215ENST00000492129 1835 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.698e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CDK11A-221ENST00000495016 286 ntTSL 210.67□□□□□ -0.78e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-219ENST00000505392 547 ntTSL 410.63□□□□□ -0.718e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-202ENST00000340169 1485 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.718e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 C21orf59-205ENST00000431599 417 ntTSL 310.55□□□□□ -0.728e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 RPN2-204ENST00000437329 520 ntTSL 310.49□□□□□ -0.731e-8■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 KRBA1-206ENST00000496080 654 ntTSL 310.41□□□□□ -0.748e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-220ENST00000506831 861 ntTSL 210.39□□□□□ -0.758e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 URI1-211ENST00000575242 1032 ntTSL 210.36□□□□□ -0.758e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-212ENST00000638837 1757 ntTSL 510.34□□□□□ -0.758e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 MTF2-204ENST00000468457 1038 ntTSL 510.17□□□□□ -0.788e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-203ENST00000412418 968 ntTSL 510.09□□□□□ -0.798e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-226ENST00000575337 827 ntTSL 59.81□□□□□ -0.848e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 METTL4-201ENST00000319888 3601 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.848e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CALM2-206ENST00000482532 1891 ntTSL 29.76□□□□□ -0.858e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-222ENST00000574451 1019 ntTSL 39.7□□□□□ -0.868e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-204ENST00000414602 787 ntTSL 59.55□□□□□ -0.888e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-213ENST00000480060 601 ntTSL 39.47□□□□□ -0.898e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.98e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ARHGAP19-SLIT1-202ENST00000479633 1876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.98e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 METTL4-205ENST00000576251 1884 ntTSL 29.33□□□□□ -0.928e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CCHCR1-212ENST00000475684 786 ntTSL 59.21□□□□□ -0.948e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 DMXL1-203ENST00000503802 1835 ntTSL 1 (best)9.05□□□□□ -0.968e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-216ENST00000640349 969 ntTSL 59.04□□□□□ -0.968e-6■□□□□ 8.7
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