RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483315.1

C21orf59-208, Transcript of UPF0769 protein C21orf59, humanhuman

TSL 2

Gene C21orf59, Length 1,872 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf59-208ENST00000483315 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.64■■■□□ 2.5
C21orf59-208ENST00000483315 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.28■■□□□ 1.8
C21orf59-208ENST00000483315 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
C21orf59-208ENST00000483315 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.6■■□□□ 1.69
C21orf59-208ENST00000483315 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.24■■□□□ 1.63
C21orf59-208ENST00000483315 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.23■■□□□ 1.63
C21orf59-208ENST00000483315 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
C21orf59-208ENST00000483315 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.69■■□□□ 1.54
C21orf59-208ENST00000483315 ABCC9O60706 1549 aa24.5■■□□□ 1.51
C21orf59-208ENST00000483315 SCRIBQ14160 1630 aa24.42■■□□□ 1.5
C21orf59-208ENST00000483315 NACADO15069 1562 aa24.38■■□□□ 1.49
C21orf59-208ENST00000483315 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.18■■□□□ 1.46
C21orf59-208ENST00000483315 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
C21orf59-208ENST00000483315 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.02■■□□□ 1.44
C21orf59-208ENST00000483315 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.88■■□□□ 1.41
C21orf59-208ENST00000483315 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.77■■□□□ 1.4
C21orf59-208ENST00000483315 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.64■■□□□ 1.37
C21orf59-208ENST00000483315 WIZO95785 1651 aa23.59■■□□□ 1.37
C21orf59-208ENST00000483315 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
C21orf59-208ENST00000483315 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.42■■□□□ 1.34
C21orf59-208ENST00000483315 SMARCA4P51532 1647 aa23.4■■□□□ 1.34
C21orf59-208ENST00000483315 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.37■■□□□ 1.33
C21orf59-208ENST00000483315 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
C21orf59-208ENST00000483315 TRIM41Q8WV44 630 aa23.31■■□□□ 1.32
C21orf59-208ENST00000483315 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
C21orf59-208ENST00000483315 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
C21orf59-208ENST00000483315 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.14■■□□□ 1.3
C21orf59-208ENST00000483315 SMARCA2P51531 1590 aa23.13■■□□□ 1.29
C21orf59-208ENST00000483315 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.05■■□□□ 1.28
C21orf59-208ENST00000483315 HRCP23327 699 aa23.01■■□□□ 1.27
C21orf59-208ENST00000483315 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
C21orf59-208ENST00000483315 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.91■■□□□ 1.26
C21orf59-208ENST00000483315 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.9■■□□□ 1.26
C21orf59-208ENST00000483315 ABCC8Q09428 1581 aa22.88■■□□□ 1.25
C21orf59-208ENST00000483315 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
C21orf59-208ENST00000483315 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.73■■□□□ 1.23
C21orf59-208ENST00000483315 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
C21orf59-208ENST00000483315 SOGA1O94964 1423 aa22.62■■□□□ 1.21
C21orf59-208ENST00000483315 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
C21orf59-208ENST00000483315 NCAPD3P42695 1498 aa22.57■■□□□ 1.2
C21orf59-208ENST00000483315 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.53■■□□□ 1.2
C21orf59-208ENST00000483315 HMGXB3Q12766 1538 aa22.52■■□□□ 1.2
C21orf59-208ENST00000483315 EEA1Q15075 1411 aa22.51■■□□□ 1.19
C21orf59-208ENST00000483315 SYNJ1O43426 1573 aa22.5■■□□□ 1.19
C21orf59-208ENST00000483315 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.45■■□□□ 1.19
C21orf59-208ENST00000483315 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
C21orf59-208ENST00000483315 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.37■■□□□ 1.17
C21orf59-208ENST00000483315 CEP162Q5TB80 1403 aa22.31■■□□□ 1.16
C21orf59-208ENST00000483315 TOP2BQ02880 1626 aa22.3■■□□□ 1.16
C21orf59-208ENST00000483315 GOLGA3Q08378 1498 aa22.28■■□□□ 1.16
C21orf59-208ENST00000483315 CFTRP13569 1480 aa22.25■■□□□ 1.15
C21orf59-208ENST00000483315 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.25■■□□□ 1.15
C21orf59-208ENST00000483315 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
C21orf59-208ENST00000483315 KIF21BO75037 1637 aa22.22■■□□□ 1.15
C21orf59-208ENST00000483315 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.2■■□□□ 1.14
C21orf59-208ENST00000483315 CUX1P39880 1505 aa22.16■■□□□ 1.14
C21orf59-208ENST00000483315 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.13■■□□□ 1.13
C21orf59-208ENST00000483315 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
C21orf59-208ENST00000483315 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.08■■□□□ 1.13
C21orf59-208ENST00000483315 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.06■■□□□ 1.12
C21orf59-208ENST00000483315 PRDM2Q13029 1718 aa22.04■■□□□ 1.12
C21orf59-208ENST00000483315 PRXQ9BXM0 1461 aa21.99■■□□□ 1.11
C21orf59-208ENST00000483315 CLIP1P30622 1438 aa21.98■■□□□ 1.11
C21orf59-208ENST00000483315 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.93■■□□□ 1.1
C21orf59-208ENST00000483315 KIF27Q86VH2 1401 aa21.93■■□□□ 1.1
C21orf59-208ENST00000483315 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
C21orf59-208ENST00000483315 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.87■■□□□ 1.09
C21orf59-208ENST00000483315 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.81■■□□□ 1.08
C21orf59-208ENST00000483315 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.8■■□□□ 1.08
C21orf59-208ENST00000483315 CUX2O14529 1486 aa21.78■■□□□ 1.08
C21orf59-208ENST00000483315 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
C21orf59-208ENST00000483315 IGF1RP08069 1367 aa21.77■■□□□ 1.07
C21orf59-208ENST00000483315 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
C21orf59-208ENST00000483315 NESP48681 1621 aa21.75■■□□□ 1.07
C21orf59-208ENST00000483315 ARAP1Q96P48 1450 aa21.73■■□□□ 1.07
C21orf59-208ENST00000483315 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.68■■□□□ 1.06
C21orf59-208ENST00000483315 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
C21orf59-208ENST00000483315 TOPBP1Q92547 1522 aa21.65■■□□□ 1.06
C21orf59-208ENST00000483315 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.64■■□□□ 1.05
C21orf59-208ENST00000483315 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.63■■□□□ 1.05
C21orf59-208ENST00000483315 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.63■■□□□ 1.05
C21orf59-208ENST00000483315 APLP2Q06481 763 aa21.62■■□□□ 1.05
C21orf59-208ENST00000483315 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.61■■□□□ 1.05
C21orf59-208ENST00000483315 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
C21orf59-208ENST00000483315 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.6■■□□□ 1.05
C21orf59-208ENST00000483315 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.59■■□□□ 1.05
C21orf59-208ENST00000483315 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
C21orf59-208ENST00000483315 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
C21orf59-208ENST00000483315 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
C21orf59-208ENST00000483315 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.47■■□□□ 1.03
C21orf59-208ENST00000483315 WDR97A6NE52 1622 aa21.43■■□□□ 1.02
C21orf59-208ENST00000483315 CUL7Q14999 1698 aa21.38■■□□□ 1.01
C21orf59-208ENST00000483315 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.38■■□□□ 1.01
C21orf59-208ENST00000483315 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.35■■□□□ 1.01
C21orf59-208ENST00000483315 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
C21orf59-208ENST00000483315 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
C21orf59-208ENST00000483315 MAP3K1Q13233 1512 aa21.33■■□□□ 1
C21orf59-208ENST00000483315 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.3■■□□□ 1
C21orf59-208ENST00000483315 TIAM1Q13009 1591 aa21.29■■□□□ 1
C21orf59-208ENST00000483315 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
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